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QSAR用于功能多肽的结构优化与设计

摘要第3-5页
ABSTRACT第5-6页
1 绪论第9-15页
    1.1 多肽的研究概述第9-10页
    1.2 肽的定量构效关系的研究现状第10-14页
    1.3 本文的研究思路及创新点第14-15页
2 原理与方法第15-25页
    2.1 多元线性回归第15页
    2.2 支持向量机第15页
    2.3 Topomer CoMFA 和 Topomer Search第15-16页
    2.4 模型评价参数第16-18页
    2.5 分子对接第18-19页
    2.6 分子动力学第19-20页
    2.7 量子化学第20-23页
    2.8 圆二色谱扫描第23-25页
        2.8.1 实验材料与仪器第23页
        2.8.2 实验与方法第23-25页
3 阿片肽的非天然氨基酸修饰第25-41页
    3.1 研究背景第25-27页
    3.2 数据来源及处理第27-28页
    3.3 结果与讨论第28-39页
        3.3.1 Topomer CoMFA 建模结果第28-31页
        3.3.2 Topomer Search 筛选第31-34页
        3.3.3 多位点分子修饰设计第34页
        3.3.4 分子对接第34-37页
        3.3.5 结合自由能的计算第37-39页
    3.4 小结第39-41页
4 阿片肽的天然氨基酸修饰第41-51页
    4.1 数据来源及结构表征第41-43页
    4.2 建模结果分析及分子设计第43-46页
    4.3 分子对接第46-49页
    4.4 小结第49-51页
5 淀粉样肽的设计第51-67页
    5.1 研究背景第51-52页
    5.2 数据来源及处理第52页
    5.3 结果与讨论第52-65页
        5.3.1 淀粉样肽的结构表征与 SVM 建模第52-55页
        5.3.2 疏水性和静电性在肽聚集过程中的作用第55-56页
        5.3.3 Aβ42序列中的可聚集序列的识别第56-57页
        5.3.4 hIAPP37序列中的可聚集序列的识别第57-59页
        5.3.5 可聚集肽的设计第59-61页
        5.3.6 动力学模拟第61-62页
        5.3.7 密度泛函优化第62-64页
        5.3.8 圆二色谱实验第64-65页
    5.4 小结第65-67页
6 结论与展望第67-69页
    6.1 研究结论第67-68页
    6.2 前景展望第68-69页
致谢第69-71页
参考文献第71-85页
附录第85-117页
    A. 215 个拟肽的结构及预测活性值第85-113页
    B. 558 条预测可聚集肽序列第113-117页
    C. 作者在攻读硕士学位期间发表的专利和论文第117页
    D. 作者在攻读学位期间参与的科研项目第117页

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