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基于RNA-seq的‘细榧高含油量分子机制初探及SSR标记开发

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 文献综述第11-20页
    1.1 榧属概况第11-13页
        1.1.1 榧属简介第11-12页
        1.1.2 榧树的类型第12页
        1.1.3 香榧的研究进展第12-13页
    1.2 木本油料作物脂肪酸研究进展第13-19页
        1.2.1 脂类合成概述第13-15页
        1.2.2 调控油量的相关基因第15-18页
        1.2.3 植物油脂合成相关因子第18页
        1.2.4 影响脂肪酸合成的其他途径上的基因第18-19页
    1.3 本研究的目的意义及研究内容第19-20页
        1.3.1 目的及意义第19页
        1.3.2 研究内容第19-20页
第二章 ‘细榧’和‘圆榧’种子油脂合成期脂肪酸代谢途径基因的表达分析第20-37页
    2.1 材料与方法第20-25页
        2.1.1 实验材料第20-22页
        2.1.2 实验方法第22-25页
    2.2 结果与分析第25-32页
        2.2.1 总RNA提取结果第25-26页
        2.2.2 cDNA检验第26页
        2.2.3 部分引物筛选第26页
        2.2.4 差异基因的表达分析第26-29页
        2.2.5 qRT-PCR验证油脂合成相关基因的表达第29-32页
    2.3 讨论第32-37页
        2.3.1‘细榧’中各基因的表达量分析第32-34页
        2.3.2‘圆榧’中各基因的表达分析第34-35页
        2.3.3‘细榧’与‘圆榧’中基因的表达差异第35-37页
第三章 ‘细榧’KAS1、FAD2-2、GPAT6基因的克隆第37-61页
    3.1 材料与方法第37-39页
        3.1.1 实验材料第37页
        3.1.2 实验仪器第37页
        3.1.3 实验方法第37-39页
    3.2 结果与分析第39-59页
        3.2.1‘细榧’总RNA的提取结果第39-40页
        3.2.2 cDNA检测结果第40页
        3.2.3 KAS1基因克隆结果第40-47页
        3.2.4 FAD2-2 基因克隆结果第47-53页
        3.2.5 GPAT6基因克隆结果第53-59页
    3.3 结论与讨论第59-61页
        3.3.1 脂肪酸合成关键基因KAS1的克隆第59页
        3.3.2 脂肪酸合成关键基因FAD2-2 的克隆第59-60页
        3.3.3 脂肪酸合成关键基因GPAT6的克隆第60-61页
第四章 基于榧树EST转录组数据库SSR标记的开发第61-72页
    4.1 材料与方法第61页
        4.1.1 植物材料第61页
        4.1.2 实验仪器第61页
    4.2 研究方法第61-63页
        4.2.1 转录组数据来源第61页
        4.2.2 DNA的提取第61-62页
        4.2.3 引物设计及合成第62页
        4.2.4 琼脂糖凝胶电泳第62-63页
        4.2.5 聚丙烯酰胺凝胶电泳第63页
        4.2.6 数据统计第63页
    4.3 结果与分析第63-70页
        4.3.1 榧树EST-SSR的分布及结构特点第63-65页
        4.3.2 转录组SSR基序重复类型和频率特征第65-67页
        4.3.3 榧树种子EST-SSR引物的有效性及通用性第67-68页
        4.3.4 SSR引物评价第68-70页
    4.4 讨论第70-72页
第五章 总结第72-74页
    5.1 qRT-PCR验证17个基因在‘细榧’与‘圆榧’种子发育时期的表达第72页
    5.2‘细榧’中KAS1、FAD2-2、GPAT6 cDNA序列的克隆第72页
    5.3 基于榧树转录组数据开发SSR分子标记第72-74页
参考文献第74-81页
致谢第81页

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