摘要 | 第6-8页 |
Abstract | 第8-9页 |
英文缩略表 | 第13-14页 |
第一章 引言 | 第14-25页 |
1.1 乌珠穆沁绵羊品种特征 | 第14页 |
1.2 全基因组关联分析(GWAS)研究进展 | 第14-17页 |
1.2.1 牛GWAS研究进展 | 第15页 |
1.2.2 猪GWAS研究进展 | 第15-16页 |
1.2.3 鸡GWAS研究进展 | 第16页 |
1.2.4 绵羊GWAS研究进展 | 第16-17页 |
1.3 绵羊生长性状候选基因研究进展 | 第17-21页 |
1.3.1 候选基因MEF2B研究进展 | 第17-20页 |
1.3.2 候选基因RIPK2研究进展 | 第20-21页 |
1.3.3 候选基因CAMKMT研究进展 | 第21页 |
1.4 SNP分子标记检测方法 | 第21-23页 |
1.4.1 以结构为基础的检测方法 | 第22页 |
1.4.2 Taqman荧光探针法 | 第22页 |
1.4.3 SNaPshot测序方法 | 第22-23页 |
1.4.4 质谱分型法简介 | 第23页 |
1.5 试验目的及意义 | 第23-25页 |
第二章 材料与方法 | 第25-34页 |
2.1 试验材料 | 第25-27页 |
2.1.1 试验动物 | 第25页 |
2.1.2 乌珠穆沁绵羊的生长性状 | 第25页 |
2.1.3 试验常用试剂 | 第25-26页 |
2.1.4 试验主要使用设备 | 第26页 |
2.1.5 主要分子生物学软件 | 第26-27页 |
2.2 试验方法 | 第27-29页 |
2.2.1 血液基因组DNA提取及质量检测 | 第27页 |
2.2.2 混池DNA PCR扩增引物设计 | 第27-28页 |
2.2.3 DNA混合池构建和PCR扩增 | 第28-29页 |
2.2.4 PCR产物测序并寻找SNP位点 | 第29页 |
2.3 质谱分型 | 第29-31页 |
2.3.1 PCR反应及产物纯化 | 第29-30页 |
2.3.2 SAP纯化 | 第30页 |
2.3.3 单碱基延伸反应 | 第30-31页 |
2.3.4 产物纯化 | 第31页 |
2.3.5 输出分型数据 | 第31页 |
2.4 数据处理与统计分析 | 第31-33页 |
2.4.1 等位基因频率和基因型频率 | 第31-32页 |
2.4.2 纯合度和杂合度 | 第32页 |
2.4.3 Hardy-Weinberg平衡检验 | 第32-33页 |
2.4.4 多态信息含量 | 第33页 |
2.4.5 多态位点与生长性状的关联分析 | 第33页 |
2.5 生物信息学分析 | 第33-34页 |
第三章 试验结果 | 第34-71页 |
3.1 绵羊血液基因组DNA提取结果 | 第34页 |
3.2 乌珠穆沁绵羊MEF2B基因多态性与生长性状的关联分析结果 | 第34-38页 |
3.2.1 乌珠穆沁绵羊MEF2B基因多态位点筛选结果 | 第34-35页 |
3.2.2 乌珠穆沁绵羊MEF2B基因质谱分型结果结果 | 第35页 |
3.2.3 乌珠穆沁绵羊MEF2B基因多态性与生长性状的关联分析结果 | 第35-38页 |
3.3 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态性与生长性状的关联分析 | 第38-53页 |
3.3.1 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态位点筛选 | 第38-39页 |
3.3.2 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态位点质谱分型结果 | 第39-41页 |
3.3.3 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因群体遗传学参数结果 | 第41-43页 |
3.3.4 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态性与生长性状的关联分析结果 | 第43-47页 |
3.3.5 连锁不平衡分析及单倍型构建结果 | 第47页 |
3.3.6 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因合并基因型与生长性状的关联分析结果 | 第47-51页 |
3.3.7 生物信息学分析结果 | 第51-53页 |
3.4 乌珠穆沁绵羊CAMKMT基因多态性与生长性状的关联分析 | 第53-71页 |
3.4.1 乌珠穆沁绵CAMKMT基因多态位点筛选 | 第53-54页 |
3.4.2 乌珠穆沁绵羊CAMKMT多态位点质谱分型结果 | 第54-58页 |
3.4.3 乌珠穆沁绵羊CAMKMT基因群体遗传参数分析结果 | 第58-59页 |
3.4.4 乌珠穆沁绵羊CAMKMT基因多态位点与生长性状的关联分析结果 | 第59-64页 |
3.4.5 连锁不平衡分析及单倍型构建结果 | 第64-65页 |
3.4.6 乌珠穆沁绵羊CAMKMT基因合并基因型与生长性状的关联分析结果 | 第65-68页 |
3.4.7 生物信息学分析结果 | 第68-71页 |
第四章 讨论 | 第71-77页 |
4.1 乌珠穆沁绵羊MEF2B基因与生长性状的关联分析 | 第71页 |
4.2 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因与生长性状的关联分析 | 第71-73页 |
4.2.1 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态与群体遗传结构分析 | 第72页 |
4.2.2 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因与生长性状的关联分析 | 第72-73页 |
4.3 乌珠穆沁绵羊CAMKMT基因与生长性状的关联分析 | 第73-75页 |
4.3.1 乌珠穆沁绵羊CAMKMT基因多态位点与群体遗传结构分析 | 第73页 |
4.3.2 乌珠穆沁绵羊CAMKMT基因多态性与生长性状的关联分析 | 第73-75页 |
4.4 合并基因型与生长性状的关联分析 | 第75-77页 |
第五章 全文结论 | 第77-78页 |
参考文献 | 第78-86页 |
致谢 | 第86-87页 |
作者简历 | 第87页 |