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桃种间SSR、ITS鉴定及叶绿体基因组比较分析

摘要第6-8页
abstract第8-9页
英文缩略表第15-16页
第一章 引言第16-26页
    1.1 课题的提出第16页
    1.2 几种主要的DNA分子标记第16-17页
    1.3 SSR标记研究进展及其在桃上的应用第17-20页
    1.4 ITS标记研究进展第20-22页
    1.5 叶绿体基因组研究进展第22-24页
        1.5.1 叶绿体功能第22页
        1.5.2 叶绿体基因组结构第22-23页
        1.5.3 叶绿体基因组序列多样性第23-24页
        1.5.4 叶绿体基因组的应用第24页
    1.6 本研究的意义、内容第24-26页
第二章 桃种间SSR鉴定及杂种基因型分析第26-39页
    2.1 材料和方法第26-29页
        2.1.1 植物材料第26-27页
        2.1.2 DNA提取与PCR扩增第27-29页
        2.1.3 PCR扩增产物分析及系统进化树构建第29页
    2.2 结果与分析第29-37页
        2.2.1 桃SSR引物扩增与筛选第29-31页
        2.2.2 基于SSR标记桃种间基因型数据库的构建第31-35页
        2.2.3 桃未知种SSR鉴定第35页
        2.2.4 桃种间杂种SSR基因型分析第35-37页
    2.3 讨论第37-38页
    2.4 小结第38-39页
第三章 桃ITS序列特征发掘及种间鉴定第39-54页
    3.1 材料与方法第39-41页
        3.1.1 材料第39-40页
        3.1.2 DNA提取及PCR扩增第40-41页
        3.1.3 克隆测序及序列分析第41页
    3.2 结果与分析第41-52页
        3.2.1 ITS引物PCR扩增第41-42页
        3.2.2 单孢克隆测序第42-44页
        3.2.3 ITS序列分析第44-49页
        3.2.4 桃ITS系统进化树的构建第49-50页
        3.2.5 桃ITS序列种间特异位点分析与验证第50-52页
    3.3 讨论第52页
    3.4 小结第52-54页
第四章 桃叶绿体基因组测序及种间比较分析第54-66页
    4.1 材料与方法第54-55页
        4.1.1 植物材料第54页
        4.1.2 叶绿体DNA提取及质量检测第54页
        4.1.3 叶绿体基因组测序及排列第54页
        4.1.4 基因功能注释第54-55页
        4.1.5 重复结构分析第55页
        4.1.6 基因组比较分析第55页
    4.2 结果与分析第55-64页
        4.2.1 叶绿体DNA质量检测第55-56页
        4.2.2 叶绿体基因组测序与组装第56页
        4.2.3 叶绿体基因组的组织结构第56-60页
        4.2.4 叶绿体基因组SSR分析第60-62页
        4.2.5 桃叶绿体基因组系统进化第62-64页
    4.3 讨论第64-65页
    4.4 小结第65-66页
第五章 全文结论与讨论第66-68页
    5.1 全文结论第66页
    5.2 全文讨论第66-68页
参考文献第68-80页
附录第80-90页
致谢第90-91页
作者简历第91页

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