两物种小系统发育问题的算法研究
| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-19页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第9页 |
| 1.2 遗传学的相关概念 | 第9-14页 |
| 1.2.1 染色体 | 第9-10页 |
| 1.2.2 DNA和RNA | 第10-11页 |
| 1.2.3 遗传物质 | 第11-12页 |
| 1.2.4 分子的进化模式 | 第12-14页 |
| 1.3 系统发育问题 | 第14-17页 |
| 1.3.1 系统发育问题概述 | 第14-15页 |
| 1.3.2 系统发育树 | 第15-16页 |
| 1.3.3 系统发育问题分类 | 第16页 |
| 1.3.4 研究现状 | 第16-17页 |
| 1.4 论文主要研究内容 | 第17-18页 |
| 1.5 论文结构安排 | 第18-19页 |
| 第2章 G2SP：求解DAL模型的遗传算法 | 第19-38页 |
| 2.1 问题以及符号定义 | 第19-20页 |
| 2.2 复制-丢失进化模型 | 第20-22页 |
| 2.3 问题求解方法 | 第22-31页 |
| 2.3.1 ALIGN算法 | 第22-24页 |
| 2.3.2 LABLE算法 | 第24-26页 |
| 2.3.3 遗传算法G2SP | 第26-31页 |
| 2.4 实验结果与分析 | 第31-37页 |
| 2.4.1 实验数据 | 第32页 |
| 2.4.2 性能评价 | 第32-37页 |
| 2.5 本章小结 | 第37-38页 |
| 第3章 系统发育重建软件包的实现与使用 | 第38-45页 |
| 3.1 系统描述 | 第38页 |
| 3.2 参数设置 | 第38-40页 |
| 3.3 读入生物数据 | 第40-42页 |
| 3.4 重建祖先 | 第42页 |
| 3.5 查看结果 | 第42-44页 |
| 3.6 本章小结 | 第44-45页 |
| 第4章 结束语 | 第45-46页 |
| 4.1 总结 | 第45页 |
| 4.2 展望 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-49页 |
| 附录 | 第49-51页 |
| 攻读硕士期间发表论文 | 第51-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
