摘要 | 第3-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
1 绪论 | 第9-15页 |
1.1 多肽的研究概述 | 第9-10页 |
1.2 肽的定量构效关系的研究现状 | 第10-14页 |
1.3 本文的研究思路及创新点 | 第14-15页 |
2 原理与方法 | 第15-25页 |
2.1 多元线性回归 | 第15页 |
2.2 支持向量机 | 第15页 |
2.3 Topomer CoMFA 和 Topomer Search | 第15-16页 |
2.4 模型评价参数 | 第16-18页 |
2.5 分子对接 | 第18-19页 |
2.6 分子动力学 | 第19-20页 |
2.7 量子化学 | 第20-23页 |
2.8 圆二色谱扫描 | 第23-25页 |
2.8.1 实验材料与仪器 | 第23页 |
2.8.2 实验与方法 | 第23-25页 |
3 阿片肽的非天然氨基酸修饰 | 第25-41页 |
3.1 研究背景 | 第25-27页 |
3.2 数据来源及处理 | 第27-28页 |
3.3 结果与讨论 | 第28-39页 |
3.3.1 Topomer CoMFA 建模结果 | 第28-31页 |
3.3.2 Topomer Search 筛选 | 第31-34页 |
3.3.3 多位点分子修饰设计 | 第34页 |
3.3.4 分子对接 | 第34-37页 |
3.3.5 结合自由能的计算 | 第37-39页 |
3.4 小结 | 第39-41页 |
4 阿片肽的天然氨基酸修饰 | 第41-51页 |
4.1 数据来源及结构表征 | 第41-43页 |
4.2 建模结果分析及分子设计 | 第43-46页 |
4.3 分子对接 | 第46-49页 |
4.4 小结 | 第49-51页 |
5 淀粉样肽的设计 | 第51-67页 |
5.1 研究背景 | 第51-52页 |
5.2 数据来源及处理 | 第52页 |
5.3 结果与讨论 | 第52-65页 |
5.3.1 淀粉样肽的结构表征与 SVM 建模 | 第52-55页 |
5.3.2 疏水性和静电性在肽聚集过程中的作用 | 第55-56页 |
5.3.3 Aβ42序列中的可聚集序列的识别 | 第56-57页 |
5.3.4 hIAPP37序列中的可聚集序列的识别 | 第57-59页 |
5.3.5 可聚集肽的设计 | 第59-61页 |
5.3.6 动力学模拟 | 第61-62页 |
5.3.7 密度泛函优化 | 第62-64页 |
5.3.8 圆二色谱实验 | 第64-65页 |
5.4 小结 | 第65-67页 |
6 结论与展望 | 第67-69页 |
6.1 研究结论 | 第67-68页 |
6.2 前景展望 | 第68-69页 |
致谢 | 第69-71页 |
参考文献 | 第71-85页 |
附录 | 第85-117页 |
A. 215 个拟肽的结构及预测活性值 | 第85-113页 |
B. 558 条预测可聚集肽序列 | 第113-117页 |
C. 作者在攻读硕士学位期间发表的专利和论文 | 第117页 |
D. 作者在攻读学位期间参与的科研项目 | 第117页 |