摘要 | 第4-6页 |
abstract | 第6-7页 |
引言 | 第13-21页 |
0.1 24-脱氢胆固醇还原酶(DHCR24)的蛋白结构和功能研究 | 第13-14页 |
0.2 泛素化修饰与阿尔茨海默症 | 第14-16页 |
0.3 DHCR24与DHCR7相互作用的研究 | 第16-17页 |
0.4 DHCR24与MDM2蛋白相互作用研究 | 第17-19页 |
0.5 蛋白对接及其发展现状 | 第19页 |
0.6 研究目的及意义 | 第19-21页 |
第1章 PC12神经细胞中DHCR24泛素化修饰的研究 | 第21-38页 |
1.1 引言 | 第21-22页 |
1.2 实验材料 | 第22-25页 |
1.2.1 生化试剂耗材 | 第22-23页 |
1.2.2 主要仪器设备 | 第23-24页 |
1.2.3 试剂配制 | 第24-25页 |
1.3 实验方法 | 第25-32页 |
1.3.1 PC12细胞培养 | 第25-28页 |
1.3.1.1 PC12细胞复苏 | 第26页 |
1.3.1.2 PC12细胞传代 | 第26页 |
1.3.1.3 PC12细胞冻存传代 | 第26-27页 |
1.3.1.4 PC12细胞腺病毒转染 | 第27页 |
1.3.1.5 MG132加药处理 | 第27-28页 |
1.3.1.6 PC12细胞总蛋白提取 | 第28页 |
1.3.2 免疫共沉淀法确认DHCR24泛素化修饰 | 第28-32页 |
1.3.2.1 PC12细胞总蛋白浓度测定 | 第28-29页 |
1.3.2.2 免疫共沉淀 | 第29页 |
1.3.2.3 蛋白电泳Western blotting验证 | 第29-31页 |
1.3.2.4 MG132对DHCR24泛素化修饰的影响 | 第31页 |
1.3.2.5 蛋白酶体抑制剂MG132对PC12细胞氧化应激的实验 | 第31-32页 |
1.4 结果与讨论 | 第32-37页 |
1.4.1 MG132刺激下对PC12细胞中蛋白泛素化修饰的影响的确认 | 第32-33页 |
1.4.2 MG132对DHCR24泛素化修饰影响研究 | 第33-34页 |
1.4.3 MG132对DHCR24泛素化修饰影响结果分析 | 第34-37页 |
1.5 结论 | 第37-38页 |
第2章 DHCR24泛素化位点的预测研究 | 第38-46页 |
2.1 引言 | 第38页 |
2.2 泛素化修饰位点预测工具 | 第38-39页 |
2.2.1 Ubipred | 第38页 |
2.2.2 UbPred | 第38页 |
2.2.3 CKSAAP-UbSite | 第38-39页 |
2.3 DHCR24泛素化修饰位点预测方法 | 第39页 |
2.4 结果与讨论 | 第39-45页 |
2.4.1 Ubipred泛素化修饰位点预测结果分析 | 第39-41页 |
2.4.2 UbPred泛素化修饰位点预测结果分析 | 第41-42页 |
2.4.3 CKSAAP_ubsite泛素化修饰位点预测结果分析 | 第42-45页 |
2.5 结论 | 第45-46页 |
第3章 分子动力学方法对DHCR24与MDM2蛋白相互作用的分子机制研究 | 第46-54页 |
3.1 引言 | 第46页 |
3.2 模拟软件 | 第46-47页 |
3.2.1 Z-DOCK | 第46页 |
3.2.2 PyMOL | 第46-47页 |
3.3 模拟方法 | 第47-48页 |
3.3.1 蛋白结构获取 | 第47页 |
3.3.2 蛋白质-蛋白质对接 | 第47-48页 |
3.3.2.1 对接策略一:以 DHCR24蛋白上与P53同源序列为相互作用热点进行对接 | 第47页 |
3.3.2.2 对接策略二:以预测泛素化位点为相互作用热点进行对接 | 第47-48页 |
3.4 实验结果与讨论 | 第48-53页 |
3.4.1 DHCR24与MDM2蛋白模型合理性分析 | 第48-49页 |
3.4.2 DHCR24与MDM2蛋白两种对接策略对接结果分析 | 第49-53页 |
3.5 结论 | 第53-54页 |
第4章 结果与展望 | 第54-56页 |
致谢 | 第56-58页 |
参考文献 | 第58-64页 |
攻读学位期间发表学术论文及参加科研情况 | 第64-65页 |