摘要 | 第6-8页 |
Abstract | 第8-10页 |
第1章 文献综述 | 第11-25页 |
1.1 基因表达研究简史 | 第11页 |
1.2 实时荧光定量PCR技术 | 第11-15页 |
1.2.1 PCR | 第11-12页 |
1.2.2 RT-qPCR简介 | 第12页 |
1.2.3 RT-qPCR的数值原理 | 第12-13页 |
1.2.4 荧光物质 | 第13页 |
1.2.5 定量方法 | 第13-14页 |
1.2.6 RT-qPCR的优越性及缺陷 | 第14页 |
1.2.7 影响RT-qPCR的因素 | 第14-15页 |
1.3 内参基因 | 第15-18页 |
1.3.1 内参基因的定义 | 第15页 |
1.3.2 理想型内参基因 | 第15-16页 |
1.3.3 常见的内参基因 | 第16页 |
1.3.4 植物内参基因研究 | 第16-18页 |
1.4 内参基因分析软件 | 第18-19页 |
1.4.1 geNorm软件简介 | 第18页 |
1.4.2 NormFinder软件简介 | 第18页 |
1.4.3 Bestkeeper软件简介 | 第18-19页 |
1.5 热激转录因子HSF基因 | 第19-22页 |
1.5.1 HSF基因的基本结构 | 第19-21页 |
1.5.2 HSFA1基因简述 | 第21-22页 |
1.6 魔芋简介 | 第22-25页 |
第2章 前言 | 第25-27页 |
第3章 魔芋内参基因的筛选 | 第27-55页 |
3.1 实验材料 | 第27-28页 |
3.1.1 供试材料 | 第27页 |
3.1.2 实验试剂 | 第27页 |
3.1.3 主要的实验仪器 | 第27-28页 |
3.2 实验方法 | 第28-36页 |
3.2.1 总RNA的提取 | 第28-30页 |
3.2.2 cDNA合成 | 第30-31页 |
3.2.3 引物设计 | 第31-32页 |
3.2.4 内参基因片段克隆 | 第32-35页 |
3.2.5 各基因RT-qPCR分析 | 第35页 |
3.2.6 数据分析 | 第35-36页 |
3.3 结果及分析 | 第36-52页 |
3.3.1 不同样本总RNA的提取 | 第36页 |
3.3.2 候选内参基因的克隆 | 第36-37页 |
3.3.3 候选内参基因生物信息学分析 | 第37-38页 |
3.3.4 引物的特异性及扩增效率 | 第38-41页 |
3.3.5 候选内参基因的Cq值 | 第41页 |
3.3.6 geNorm分析 | 第41-47页 |
3.3.7 NormFinder分析 | 第47-48页 |
3.3.8 Bestkeeper分析 | 第48-50页 |
3.3.9 校正SHSP表达 | 第50-52页 |
3.4 讨论 | 第52-55页 |
第4章 魔芋HSFA1基因的克隆及表达分析 | 第55-79页 |
4.1 实验材料 | 第55页 |
4.1.1 供试材料 | 第55页 |
4.1.2 实验试剂 | 第55页 |
4.1.3 主要仪器 | 第55页 |
4.2 实验方法 | 第55-61页 |
4.2.1 RNA提取 | 第55页 |
4.2.2 第一链cDNA合成 | 第55页 |
4.2.3 HSFA1基因中间片段克隆 | 第55-56页 |
4.2.4 HSFA1基因全长分离 | 第56-59页 |
4.2.5 生物信息学分析 | 第59-60页 |
4.2.6 AkHSFA1和AaHSFA1蛋白亚细胞定位 | 第60-61页 |
4.2.7 HSFA1基因的RT-qPCR分析 | 第61页 |
4.3 结果及分析 | 第61-74页 |
4.3.1 HSFA1基因同源片段的克隆 | 第61-62页 |
4.3.2 HSFA1基因全长分离 | 第62-64页 |
4.3.3 AaHSFA1和AkHSFA1生物信息学分析 | 第64-71页 |
4.3.4 AkHSFA1和AaHSFA1蛋白的亚细胞定位分析 | 第71-72页 |
4.3.5 AkHSFA1和AaHSFA1基因的表达模式分析 | 第72-74页 |
4.4 讨论 | 第74-79页 |
第5章 结论与展望 | 第79-81页 |
5.1 克隆了白魔芋、花魔芋中9个内参基因 | 第79页 |
5.2 比较了三种实验条件下两个魔芋种中稳定的内参基因 | 第79页 |
5.3 成功克隆了两个魔芋种的HSFA1基因 | 第79-80页 |
5.4 分析了两个蛋白洋葱表皮细胞中的定位情况 | 第80页 |
5.5 鉴定了两个魔芋种中HSFA1基因不同组织的相对表达模式 | 第80页 |
5.6 展望 | 第80-81页 |
参考文献 | 第81-91页 |
附录 | 第91-97页 |
致谢 | 第97-99页 |
在校期间发表的论文 | 第99页 |