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基于SLAF-seq新一代测序技术的沼泽山雀SSR位点筛选及在亲子鉴定中的应用

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第1章 前言第11-15页
    1.1 鸟类的婚配制度第11-12页
    1.2 沼泽山雀的研究现状第12-13页
    1.3 微卫星的开发方法第13页
    1.4 目的与意义第13-15页
第2章 材料与方法第15-22页
    2.1 试剂与仪器第15-16页
        2.1.1 主要试剂及来源第15页
        2.1.2 主要仪器设备第15页
        2.1.3 实验中溶液配制第15-16页
    2.2 野外研究第16页
    2.3 实验方法第16-22页
        2.3.1 基因组的提取第16-17页
        2.3.2 性别鉴定第17-18页
        2.3.3 简化基因组水平的高通量测序第18页
        2.3.4 微卫星位点的开发第18页
        2.3.5 微卫星位点的筛选第18-21页
        2.3.6 父权鉴定第21-22页
第3章 研究结果第22-36页
    3.1 沼泽山雀的繁殖参数第22页
    3.2 沼泽山雀基因组提取水平第22-23页
    3.3 沼泽山雀的性别鉴定第23页
    3.4 沼泽山雀一个样本的简化基因组高通量测序结果第23页
    3.5 沼泽山雀的微卫星位点开发结果第23-27页
    3.6 沼泽山雀的微卫星位点筛选第27-32页
        3.6.1 Tm温度的优化与引物初步筛选第27页
        3.6.2 退火温度为59℃条件下沼泽山雀微卫星引物的筛选第27-28页
        3.6.3 沼泽山雀微卫星荧光引物的合成第28页
        3.6.4 沼泽山雀微卫星微点的多态性验证第28-31页
        3.6.5 父权鉴定体系的筛选第31-32页
    3.7 沼泽山雀的婚配制度第32-36页
        3.7.1 沼泽山雀的父权鉴定结果第32-33页
        3.7.2 有无婚外子代巢的窝卵数及子代遗传多样性差异第33页
        3.7.3 有无婚外子代的雄性亲鸟体征差异第33-34页
        3.7.4 婚内外子代的体征差异第34页
        3.7.5 婚外父权指派结果第34-36页
第4章 讨论第36-43页
    4.1 沼泽山雀的性别鉴定引物第36-37页
    4.2 沼泽山雀高通量测序数据结果对基因组的评估第37-38页
    4.3 沼泽山雀可用于父权鉴定的微卫星位点状况第38-40页
    4.4 沼泽山雀的婚外父权第40-43页
        4.4.1 雌性真的可以从EPC中获得遗传利益吗7第41页
        4.4.2 雌性和多个雄性交配是为了确保受精率?第41-43页
结论第43-44页
致谢第44-45页
参考文献第45-52页
攻读学位期间发表的学术论文及参加科研情况第52页

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