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乌珠穆沁绵羊MEF2B,RIPK2,CAMKMT基因多态性与生长性状的关联分析

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
英文缩略表第13-14页
第一章 引言第14-25页
    1.1 乌珠穆沁绵羊品种特征第14页
    1.2 全基因组关联分析(GWAS)研究进展第14-17页
        1.2.1 牛GWAS研究进展第15页
        1.2.2 猪GWAS研究进展第15-16页
        1.2.3 鸡GWAS研究进展第16页
        1.2.4 绵羊GWAS研究进展第16-17页
    1.3 绵羊生长性状候选基因研究进展第17-21页
        1.3.1 候选基因MEF2B研究进展第17-20页
        1.3.2 候选基因RIPK2研究进展第20-21页
        1.3.3 候选基因CAMKMT研究进展第21页
    1.4 SNP分子标记检测方法第21-23页
        1.4.1 以结构为基础的检测方法第22页
        1.4.2 Taqman荧光探针法第22页
        1.4.3 SNaPshot测序方法第22-23页
        1.4.4 质谱分型法简介第23页
    1.5 试验目的及意义第23-25页
第二章 材料与方法第25-34页
    2.1 试验材料第25-27页
        2.1.1 试验动物第25页
        2.1.2 乌珠穆沁绵羊的生长性状第25页
        2.1.3 试验常用试剂第25-26页
        2.1.4 试验主要使用设备第26页
        2.1.5 主要分子生物学软件第26-27页
    2.2 试验方法第27-29页
        2.2.1 血液基因组DNA提取及质量检测第27页
        2.2.2 混池DNA PCR扩增引物设计第27-28页
        2.2.3 DNA混合池构建和PCR扩增第28-29页
        2.2.4 PCR产物测序并寻找SNP位点第29页
    2.3 质谱分型第29-31页
        2.3.1 PCR反应及产物纯化第29-30页
        2.3.2 SAP纯化第30页
        2.3.3 单碱基延伸反应第30-31页
        2.3.4 产物纯化第31页
        2.3.5 输出分型数据第31页
    2.4 数据处理与统计分析第31-33页
        2.4.1 等位基因频率和基因型频率第31-32页
        2.4.2 纯合度和杂合度第32页
        2.4.3 Hardy-Weinberg平衡检验第32-33页
        2.4.4 多态信息含量第33页
        2.4.5 多态位点与生长性状的关联分析第33页
    2.5 生物信息学分析第33-34页
第三章 试验结果第34-71页
    3.1 绵羊血液基因组DNA提取结果第34页
    3.2 乌珠穆沁绵羊MEF2B基因多态性与生长性状的关联分析结果第34-38页
        3.2.1 乌珠穆沁绵羊MEF2B基因多态位点筛选结果第34-35页
        3.2.2 乌珠穆沁绵羊MEF2B基因质谱分型结果结果第35页
        3.2.3 乌珠穆沁绵羊MEF2B基因多态性与生长性状的关联分析结果第35-38页
    3.3 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态性与生长性状的关联分析第38-53页
        3.3.1 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态位点筛选第38-39页
        3.3.2 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态位点质谱分型结果第39-41页
        3.3.3 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因群体遗传学参数结果第41-43页
        3.3.4 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态性与生长性状的关联分析结果第43-47页
        3.3.5 连锁不平衡分析及单倍型构建结果第47页
        3.3.6 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因合并基因型与生长性状的关联分析结果第47-51页
        3.3.7 生物信息学分析结果第51-53页
    3.4 乌珠穆沁绵羊CAMKMT基因多态性与生长性状的关联分析第53-71页
        3.4.1 乌珠穆沁绵CAMKMT基因多态位点筛选第53-54页
        3.4.2 乌珠穆沁绵羊CAMKMT多态位点质谱分型结果第54-58页
        3.4.3 乌珠穆沁绵羊CAMKMT基因群体遗传参数分析结果第58-59页
        3.4.4 乌珠穆沁绵羊CAMKMT基因多态位点与生长性状的关联分析结果第59-64页
        3.4.5 连锁不平衡分析及单倍型构建结果第64-65页
        3.4.6 乌珠穆沁绵羊CAMKMT基因合并基因型与生长性状的关联分析结果第65-68页
        3.4.7 生物信息学分析结果第68-71页
第四章 讨论第71-77页
    4.1 乌珠穆沁绵羊MEF2B基因与生长性状的关联分析第71页
    4.2 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因与生长性状的关联分析第71-73页
        4.2.1 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态与群体遗传结构分析第72页
        4.2.2 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因与生长性状的关联分析第72-73页
    4.3 乌珠穆沁绵羊CAMKMT基因与生长性状的关联分析第73-75页
        4.3.1 乌珠穆沁绵羊CAMKMT基因多态位点与群体遗传结构分析第73页
        4.3.2 乌珠穆沁绵羊CAMKMT基因多态性与生长性状的关联分析第73-75页
    4.4 合并基因型与生长性状的关联分析第75-77页
第五章 全文结论第77-78页
参考文献第78-86页
致谢第86-87页
作者简历第87页

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