| Abstract | 第6页 |
| Chapter 1:Introduction and background | 第10-15页 |
| 1.1 Background | 第10-13页 |
| 1.1.1 Amphibian | 第10页 |
| 1.1.2 The role of Amphibian skin | 第10-11页 |
| 1.1.3 The distribution of Amphibian | 第11页 |
| 1.1.4 Antimicrobial peptides genes (AMPs genes) and transcriptome | 第11-13页 |
| 1.2 The aim to the study | 第13-15页 |
| 1.2.1 Research goal | 第13页 |
| 1.2.2 Hypothesis | 第13-15页 |
| Chapter 2:Methodology | 第15-20页 |
| 2.1 Sample collection | 第15页 |
| 2.2 RNA extraction and mRNA purification | 第15-16页 |
| 2.3 cDNA library construction and Illumina sequencing | 第16-17页 |
| 2.4 sequencing machine | 第17-18页 |
| 2.5 Data filtration and De novo assembly | 第18页 |
| 2.6 Gene annotation | 第18页 |
| 2.7 Swissprot/TrEMBL and AMPs | 第18-19页 |
| 2.8 Phylogenetic Analysis of AMP gene | 第19-20页 |
| Chapter 3:Evaluate genes in different habitats | 第20-24页 |
| 3.1 Summary of transcriptome | 第20-21页 |
| 3.2 Evaluate the Transcript/Unigene in different habitats | 第21-22页 |
| 3.3 GENE ANNOTATED in different habitats | 第22-23页 |
| 3.4 Evaluate the transcript genes expressed AMPs in different habitats | 第23-24页 |
| Chapter 4:AMPs genes from RANIDAE FAMILY | 第24-39页 |
| 4.1 Introduction | 第24页 |
| 4.2 Results | 第24-38页 |
| 4.2.1 Pelophylax. nigromaculatus | 第24-31页 |
| 4.2.1.1 Habitat preferences | 第25页 |
| 4.2.1.2 De novo assembly | 第25页 |
| 4.2.1.3 AMPs gene transcript | 第25-28页 |
| 4.2.1.4 cDNA precursors | 第28-31页 |
| 4.2.2. Odorrana margaretae (Green odorous frog) | 第31-38页 |
| 4.2.2.1 Habitat preferences | 第31-32页 |
| 4.2.2.2 De novo assembly | 第32页 |
| 4.2.2.3 AMPs gene transcript | 第32-38页 |
| 4.3 Discussion | 第38-39页 |
| Chapter 5:AMPs genes from MEGOPHRYIDAE FAMILY | 第39-49页 |
| 5.1 Introduction | 第39页 |
| 5.2 Results | 第39-48页 |
| 5.2.1 Habitat preferences | 第39-40页 |
| 5.2.2 De novo assembly and AMPs genes transcripts | 第40-44页 |
| 5.2.3 cDNA precursors | 第44-48页 |
| 5.3 Discussion | 第48-49页 |
| Chapter 6:AMPs genes from RHACOPHORIDAE FAMILY | 第49-67页 |
| 6.1 Introduction | 第49-50页 |
| 6.2 Results | 第50-66页 |
| 6.2.1 Polypedates megacephalus | 第50-57页 |
| 6.2.1.1 Habitat preferences | 第50页 |
| 6.2.1.2 De novo assembly and AMPs genes transcripts | 第50-53页 |
| 6.2.1.3 cDNA precursors | 第53-57页 |
| 6.2.2 Rhacophorus dennysi | 第57-62页 |
| 6.2.2.1 Habitat preferences | 第57页 |
| 6.2.2.2 De novo assembly and AMPs gene transcript | 第57-59页 |
| 6.2.2.3 cDNA precursors | 第59-62页 |
| 6.2.3 Rhacophorus Omeimontis | 第62-66页 |
| 6.2.3.1 Habitat preferences | 第62页 |
| 6.2.3.2 De novo assembly and AMPs gene transcript | 第62-64页 |
| 6.2.3.3 cDNA precursors | 第64-66页 |
| 6.3 Discussion | 第66-67页 |
| Chapter 7: Summary and Conclusion | 第67-72页 |
| 7.1 Summary | 第67-70页 |
| 7.2 Conclusions | 第70-71页 |
| 7.3 Future study | 第71-72页 |
| Reference | 第72-77页 |
| List of Abbreviations | 第77-78页 |
| Acknowledgements | 第78-79页 |
