| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 第1章 前言 | 第12-29页 |
| 1.1 蛋白质组学概述 | 第12-15页 |
| 1.1.1 蛋白质组学样品制备的主要策略 | 第13-14页 |
| 1.1.2 蛋白的质谱鉴定 | 第14-15页 |
| 1.2 蛋白质组学的定量策略 | 第15-21页 |
| 1.2.1 稳定同位素的代谢标记法 | 第17-18页 |
| 1.2.2 体外化学标记 | 第18-19页 |
| 1.2.3 无标记（label free）定量法 | 第19-21页 |
| 1.2.4 基于靶向蛋白质组学策略的定量 | 第21页 |
| 1.2.5 基于DIA的定量 | 第21页 |
| 1.3 稳定同位素~(15)N的代谢标记法在植物蛋白质组学研究的应用 | 第21-25页 |
| 1.3.1 ~(15)N在植物体内的转运和同化 | 第21-24页 |
| 1.3.2 ~(15)N标记方法在植物的应用 | 第24-25页 |
| 1.4 植物响应H_2O_2的分子机制 | 第25-28页 |
| 1.4.1 植物细胞ROS的产生与清除 | 第25-26页 |
| 1.4.2 H_2O_2介导的植物生长发育及抗逆等生物学过程 | 第26-27页 |
| 1.4.3 细胞响应H_2O_2分子机制的研究进展 | 第27页 |
| 1.4.4 植物响应H_2O_2的蛋白质组学研究进展 | 第27-28页 |
| 1.5 问题的提出和本研究的目的及意义 | 第28-29页 |
| 1.5.1 问题的提出 | 第28页 |
| 1.5.2 本研究的目的 | 第28页 |
| 1.5.3 本研究的意义 | 第28-29页 |
| 第2章 适合稳定同位素~(15)N标记水稻幼苗的培养方法的建立 | 第29-39页 |
| 2.1 本章引论 | 第29页 |
| 2.2 材料与方法 | 第29-30页 |
| 2.2.1 植物材料 | 第29页 |
| 2.2.2 培养方法 | 第29-30页 |
| 2.3 结果与分析 | 第30-38页 |
| 2.3.1 稳定同位素~(15)N标记水稻的策略 | 第30-33页 |
| 2.3.2 水稻材料及培养条件的选择 | 第33-35页 |
| 2.3.3 去胚乳水稻幼苗培养条件的优化 | 第35-38页 |
| 2.4 本章小结 | 第38-39页 |
| 第3章 水稻幼苗稳定同位素~(15)N标记效率的检测 | 第39-53页 |
| 3.1 本章引论 | 第39页 |
| 3.2 材料与方法 | 第39-41页 |
| 3.2.1 植物材料 | 第39页 |
| 3.2.2 总蛋白提取/酶解 | 第39-40页 |
| 3.2.3 LC-MS/MS分析 | 第40页 |
| 3.2.4 数据分析 | 第40-41页 |
| 3.3 结果与分析 | 第41-52页 |
| 3.3.1 ~(15)N标记质谱数据的蛋白鉴定软件 | 第41-42页 |
| 3.3.2 ~(15)N标记率计算软件的选择及其原理 | 第42-44页 |
| 3.3.3 水稻幼苗在~(15)N标记时间时的标记率 | 第44-48页 |
| 3.3.4 水稻幼苗不同组织的~(15)N标记率 | 第48-50页 |
| 3.3.5 水稻幼苗在~(14)N营养液和~(15)N营养液中的生长表型 | 第50-52页 |
| 3.4 本章小结 | 第52-53页 |
| 第4章 稳定同位素~(15)N标记水稻幼苗的定量效率的检测 | 第53-61页 |
| 4.1 本章引论 | 第53页 |
| 4.2 方法 | 第53页 |
| 4.2.1 水稻材料及蛋白提取、SDS-PAGE和胶内酶解 | 第53页 |
| 4.2.2 LC-MS/MS 分析 | 第53页 |
| 4.2.3 蛋白的鉴定与定量 | 第53页 |
| 4.3 结果与分析 | 第53-60页 |
| 4.3.1 蛋白定量软件的选择 | 第53-55页 |
| 4.3.2 Census软件定量蛋白的原理 | 第55-57页 |
| 4.3.3 质谱仪的选择 | 第57-58页 |
| 4.3.4 ~(15)N标记水稻幼苗的定量蛋白质组分析的技术路线 | 第58-59页 |
| 4.3.5 ~(15)N标记方法对已知比例的蛋白混合样品进行定量分析 | 第59-60页 |
| 4.4 本章小结 | 第60-61页 |
| 第5章 SILARS技术应用于水稻幼苗响应H_2O_2胁迫的定量蛋白质组学研究 | 第61-79页 |
| 5.1 本章引论 | 第61页 |
| 5.2 材料与方法 | 第61-62页 |
| 5.2.1 水稻幼苗的生理实验 | 第61-62页 |
| 5.2.2 SILARS水稻幼苗的培养、总蛋白提取和酶解 | 第62页 |
| 5.2.3 LC-MS/MS分析 | 第62页 |
| 5.2.4 数据分析 | 第62页 |
| 5.3 结果与分析 | 第62-78页 |
| 5.3.1 不同浓度H_2O_2处理对水稻幼苗根系生长的影响 | 第62-65页 |
| 5.3.2 外源H_2O_2处理对水稻幼苗根系生理的影响 | 第65-66页 |
| 5.3.3 SILARS技术应用于H_2O_2胁迫蛋白质组学的技术流程 | 第66-68页 |
| 5.3.4 对SILARS定量的H_2O_2响应蛋白进行总体分析 | 第68-69页 |
| 5.3.5 SILARS的定量结果与其它研究的比较 | 第69-72页 |
| 5.3.6 SILARS定量的H_2O_2响应蛋白的功能分类 | 第72-75页 |
| 5.3.7 SILARS鉴定的部分重要H_2O_2响应蛋白 | 第75-78页 |
| 5.4 本章小结 | 第78-79页 |
| 第6章 探讨稳定同位素~(15)N标记水稻种子的策略 | 第79-84页 |
| 6.1 本章引论 | 第79页 |
| 6.2 实验方法 | 第79页 |
| 6.3 结果与分析 | 第79-83页 |
| 6.3.1 ~(15)N高效标记的几种主要策略 | 第79-80页 |
| 6.3.2 ~(15)N标记水稻种子的实验流程 | 第80-81页 |
| 6.3.3 ~(15)N长期培养时的水稻植株表型 | 第81-82页 |
| 6.3.4 ~(15)N标记水稻种子的表型 | 第82页 |
| 6.3.5 ~(15)N标记水稻种子的实验成本 | 第82-83页 |
| 6.4 本章小结 | 第83-84页 |
| 第7章 讨论与展望 | 第84-92页 |
| 7.1 讨论 | 第84-90页 |
| 7.1.1 稳定同位素标记方法的发展 | 第84-87页 |
| 7.1.2 SILARS技术的关键要点 | 第87页 |
| 7.1.3 质谱数据的处理 | 第87-88页 |
| 7.1.4 SILARS的实验成本 | 第88-89页 |
| 7.1.5 SILARS技术的优势与不足 | 第89-90页 |
| 7.2 展望 | 第90-92页 |
| 7.2.1 SILARS技术在水稻研究中的应用 | 第90-91页 |
| 7.2.2 SILARS技术对小麦、玉米等其它作物的借鉴意义 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-102页 |
| 致谢 | 第102-104页 |
| 附录A 水稻幼苗H_2O_2响应蛋白及其功能分类 | 第104-122页 |
| 附录B 水稻幼苗H_2O_2响应蛋白的unique肽段及基本特征 | 第122-137页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第137页 |
