| 摘要 | 第9-12页 |
| Abstract | 第12-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-32页 |
| 1.1 表观遗传学研究进展 | 第16-24页 |
| 1.1.1 表观遗传学调控的主要分子机制 | 第16-24页 |
| 1.1.1.2 组蛋白修饰 | 第19-23页 |
| 1.1.1.3 非编码RNA | 第23-24页 |
| 1.2 KDM4C | 第24-26页 |
| 1.2.1 KDM4C的基因结构 | 第25页 |
| 1.2.2 KDM4C的生物学功能 | 第25-26页 |
| 1.2.3 KDM4C的研究前景 | 第26页 |
| 1.3 ATF4 | 第26-32页 |
| 1.3.1 ATF4基因结构及表达蛋白 | 第26-27页 |
| 1.3.2 ATF4的生物学功能 | 第27-29页 |
| 1.3.3 ATF4与肿瘤 | 第29-30页 |
| 1.3.4 ATF4的发展前景 | 第30-32页 |
| 第二章 引言 | 第32-36页 |
| 2.1 研究背景及意义 | 第32-33页 |
| 2.2 主要研究内容 | 第33-35页 |
| 2.2.1 KDM4C基因沉默对肿瘤细胞增殖及其丝氨酸生物合成信号通路的影响 | 第33-34页 |
| 2.2.2 KDM4C过表达对肿瘤细胞增殖及其丝氨酸生物合成信号通路的影响 | 第34页 |
| 2.2.3 Microarray检测过表达KDM4C对肿瘤细胞基因表达 | 第34页 |
| 2.2.4 KDM4C直接激活ATF4并与其共同激活丝氨酸生物合成通路 | 第34-35页 |
| 2.3 研究技术路线 | 第35-36页 |
| 第三章 KDM4C基因沉默对肿瘤细胞增殖及其丝氨酸生物合成信号通路的影响 | 第36-54页 |
| 3.1 实验材料、仪器与试剂 | 第36-38页 |
| 3.1.1 主要实验材料 | 第36页 |
| 3.1.2 主要实验仪器 | 第36-37页 |
| 3.1.3 主要实验试剂 | 第37-38页 |
| 3.2 实验方法 | 第38-46页 |
| 3.2.1 肿瘤细胞系的培养与增殖实验 | 第38页 |
| 3.2.2 真核细胞的瞬时转染 | 第38-39页 |
| 3.2.3 真核细胞的慢病毒感染和稳定细胞系的筛选 | 第39-40页 |
| 3.2.4 真核细胞免疫荧光实验 (Immunofluorescence, IF) | 第40页 |
| 3.2.5 Western blotting检测 | 第40-42页 |
| 3.2.6 实时荧光定量PCR(Real-time qPCR, RT-qPCR) | 第42-44页 |
| 3.2.7 软琼脂克隆形成实验 (Soft Agar Colony Formation Assay) | 第44页 |
| 3.2.8 染色质免疫沉淀实验(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP) | 第44-46页 |
| 3.2.9 统计学方法 | 第46页 |
| 3.3 实验结果 | 第46-53页 |
| 3.3.1 沉默KDM4C对其他KDM4家族基因和H3K9甲基化水平的影响 | 第46-48页 |
| 3.3.2 沉默KDM4C对细胞增殖和克隆形成能力的影响 | 第48-50页 |
| 3.3.3 沉默KDM4C对丝氨酸生物合成通路的影响 | 第50-53页 |
| 3.4 实验讨论 | 第53-54页 |
| 第四章 KDM4C过表达对肿瘤细胞增殖及其丝氨酸生物合成信号通路的影响 | 第54-72页 |
| 4.1 实验材料、仪器与试剂 | 第54-56页 |
| 4.1.1 主要实验材料 | 第54页 |
| 4.1.2 主要实验仪器 | 第54-55页 |
| 4.1.3 主要实验试剂 | 第55-56页 |
| 4.2 实验方法 | 第56-65页 |
| 4.2.1 肿瘤细胞系的培养与增值实验 | 第56页 |
| 4.2.2 肿瘤细胞的瞬时转染 | 第56-57页 |
| 4.2.3 肿瘤细胞的逆转录病毒感染和稳定细胞系的筛选 | 第57-58页 |
| 4.2.4 肿瘤细胞免疫荧光实验 (Immunofluorescence, IF) | 第58-59页 |
| 4.2.5 Western blotting检测 | 第59-60页 |
| 4.2.6 实时荧光定量PCR(Real-time qPCR, RT-qPCR) | 第60-62页 |
| 4.2.7 软琼脂克隆形成实验 (Soft Agar Colony Formation Assay) | 第62-63页 |
| 4.2.8 染色质免疫沉淀实验(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP) | 第63-65页 |
| 4.2.9 动物体内成瘤实验 | 第65页 |
| 4.2.10 统计学方法 | 第65页 |
| 4.3 实验结果 | 第65-70页 |
| 4.3.1 KDM4C过表达对其他KDM4家族基因和H3K9甲基化水平的影响 | 第65-66页 |
| 4.3.2 KDM4C过表达对细胞增殖和克隆形成能力的影响 | 第66-68页 |
| 4.3.3 KDM4C过表达对丝氨酸生物合成通路的影响 | 第68-70页 |
| 4.4 实验讨论 | 第70-72页 |
| 第五章 Microarray检测过表达KDM4C对肿瘤细胞基因表达谱改变的研究 | 第72-91页 |
| 5.1 实验材料、仪器与试剂 | 第72-73页 |
| 5.1.1 主要实验材料 | 第72页 |
| 5.1.2 主要实验仪器 | 第72-73页 |
| 5.1.3 主要实验试剂 | 第73页 |
| 5.2 实验材料、仪器与试剂 | 第73-80页 |
| 5.2.1 肿瘤细胞系的培养 | 第73页 |
| 5.2.2 肿瘤细胞的逆转录病毒感染和稳定细胞系的筛选 | 第73-75页 |
| 5.2.3 肿瘤细胞总RNA的提取 | 第75页 |
| 5.2.4 实时荧光定量PCR(Real-time qPCR, RT-qPCR) | 第75-77页 |
| 5.2.5 肿瘤细胞总RNA的Microarray分析 | 第77-78页 |
| 5.2.6 Western blotting检测 | 第78-80页 |
| 5.2.7 统计学方法 | 第80页 |
| 5.3 实验结果 | 第80-88页 |
| 5.3.1 细胞总RNA的纯度 | 第80-81页 |
| 5.3.2 KDM4C过表达的情况检测 | 第81页 |
| 5.3.3 过表达KDM4C对肿瘤细胞基因表达谱的影响 | 第81-88页 |
| 5.3.3.1 KDM4C对氨基酸生物合成和转运的转录激活起着核心作用 | 第81-83页 |
| 5.3.3.2 KDM4C是氨基酸代谢过程与细胞周期进程的纽带 | 第83-88页 |
| 5.4 实验讨论 | 第88-91页 |
| 第六章 KDM4C直接激活ATF4并与其共同激活丝氨酸生物合成通路 | 第91-107页 |
| 6.1 实验材料、仪器与试剂 | 第91-93页 |
| 6.1.1 主要实验材料 | 第91页 |
| 6.1.2 主要实验仪器 | 第91-92页 |
| 6.1.3 主要实验试剂 | 第92-93页 |
| 6.2 实验方法 | 第93-100页 |
| 6.2.1 肿瘤细胞系的培养与增值实验 | 第93页 |
| 6.2.2 真核细胞的慢病毒感染和稳定细胞系的筛选 | 第93-94页 |
| 6.2.3 Western blotting检测 | 第94-96页 |
| 6.2.4 实时荧光定量PCR(Real-time qPCR, RT-qPCR) | 第96-98页 |
| 6.2.5 染色质免疫沉淀实验(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP) | 第98-99页 |
| 6.2.6 统计学方法 | 第99-100页 |
| 6.3 实验结果 | 第100-105页 |
| 6.3.1 KDM4C直接调控ATF4基因 | 第100-101页 |
| 6.3.2 KDM4C调控ATF4的生理学功能 | 第101-103页 |
| 6.3.3 KDM4C需要ATF4共同激活丝氨酸生物合成通路 | 第103-105页 |
| 6.4 实验讨论 | 第105-107页 |
| 第七章 综合与结论 | 第107-111页 |
| 7.1 KDM4C是细胞氨基酸代谢和细胞周期调控间的纽带 | 第107页 |
| 7.2 KDM4C与ATF4蛋白复合体转录调控丝氨酸合成信号通路以及氨基酸代谢 | 第107-109页 |
| 7.3 KDM4C与ATF4蛋白复合体转录调控细胞应激反应 | 第109-111页 |
| 论文创新点 | 第111-113页 |
| 参考文献 | 第113-121页 |
| 附录 | 第121-136页 |
| 博士期间发表文章及课题参研情况 | 第136-138页 |
| 致谢 | 第138-139页 |
