| 缩略词表 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第11-23页 |
| 1.1 一氧化氮在植物中的生理作用研究进展 | 第11-17页 |
| 1.1.1 一氧化氮的化学性质 | 第11-12页 |
| 1.1.2 一氧化氮在植物中的来源 | 第12-14页 |
| 1.1.2.1 NO在植物中的产生部位 | 第12页 |
| 1.1.2.2 NO在植物中的产生途径 | 第12-14页 |
| 1.1.3 一氧化氮在植物中的生理功能 | 第14-17页 |
| 1.1.3.1 调节生长发育 | 第14-15页 |
| 1.1.3.2 调控逆境应答 | 第15-17页 |
| 1.1.4 一氧化氮处理下植物全基因组尺度下的基因表达分析 | 第17页 |
| 1.2 基因芯片技术及其在植物基因表达分析中的应用 | 第17-19页 |
| 1.3 WRKY转录因子的研究进展 | 第19-20页 |
| 1.3.1 WRKY转录因子的结构和分类 | 第19页 |
| 1.3.2 WRKY转录因子的功能 | 第19-20页 |
| 1.3.3 水稻全基因组的WRKY基因表达谱研究 | 第20页 |
| 1.4 研究目的与意义 | 第20-23页 |
| 第二章 NO处理下水稻全基因组差异基因表达谱分析 | 第23-43页 |
| 2.1 实验材料 | 第23页 |
| 2.1.1 水稻材料与芯片 | 第23页 |
| 2.1.2 主要仪器与试剂 | 第23页 |
| 2.2 实验方法 | 第23-25页 |
| 2.2.1 水稻材料培养与硝普钠处理 | 第23页 |
| 2.2.2 叶绿素含量测定 | 第23-24页 |
| 2.2.3 RNA提取、纯化和反转录 | 第24页 |
| 2.2.4 芯片杂交和数据标准化 | 第24页 |
| 2.2.5 数据筛选、聚类和功能分类 | 第24-25页 |
| 2.2.6 qRT-PCR分析 | 第25页 |
| 2.3 结果与分析 | 第25-39页 |
| 2.3.1 微阵列数据相关性分析 | 第25页 |
| 2.3.2 NO处理下各时间点水稻叶片叶绿素含量测定 | 第25-26页 |
| 2.3.3 NO处理下差异表达基因分析 | 第26-27页 |
| 2.3.4 NO响应基因的鉴定 | 第27-28页 |
| 2.3.5 NO响应基因的GO分析 | 第28-29页 |
| 2.3.6 NO响应基因的pathway分析 | 第29-31页 |
| 2.3.7 NO响应基因的表达规律分析 | 第31-33页 |
| 2.3.8 NO响应基因的主要功能分类 | 第33-38页 |
| 2.3.8.1 胁迫响应 | 第33页 |
| 2.3.8.2 氧化还原 | 第33页 |
| 2.3.8.3 生长发育 | 第33-34页 |
| 2.3.8.4 激素代谢 | 第34页 |
| 2.3.8.5 次级代谢 | 第34-35页 |
| 2.3.8.6 氮代谢 | 第35-36页 |
| 2.3.8.7 光合作用中的光反应 | 第36-37页 |
| 2.3.8.8 转录因子 | 第37-38页 |
| 2.3.8.9 大的酶家族 | 第38页 |
| 2.3.9 基因表达水平的qRT-PCR验证 | 第38-39页 |
| 2.4 讨论 | 第39-43页 |
| 第三章 水稻WRKY转录因子基因家族响应外源一氧化氮的表达谱分析 | 第43-53页 |
| 3.1 实验材料 | 第43页 |
| 3.2 实验方法 | 第43-44页 |
| 3.3 结果与分析 | 第44-50页 |
| 3.3.1 NO处理下WRKY基因的差异表达分析 | 第44-47页 |
| 3.3.2 NO响应的WRKY基因的GO分析和通路分析 | 第47-48页 |
| 3.3.3 NO响应的WRKY基因的表达聚类分析 | 第48-49页 |
| 3.3.4 基因表达水平的qRT-PCR验证 | 第49-50页 |
| 3.4 讨论 | 第50-53页 |
| 第四章 结论与展望 | 第53-55页 |
| 4.1 主要结论 | 第53页 |
| 4.2 展望 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-65页 |
| 致谢 | 第65-67页 |
| 附录A（攻读学位期间发表论文目录） | 第67-69页 |
| 附录B（附加数据） | 第69-115页 |
