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七鳃鳗高迁移率族蛋白(HMGB1)基因克隆、表达及生物学活性研究

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
第1章 文献综述第13-24页
    1.1 HMGB1 分子特征第13-14页
    1.2 HMGB1 翻译后修饰与其定位、分泌的关系第14-15页
    1.3 HMGB1 受体及信号转导途径第15-17页
        1.3.1 HMGB1 和晚期糖基化终末产物受体第15页
        1.3.2 HMGB1 和 Toll 样受体第15-17页
    1.4 高迁移率族蛋白 B1------启动免疫应答的重要信号分子第17-20页
        1.4.1 HMGB1----启动免疫应答的预警素第18页
        1.4.2 HMGB1 和固有免疫第18页
        1.4.3 HMGB1 和适应性免疫第18-20页
            1.4.3.1 HMGB1 介导的树突状细胞在适应性免疫方面的作用第19页
            1.4.3.2 HMGB1 直接激活 T 细胞第19-20页
            1.4.3.3 HMGB1-----一种内源性免疫佐剂第20页
    1.5 本研究的目的和意义第20-24页
        1.5.1 目的第20-21页
        1.5.2 意义第21-24页
            1.5.2.1 七鳃鳗在进化和发育生物学研究中的重要意义第21页
            1.5.2.2 七鳃鳗具有特有的免疫器官及适应性免疫系统第21-23页
            1.5.2.3 HMGB1 基因研究现状第23-24页
第2章 七鳃鳗 HMGB 家族基因的分子克隆及生物信息学分析第24-46页
    2.1 七鳃鳗白细胞 HMGB 家族基因的克隆第24-32页
        2.1.1 材料第24-25页
        2.1.2 方法第25-30页
            2.1.2.1 引物设计第25页
            2.1.2.2 七鳃鳗白细胞的分离第25-26页
            2.1.2.3 提取总 RNA第26-27页
            2.1.2.4 逆转录-聚合酶链式反应 (RT-PCR)第27-29页
            2.1.2.5 目的片段与载体相连及鉴定第29-30页
        2.1.3 结果第30-32页
            2.1.3.1 RT-PCR第30页
            2.1.3.2 阳性转化子筛选第30-32页
    2.2 RT-PCR 法检测七鳃鳗 HMGB1/2/X 基因在组织中的表达第32-33页
        2.2.1 材料第32页
        2.2.2 方法第32页
        2.2.3 结果第32-33页
    2.3 七鳃鳗 HMGB 家族基因生物信息学分析第33-36页
        2.3.1 数据库和软件第33页
        2.3.2 方法第33页
            2.3.2.1 一级结构分析第33页
            2.3.2.2 同源序列比对第33页
        2.3.3 结果第33-36页
            2.3.3.1 理化性质分析第33-35页
            2.3.3.2 同源序列比对第35-36页
    2.4 脊椎动物 HMGB 家族进化分析第36-43页
        2.4.1 数据库和软件第36页
        2.4.2 方法第36-37页
            2.4.2.1 HMGB 家族成员的识别第36-37页
            2.4.2.2 序列同源性比对第37页
            2.4.2.3 系统发育分析第37页
            2.4.2.4 结构域和保守基序分析第37页
        2.4.3 结果第37-43页
            2.4.3.1 序列分析第37-39页
            2.4.3.2 系统发育分析第39-40页
            2.4.3.3 HMGB 结构域与基序分析第40-43页
    2.5 讨论第43-45页
    2.6 小结第45-46页
第3章 七鳃鳗 HMGB1 基因表达、蛋白纯化及多克隆抗体的制备第46-67页
    3.1 实时荧光定量 PCR 法检测 HMGB1 的表达第46-50页
        3.1.1 材料第46-47页
        3.1.2 方法第47-49页
            3.1.2.1 分离七鳃鳗外周血白细胞第47页
            3.1.2.2 Total RNA 提取第47页
            3.1.2.3 RNA 质量检测第47-48页
            3.1.2.4 Real Time PCR 法检测目的基因的相对表达量第48-49页
        3.1.3 结果第49-50页
    3.2 七鳃鳗 HMGB1 基因原核表达及重组蛋白纯化第50-60页
        3.2.1 材料第50-51页
        3.2.2 方法第51-57页
            3.2.2.1 设计引物第51页
            3.2.2.2 PCR 扩增第51-52页
            3.2.2.3 目的片段回收第52页
            3.2.2.4 Vector DNA 的制备第52页
            3.2.2.5 目的片段与载体连接第52页
            3.2.2.6 转化第52-53页
            3.2.2.7 重组表达菌的鉴定第53页
            3.2.2.8 测序分析第53页
            3.2.2.9 阳性重组子的诱导表达第53-54页
            3.2.2.10 采用可溶性蛋白的提取方法对诱导表达的重组蛋白进行提取和鉴定第54页
            3.2.2.11 SDS-PAGE 鉴定第54-55页
            3.2.2.12 Western blot 鉴定第55页
            3.2.2.13 重组蛋白的纯化第55-57页
            3.2.2.14 重组蛋白浓度测定第57页
        3.2.3 结果第57-60页
    3.3 兔抗七鳃鳗 HMGB1 蛋白多克隆抗体的制备及检测第60-65页
        3.3.1 材料第60-61页
        3.3.2 方法第61-63页
            3.3.2.1 免疫原:rLj-HMGB1 蛋白第61页
            3.3.2.2 免疫血清的收集抗原与佐剂乳化第61页
            3.3.2.3 抗体制备第61页
            3.3.2.4 多克隆抗体纯化第61-62页
            3.3.2.5 ELISA 法测定抗体效价第62-63页
            3.3.2.6 抗体结合能力检测第63页
        3.3.3 结果第63-65页
            3.3.3.1 兔抗七鳃鳗 HMGB1 多克隆抗体的制备和效价测定第63-64页
            3.3.3.2 抗体结合能力检测第64-65页
    3.4 讨论第65-66页
    3.5 小结第66-67页
第4章 重组蛋白生物学活性测定第67-81页
    4.1 七鳃鳗 HMGB1 蛋白在口腔腺分泌特性检测第67-68页
        4.1.1 材料第67页
        4.1.2 方法第67-68页
            4.1.2.1 SDS-PAGE第67-68页
            4.1.2.2 Western blot 检测第68页
        4.1.3 结果第68页
    4.2 免疫组化法检测 HMGB1 在口腔腺中的分布情况第68-71页
        4.2.1 材料第68-69页
        4.2.2 方法第69-70页
            4.2.2.1 石蜡切片的制备第69页
            4.2.2.2 HE 染色第69页
            4.2.2.3 免疫组化染色第69-70页
        4.2.3 结果第70-71页
    4.3 EMSA 法验证 rLj-HMGB1 结合 DNA第71-74页
        4.3.1 材料第71页
        4.3.2 方法第71-72页
        4.3.3 结果第72-74页
    4.4 七鳃鳗 HMGB1 保护 DNA 免受 DNA 酶水解第74-75页
        4.4.1 材料第74页
        4.4.2 方法第74-75页
        4.4.3 结果第75页
    4.5 七鳃鳗 HMGB1 促进 THP1 细胞释放炎症因子第75-77页
        4.5.1 材料第75页
        4.5.2 方法第75页
        4.5.3 结果第75-77页
    4.6 七鳃鳗 HMGB1 促进 MCF-7 细胞增殖第77-78页
        4.6.1 材料第77页
        4.6.2 方法第77页
        4.6.3 结果第77-78页
    4.7 讨论第78-79页
    4.8 小结第79-81页
第5章 七鳃鳗 HMGB1 基因真核表达载体构建及鉴定第81-93页
    5.1 七鳃鳗 HMGB1 基因真核表达载体构建第81-85页
        5.1.1 材料第81页
        5.1.2 方法第81-84页
            5.1.2.1 设计引物第81页
            5.1.2.2 Insert DNA 的制备第81-82页
            5.1.2.3 Vector DNA 的制备第82-83页
            5.1.2.4 目的片段与载体连接第83页
            5.1.2.5 转化和筛选阳性克隆第83页
            5.1.2.6 提取质粒第83-84页
            5.1.2.7 测序分析第84页
        5.1.3 结果第84-85页
    5.2 真核表达载体 pIRES2-AcGFP1-Nuc-LjHMGB1 在 HeLa 细胞中表达第85-88页
        5.2.1 材料第85页
        5.2.2 方法第85-86页
            5.2.2.1 细胞培养基配制第85页
            5.2.2.2 细胞培养方法第85-86页
        5.2.3 结果第86-88页
    5.3 真核表达载体 pIRES2-AcGFP1-Nuc-LjHMGB1 在七鳃鳗类淋巴细胞中表达第88-90页
        5.3.1 材料第88页
        5.3.2 方法第88-89页
            5.3.2.1 细胞培养基配制第88页
            5.3.2.2 细胞培养方法第88-89页
        5.3.3 结果第89-90页
            5.3.3.1 GFP 在七鳃鳗类淋巴细胞中表达第89页
            5.3.3.2 LjHMGB1 蛋白在七鳃鳗类淋巴细胞中表达第89-90页
    5.4 讨论第90-91页
    5.5 小结第91-93页
第6章 结论第93-94页
本论文的创新点第94-95页
参考文献第95-102页
附录第102-117页
    附录 1 七鳃鳗 HMGB1/2/X 测序结果第102-106页
    附录 2 植物、无脊椎动物、脊椎动物的 HMGB 家族氨基酸序列第106-111页
    附录 3 实时荧光定量 PCR 管家基因和目的基因的标准曲线第111-114页
    附录 4 pET-28a vector information第114-115页
    附录 5 In-Fusion 基因克隆方法第115-116页
    附录 6 pIRES2-AcGFP1-Nuc vector information第116-117页
攻读博士学位期间发表学术论文情况第117-118页
主持科研项目名称第118-119页
致谢第119页

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