| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 第一章 绪论 | 第11-24页 |
| 1 根肿菌概述 | 第11-13页 |
| 1.1 根肿病的症状及危害 | 第11页 |
| 1.2 根肿菌的分类、寄主及传播 | 第11-12页 |
| 1.3 根肿菌的生活史和侵染循环 | 第12-13页 |
| 2 根肿菌与寄主的分子互作研究进展 | 第13-19页 |
| 2.1 根肿菌致病相关基因 | 第13-14页 |
| 2.2 寄主植物的应答反应 | 第14-19页 |
| 2.2.1 寄主植物在基因水平上的变化 | 第15-16页 |
| 2.2.2 寄主植物在蛋白水平上的变化 | 第16页 |
| 2.2.3 寄主植物代谢产物和激素调节的变化 | 第16-19页 |
| 3 代谢组学研究进展 | 第19-23页 |
| 3.1 代谢组学简介 | 第19-20页 |
| 3.2 代谢组数据分析 | 第20-21页 |
| 3.3 代谢组学在植物与病原物互作研究中的应用 | 第21-23页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第23-24页 |
| 第二章 根肿菌接种体系的优化 | 第24-31页 |
| 1 材料与方法 | 第24-25页 |
| 1.1 研究材料 | 第24页 |
| 1.1.1 供试菌株和植物 | 第24页 |
| 1.1.2 培养基 | 第24页 |
| 1.1.3 试剂与仪器 | 第24页 |
| 1.2 研究方法 | 第24-25页 |
| 1.2.1 罹病油菜根的组织培养 | 第24-25页 |
| 1.2.2 纯化根肿菌及其孢子液的制备 | 第25页 |
| 1.2.3 拟南芥培养及根肿菌接种 | 第25页 |
| 1.2.4 根肿菌的显微观察 | 第25页 |
| 2 结果与分析 | 第25-28页 |
| 2.1 罹病油菜根愈伤组织中根肿菌形态观察 | 第25-27页 |
| 2.2 1/2MS培养基上根肿菌对拟南芥的侵染过程 | 第27-28页 |
| 3 总结与讨论 | 第28-31页 |
| 第三章 根肿菌侵染拟南芥的代谢组学研究 | 第31-41页 |
| 1 材料与方法 | 第31-33页 |
| 1.1 研究材料 | 第31页 |
| 1.1.1 供试菌株和植物 | 第31页 |
| 1.1.2 培养基 | 第31页 |
| 1.1.3 试剂和仪器 | 第31页 |
| 1.2 研究方法 | 第31-33页 |
| 1.2.1 根肿菌孢子液的制备 | 第31页 |
| 1.2.2 拟南芥的培养及根肿菌接种 | 第31页 |
| 1.2.3 代谢物样品的制备 | 第31-32页 |
| 1.2.4 UPLC-MS分析 | 第32页 |
| 1.2.5 数据预处理与统计分析 | 第32-33页 |
| 1.2.6 差异代谢物的定性与代谢通路分析 | 第33页 |
| 2 结果与分析 | 第33-39页 |
| 2.1 拟南芥根部样品的UPLC-MS分析和数据预处理 | 第33-34页 |
| 2.2 代谢组数据的统计分析 | 第34-37页 |
| 2.3 差异代谢物的鉴定 | 第37-38页 |
| 2.4 差异代谢物的Pathway显著性富集分析 | 第38-39页 |
| 3 总结与讨论 | 第39-41页 |
| 第四章 根肿菌早期侵染对油菜代谢组的影响 | 第41-64页 |
| 1 材料与方法 | 第41-42页 |
| 1.1 研究材料 | 第41页 |
| 1.1.1 供试菌株和植物 | 第41页 |
| 1.1.2 试剂和仪器 | 第41页 |
| 1.2 研究方法 | 第41-42页 |
| 1.2.1 根肿菌孢子液的制备 | 第41页 |
| 1.2.2 油菜的培养及取样 | 第41页 |
| 1.2.3 代谢物的提取 | 第41-42页 |
| 1.2.4 UPLC-MS分析 | 第42页 |
| 1.2.5 数据预处理与统计分析 | 第42页 |
| 1.2.6 差异代谢物的定性与代谢通路分析 | 第42页 |
| 2 结果与分析 | 第42-59页 |
| 2.1 油菜根被根肿菌侵染1d时代谢产物的差异分析 | 第42-44页 |
| 2.2 油菜根被根肿菌侵染2d时代谢产物的差异分析 | 第44-46页 |
| 2.3 油菜根被根肿菌侵染5d时代谢产物的差异分析 | 第46-48页 |
| 2.4 受根肿菌侵染不同时间点的油菜代谢产物的差异分析 | 第48-56页 |
| 2.5 油菜应答根肿菌早期侵染的差异代谢物的Pathway富集分析 | 第56-59页 |
| 3 总结与讨论 | 第59-64页 |
| 3.1 进行代谢组分析的根肿菌侵染时间点的选择 | 第59-60页 |
| 3.2 油菜接种根肿菌后的差异代谢物分析 | 第60-61页 |
| 3.3 根肿菌侵染不同时间点的油菜代谢差异分析 | 第61-62页 |
| 3.4 差异代谢物的Pathway富集分析 | 第62-64页 |
| 第五章 全文总结与展望 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |
