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基于PPI的蛋白质复合物发现算法的研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 绪论第11-20页
    1.1 研究背景及意义第11页
    1.2 蛋白质相互作用网络和蛋白质复合物第11-13页
    1.3 研究现状第13-17页
        1.3.1 小团簇渗透方法第13页
        1.3.2 寻找seed再扩张方法第13-15页
        1.3.3 基于模糊聚类的算法第15-16页
        1.3.4 基于图的随机游走的方法第16-17页
        1.3.5 基于有监督的聚类方法第17页
        1.3.6 研究现状小结第17页
    1.4 论文主要研究内容第17-18页
    1.5 本文组织结构第18-20页
第二章 相关知识和研究思路介绍第20-24页
    2.1 相关定义第20-22页
    2.2 研究思路介绍第22-23页
        2.2.1 seed聚类的寻找思路第22-23页
        2.2.2 扩张方法的思路介绍第23页
    2.3 本章小结第23-24页
第三章 基于重启型随机游走的一般seed扩张算法第24-35页
    3.1 引言第24-25页
    3.2 算法描述第25-34页
        3.2.1 基于重启型随机游走的重复seed选取方法第25-27页
        3.2.2 基于可收缩的密度公式比较方法的扩张过程第27-31页
        3.2.3 后续合并处理第31-34页
    3.3 本章小结第34-35页
第四章 基于重启型随机游走的节点分配算法第35-42页
    4.1 引言第35页
    4.2 算法描述第35-41页
        4.2.1 基于重启型随机游走的互不相交的seed生成第35-39页
        4.2.2 剩余节点分配方法第39页
        4.2.3 整体框架第39-41页
    4.3 本章小结第41-42页
第五章 实验过程与结果分析第42-54页
    5.1 实验数据第42页
    5.2 实验工具和方法第42-43页
    5.3 比较方法介绍和评测方法第43-44页
        5.3.1 比较方法介绍第43页
        5.3.2 评价方法第43-44页
    5.4 GRWC算法的实验结果和分析第44-50页
        5.4.1 整体表现第44-48页
        5.4.2 参数分析第48-50页
    5.5 CASRW算法的实验结果和分析第50-52页
        5.5.1 整体表现第50-51页
        5.5.2 参数分析第51-52页
    5.6 生物学意义第52-53页
    5.7 本章小结第53-54页
第六章 总结与展望第54-56页
    6.1 全文总结第54-55页
    6.2 未来展望第55-56页
参考文献第56-60页
致谢第60-61页
攻读学位期间发表论文情况第61页

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