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魔芋内参基因筛选及HSFA1基因表达分析

摘要第6-8页
Abstract第8-10页
第1章 文献综述第11-25页
    1.1 基因表达研究简史第11页
    1.2 实时荧光定量PCR技术第11-15页
        1.2.1 PCR第11-12页
        1.2.2 RT-qPCR简介第12页
        1.2.3 RT-qPCR的数值原理第12-13页
        1.2.4 荧光物质第13页
        1.2.5 定量方法第13-14页
        1.2.6 RT-qPCR的优越性及缺陷第14页
        1.2.7 影响RT-qPCR的因素第14-15页
    1.3 内参基因第15-18页
        1.3.1 内参基因的定义第15页
        1.3.2 理想型内参基因第15-16页
        1.3.3 常见的内参基因第16页
        1.3.4 植物内参基因研究第16-18页
    1.4 内参基因分析软件第18-19页
        1.4.1 geNorm软件简介第18页
        1.4.2 NormFinder软件简介第18页
        1.4.3 Bestkeeper软件简介第18-19页
    1.5 热激转录因子HSF基因第19-22页
        1.5.1 HSF基因的基本结构第19-21页
        1.5.2 HSFA1基因简述第21-22页
    1.6 魔芋简介第22-25页
第2章 前言第25-27页
第3章 魔芋内参基因的筛选第27-55页
    3.1 实验材料第27-28页
        3.1.1 供试材料第27页
        3.1.2 实验试剂第27页
        3.1.3 主要的实验仪器第27-28页
    3.2 实验方法第28-36页
        3.2.1 总RNA的提取第28-30页
        3.2.2 cDNA合成第30-31页
        3.2.3 引物设计第31-32页
        3.2.4 内参基因片段克隆第32-35页
        3.2.5 各基因RT-qPCR分析第35页
        3.2.6 数据分析第35-36页
    3.3 结果及分析第36-52页
        3.3.1 不同样本总RNA的提取第36页
        3.3.2 候选内参基因的克隆第36-37页
        3.3.3 候选内参基因生物信息学分析第37-38页
        3.3.4 引物的特异性及扩增效率第38-41页
        3.3.5 候选内参基因的Cq值第41页
        3.3.6 geNorm分析第41-47页
        3.3.7 NormFinder分析第47-48页
        3.3.8 Bestkeeper分析第48-50页
        3.3.9 校正SHSP表达第50-52页
    3.4 讨论第52-55页
第4章 魔芋HSFA1基因的克隆及表达分析第55-79页
    4.1 实验材料第55页
        4.1.1 供试材料第55页
        4.1.2 实验试剂第55页
        4.1.3 主要仪器第55页
    4.2 实验方法第55-61页
        4.2.1 RNA提取第55页
        4.2.2 第一链cDNA合成第55页
        4.2.3 HSFA1基因中间片段克隆第55-56页
        4.2.4 HSFA1基因全长分离第56-59页
        4.2.5 生物信息学分析第59-60页
        4.2.6 AkHSFA1和AaHSFA1蛋白亚细胞定位第60-61页
        4.2.7 HSFA1基因的RT-qPCR分析第61页
    4.3 结果及分析第61-74页
        4.3.1 HSFA1基因同源片段的克隆第61-62页
        4.3.2 HSFA1基因全长分离第62-64页
        4.3.3 AaHSFA1和AkHSFA1生物信息学分析第64-71页
        4.3.4 AkHSFA1和AaHSFA1蛋白的亚细胞定位分析第71-72页
        4.3.5 AkHSFA1和AaHSFA1基因的表达模式分析第72-74页
    4.4 讨论第74-79页
第5章 结论与展望第79-81页
    5.1 克隆了白魔芋、花魔芋中9个内参基因第79页
    5.2 比较了三种实验条件下两个魔芋种中稳定的内参基因第79页
    5.3 成功克隆了两个魔芋种的HSFA1基因第79-80页
    5.4 分析了两个蛋白洋葱表皮细胞中的定位情况第80页
    5.5 鉴定了两个魔芋种中HSFA1基因不同组织的相对表达模式第80页
    5.6 展望第80-81页
参考文献第81-91页
附录第91-97页
致谢第97-99页
在校期间发表的论文第99页

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