| 中文摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第11-30页 |
| 1.1 阿特拉津概述 | 第11-16页 |
| 1.1.1 阿特拉津除草机理 | 第11页 |
| 1.1.2 阿特拉津的危害及污染现状 | 第11-13页 |
| 1.1.3 阿特拉津的降解 | 第13-16页 |
| 1.2 菌根概述 | 第16-24页 |
| 1.2.1 AMF简介 | 第16-18页 |
| 1.2.2 AMF与土壤结构 | 第18-21页 |
| 1.2.3 AMF与植物防御和胁迫 | 第21-23页 |
| 1.2.4 真菌与农药降解 | 第23-24页 |
| 1.3 苜蓿概述 | 第24-26页 |
| 1.4 转录组概述 | 第26-28页 |
| 1.5 实验目的意义与技术路线 | 第28-30页 |
| 第2章 材料与方法 | 第30-46页 |
| 2.1 实验材料 | 第30-33页 |
| 2.1.1 供试菌种及植株 | 第30页 |
| 2.1.2 主要仪器设备 | 第30-31页 |
| 2.1.3 主要试剂配置方法 | 第31-33页 |
| 2.2 实验方法 | 第33-46页 |
| 2.2.1 实验设计 | 第33-35页 |
| 2.2.2 菌根侵染率检测 | 第35-36页 |
| 2.2.3 土壤中阿特拉津降解率测定 | 第36-37页 |
| 2.2.4 土壤中酶活性的测定 | 第37-38页 |
| 2.2.5 苜蓿根部RNA提取与质量检测 | 第38-40页 |
| 2.2.6 Illumina测序及denovo装配 | 第40-42页 |
| 2.2.7 组装后功能注释 | 第42-43页 |
| 2.2.8 表达差异分析 | 第43-44页 |
| 2.2.9 差异表达基因检验（RT-PCR检验） | 第44-46页 |
| 第3章 实验结果与分析 | 第46-67页 |
| 3.1 苜蓿培养结果 | 第46-47页 |
| 3.2 菌根侵染情况检测 | 第47-48页 |
| 3.3 土壤中阿特拉津测定结果 | 第48-51页 |
| 3.4 土壤中关键酶活性测定结果 | 第51-56页 |
| 3.5 苜蓿根部RNA提取及质检 | 第56-57页 |
| 3.6 ILLUMINA测序及DENOVO装配 | 第57-61页 |
| 3.6.1 原始数据质控 | 第57-59页 |
| 3.6.2 测序数据质量剪切及统计 | 第59-60页 |
| 3.6.3 转录组从头组装 | 第60-61页 |
| 3.7 组装后功能注释结果 | 第61-64页 |
| 3.8 实验组与对照组差异表达分析 | 第64-65页 |
| 3.9 RT-PCR检验结果 | 第65-67页 |
| 第4章 讨论 | 第67-75页 |
| 4.1 苜蓿培养结果分析 | 第67-68页 |
| 4.2 菌根侵染率测定分析 | 第68-69页 |
| 4.3 土壤阿特拉津提取分析 | 第69-70页 |
| 4.3.1 试验阿特拉津浓度选取 | 第69页 |
| 4.3.2 阿特拉津土壤提取 | 第69-70页 |
| 4.4 土壤酶活性测定分析 | 第70页 |
| 4.5 RNA提取优化 | 第70-71页 |
| 4.6 差异基因表达分析 | 第71-74页 |
| 4.6.1 抗病、抗逆境基因 | 第71-72页 |
| 4.6.2 电子传递链相关基因 | 第72-73页 |
| 4.6.3 胞外酶相关基因 | 第73-74页 |
| 4.6.4 锌指蛋白 | 第74页 |
| 4.7 RT-PCR检验 | 第74-75页 |
| 结论 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-90页 |
| 附表 | 第90-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第93页 |