| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-16页 |
| 1.1 研究背景 | 第10-13页 |
| 1.1.1 长链非编码RNA的研究背景 | 第10-12页 |
| 1.1.2 时间序列基因表达谱数据的研究背景 | 第12-13页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第13-14页 |
| 1.2.1 长链非编码RNA | 第13-14页 |
| 1.2.2 时间序列基因表达谱数据 | 第14页 |
| 1.3 论文组织结构 | 第14-16页 |
| 第2章 与肿瘤相关的lncRNA功能推断及靶标识别 | 第16-48页 |
| 2.1 数据准备 | 第17-23页 |
| 2.1.1 数据库介绍 | 第17-21页 |
| 2.1.2 数据下载 | 第21-22页 |
| 2.1.3 探针重注释 | 第22-23页 |
| 2.1.4 归一化与预处理 | 第23页 |
| 2.2 鉴定癌症与正常组织中差异表达的基因和lncRNA | 第23-30页 |
| 2.3 lncRNA和编码基因相互作用网络的构建 | 第30-37页 |
| 2.3.1 lncRNA与编码基因的共表达网络 | 第31-34页 |
| 2.3.2 lncRNA与lncRNA相互作用网络 | 第34-37页 |
| 2.4 与胃癌高度相关的lncRNA推断 | 第37-39页 |
| 2.5 与胃癌相关的差异表达的编码基因的功能和miRNA靶标分析 | 第39-40页 |
| 2.6 lncRNA的功能富集分析和功能推断 | 第40-42页 |
| 2.7 lncRNA-疾病和lncRNA-癌症关系 | 第42页 |
| 2.8 胃癌中可以分泌入体液的蛋白候选标志物的推论 | 第42-45页 |
| 2.9 预测胃癌组合生物标志物分类能力的验证 | 第45-48页 |
| 第3章 转录组数据多分辨形状聚类分析 | 第48-63页 |
| 3.1 用小波算法进行分解 | 第48-49页 |
| 3.2 分形尺度的计算 | 第49-57页 |
| 3.3 多分辨形状混合模型聚类算法分析 | 第57-63页 |
| 第4章 总结与展望 | 第63-64页 |
| 4.1 总结 | 第63页 |
| 4.2 展望 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-69页 |
| 作者简介及在学期间所取得的科研成果 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
