| 摘要 | 第3-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 第一章 前言 | 第12-21页 |
| 第二章 材料与方法 | 第21-31页 |
| 2.1 材料 | 第21-22页 |
| 2.1.1 样本来源 | 第21页 |
| 2.1.2 序列来源 | 第21页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第21页 |
| 2.1.4 主要仪器 | 第21-22页 |
| 2.1.5 分析软件和工具 | 第22页 |
| 2.2 方法 | 第22-31页 |
| 2.2.1 HIV-1基因亚型鉴定及进化关系分析 | 第22-26页 |
| 2.2.2 HIV-1未知重组毒株序列分析 | 第26-28页 |
| 2.2.3 CRF07_BC毒株P6蛋白7个氨基酸缺失的流行病学描述 | 第28-31页 |
| 第三章 结果 | 第31-57页 |
| 3.1 IDU和MSM人群HIV-1基因亚型分布及进化关系 | 第31-42页 |
| 3.1.1 人群基本情况 | 第31页 |
| 3.1.2 序列扩增结果 | 第31-33页 |
| 3.1.3 基因亚型判定及分布状况 | 第33-35页 |
| 3.1.4 主要基因亚型的系统进化分析 | 第35-40页 |
| 3.1.5 各亚型基因离散率比较 | 第40-42页 |
| 3.2 CRF07_BC/CRF55_01B重组毒株近全长基因组序列分析 | 第42-49页 |
| 3.2.1 GD698近全长基因组序列扩增 | 第42页 |
| 3.2.2 序列比对并构建系统进化树 | 第42-44页 |
| 3.2.3 序列相似性及重组位点分析 | 第44-48页 |
| 3.2.4 其他含有CRF07_BC/CRF55_01B的重组毒株 | 第48-49页 |
| 3.3 CRF07_BC亚型毒株P6蛋白7个氨基酸缺失的流行病学特征 | 第49-57页 |
| 3.3.1 广州地区27条CRF07_BC序列P6蛋白氨基酸变异分析 | 第49-51页 |
| 3.3.2 CRF07_BC亚型P6蛋白序列氨基酸缺失情况 | 第51-52页 |
| 3.3.3 不同人群P6蛋白7个氨基酸缺失序列的时间分布 | 第52-53页 |
| 3.3.4 不同人群P6蛋白7个氨基酸缺失序列的地区分布 | 第53-55页 |
| 3.3.5 P6蛋白7个氨基酸缺失进化分析 | 第55-57页 |
| 第四章 讨论 | 第57-62页 |
| 本研究的创新与不足 | 第62-63页 |
| 全文小结 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-74页 |
| 缩略语词汇表 | 第74-76页 |
| 攻读学位期间成果 | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
