| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 英文缩略表 | 第11-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-25页 |
| 1.1 土壤微生物的特性及对不同施肥的响应 | 第12-13页 |
| 1.2 施肥对土壤理化性质和作物产量的影响 | 第13-14页 |
| 1.3 土壤酶活性对施肥的响应 | 第14-17页 |
| 1.3.1 土壤脲酶 | 第14-15页 |
| 1.3.2 土壤纤维素酶 | 第15页 |
| 1.3.3 土壤过氧化氢酶 | 第15页 |
| 1.3.4 土壤酶活研究进展 | 第15-17页 |
| 1.4 土壤微生物生态的研究方法 | 第17-23页 |
| 1.4.1 传统微生物培养法 | 第17页 |
| 1.4.2 磷脂脂肪酸分析法 | 第17-18页 |
| 1.4.3 变形梯度凝胶电泳法 | 第18-19页 |
| 1.4.4 Biolog 微平板法 | 第19-20页 |
| 1.4.5 454 焦磷酸测序法 | 第20-22页 |
| 1.4.6 Illumina Miseq 平台测序技术 | 第22-23页 |
| 1.5 试验目的、内容和技术路线 | 第23-25页 |
| 1.5.1 研究目的和意义 | 第23页 |
| 1.5.2 研究内容和技术路线 | 第23-25页 |
| 第二章 施肥处理对土壤理化指标、作物产量的影响 | 第25-30页 |
| 2.1 试验材料和方法 | 第25-26页 |
| 2.1.1 试验地简介和施肥情况 | 第25页 |
| 2.1.2 土壤样品采集 | 第25-26页 |
| 2.1.3 测产方法 | 第26页 |
| 2.1.4 土壤理化性质的测定 | 第26页 |
| 2.1.5 主要仪器设备 | 第26页 |
| 2.1.6 数据处理 | 第26页 |
| 2.2 结果与分析 | 第26-28页 |
| 2.2.1 不同施肥处理对土壤养分和 pH 的影响 | 第26-28页 |
| 2.2.2 不同施肥处理对产量的影响 | 第28页 |
| 2.3 讨论 | 第28-30页 |
| 第三章 不同施肥处理对土壤微生物数量和2013年玉米生育期酶活的影响 | 第30-40页 |
| 3.1 试验材料和方法 | 第30-33页 |
| 3.2 结果与分析 | 第33-38页 |
| 3.2.1 2012 和 2013 年不同施肥处理对土壤微生物数量的影响 | 第33-34页 |
| 3.2.2 2013 年玉米季土壤纤维素酶的动态变化 | 第34页 |
| 3.2.3 2013 年玉米季土壤脲酶的动态变化 | 第34-35页 |
| 3.2.4 2013 年土壤过氧化氢酶的动态变化 | 第35-36页 |
| 3.2.5 土壤性状及产量变化 | 第36-37页 |
| 3.2.6 玉米产量与拔节期和大喇叭口期酶活相关性比较 | 第37-38页 |
| 3.3 结论与讨论 | 第38-40页 |
| 第四章 不同施肥处理对土壤微生物结构多样性的影响 | 第40-60页 |
| 4.1 材料与方法 | 第40-44页 |
| 4.1.1 主要仪器设备 | 第40页 |
| 4.1.2 主要缓冲液和试剂 | 第40-41页 |
| 4.1.3 土壤样品采集 | 第41页 |
| 4.1.4 试验方法 | 第41-44页 |
| 4.2 结果与分析 | 第44-58页 |
| 4.2.1 土壤 DNA 的提取结果 | 第44-45页 |
| 4.2.2 2012 年小麦季土壤细菌 DGGE 数据分析 | 第45-46页 |
| 4.2.3 2012 年玉米季土壤细菌 DGGE 数据分析 | 第46-48页 |
| 4.2.4 2013 年小麦季土壤细菌 DGGE 数据分析 | 第48-49页 |
| 4.2.5 2013 年玉米季土壤细菌 DGGE 数据分析 | 第49-51页 |
| 4.2.6 2012 年小麦季土壤真菌 DGGE 数据分析 | 第51-53页 |
| 4.2.7 2012 年玉米季土壤真菌 DGGE 数据分析 | 第53-55页 |
| 4.2.8 2013 年小麦季土壤真菌 DGGE 数据分析 | 第55-56页 |
| 4.2.9 2013 年玉米季土壤真菌 DGGE 数据分析 | 第56-58页 |
| 4.3 讨论 | 第58-60页 |
| 第五章 不同施肥对土壤微生物功能多样性的影响 | 第60-69页 |
| 5.1 材料和方法 | 第60-63页 |
| 5.1.1 样品采集 | 第60页 |
| 5.1.2 Biolog Eco 板接种和培养 | 第60页 |
| 5.1.3 Biolog-Eco 板中的 31 种碳源 | 第60-61页 |
| 5.1.4 Biolog 板中碳源分类 | 第61-62页 |
| 5.1.5 Biolog 数据分析 | 第62-63页 |
| 5.2 结果与分析 | 第63-67页 |
| 5.2.1 土壤微生物的孔平均颜色变化率(AWCD) | 第63-64页 |
| 5.2.2 土壤微生物群落多样性分析 | 第64-65页 |
| 5.2.3 土壤微生物多样性的主成分分析 | 第65-67页 |
| 5.2.4 综合主成分值 | 第67页 |
| 5.3 讨论 | 第67-69页 |
| 第六章 454 高通量测序技术分析土壤真菌菌群结构 | 第69-78页 |
| 6.1 试验材料 | 第69-71页 |
| 6.1.1 土样采集 | 第69页 |
| 6.1.2 土样 DNA 提取 | 第69页 |
| 6.1.3 DNA 检测结果 | 第69页 |
| 6.1.4 引物 | 第69-70页 |
| 6.1.5 PCR 反应条件 | 第70页 |
| 6.1.6 PCR 反应体系 | 第70页 |
| 6.1.7 PCR 温度/循环梯度反应参数 | 第70页 |
| 6.1.8 结果 | 第70-71页 |
| 6.2 试验流程 | 第71页 |
| 6.2.1. 宏基因组 DNA 样品和 PCR 引物准备 | 第71页 |
| 6.2.2. Amplicon 文库制备 | 第71页 |
| 6.2.3. emPCR 扩增 | 第71页 |
| 6.2.4 Roche 454 GS FLX+测序仪上机测序 | 第71页 |
| 6.2.5 运行测序 | 第71页 |
| 6.3 结果分析 | 第71-76页 |
| 6.3.1 原始数据处理与样品序列数目统计 | 第71-72页 |
| 6.3.2 OTU 列表生成 | 第72-73页 |
| 6.3.3 不同施肥处理样品的稀释曲线 | 第73页 |
| 6.3.4 Alpha 多样性指数分析 | 第73-74页 |
| 6.3.5 不同施肥处理的物种分布 | 第74-75页 |
| 6.3.6 Beta 多样性分析 | 第75-76页 |
| 6.4 讨论 | 第76-78页 |
| 第七章 Illumina 高通量测序分析土壤细菌和古菌群落结构 | 第78-88页 |
| 7.1 试验材料 | 第78-80页 |
| 7.1.1 土样采集 | 第78页 |
| 7.1.2 土样 DNA 提取 | 第78页 |
| 7.1.3 DNA 检测结果 | 第78页 |
| 7.1.4 引物 | 第78页 |
| 7.1.5 PCR 扩增反应条件和体系 | 第78-79页 |
| 7.1.6 PCR 温度梯度反应参数 | 第79页 |
| 7.1.7 PCR 循环梯度反应参数 | 第79-80页 |
| 7.1.8 结论 | 第80页 |
| 7.2 高通量测序流程 | 第80-81页 |
| 7.2.1 PCR 产物纯化与定量 | 第80页 |
| 7.2.2 DNA 双末端修复 | 第80页 |
| 7.2.3 连接接头 | 第80页 |
| 7.2.4 富集 DNA 片段 | 第80页 |
| 7.2.5 验证文库 | 第80页 |
| 7.2.6 均一化并混合文库 | 第80-81页 |
| 7.2.7 上机测序 | 第81页 |
| 7.3 结果与分析 | 第81-85页 |
| 7.3.1 原始数据处理与样品序列数目统计 | 第81页 |
| 7.3.2 序列长度分布 | 第81-82页 |
| 7.3.3 OTU 列表生成及注释 | 第82页 |
| 7.3.4 稀释曲线 | 第82页 |
| 7.3.5 Alpha 多样性分析 | 第82-83页 |
| 7.3.6 不同施肥处理的物种分布 | 第83-84页 |
| 7.3.7 Beta 多样性分析 | 第84-85页 |
| 7.4 讨论 | 第85-88页 |
| 第八章 结论与展望 | 第88-91页 |
| 8.1 研究结论 | 第88-90页 |
| 8.2 研究展望 | 第90-91页 |
| 参考文献 | 第91-99页 |
| 附录 | 第99-100页 |
| 在读期间已发表论文 | 第99页 |
| 作者简历 | 第99页 |
| 在读期间参研项目 | 第99-100页 |
| 致谢 | 第100-101页 |
