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基于生物信息学的胃癌信号通路与关键基因筛选及PARK2在胃癌中生物学功能的研究

中文摘要第4-7页
Abstract第7-9页
英文缩写词第14-16页
第1章 绪论第16-32页
    1.1 胃癌第16-21页
        1.1.1 胃癌概述第16页
        1.1.2 胃癌的危险因素第16-18页
        1.1.3 胃癌的病理第18-19页
        1.1.4 胃癌的临床症状及诊断第19-20页
        1.1.5 胃癌的治疗第20-21页
    1.2 胃癌的分子水平研究第21-26页
        1.2.1 胃癌相关的基因第21-23页
        1.2.2 胃癌相关的非编码RNA第23-26页
    1.3 生物信息学第26-28页
        1.3.1 生物信息学概述第26页
        1.3.2 生物信息学研究内容第26-27页
        1.3.3 生物信息学与肿瘤研究第27-28页
    1.4 PARK2与肿瘤第28-32页
第2章 基于生物信息学的胃癌信号通路及关键基因研究第32-46页
    2.1 引言第32-33页
    2.2 材料与方法第33-36页
        2.2.1 数据来源第33页
        2.2.2 数据处理与筛选第33-34页
        2.2.3 差异性分析及拷贝数变化分析第34页
        2.2.4 miRNA靶标的预测第34-35页
        2.2.5 基因表达量变化与调控因素变化间的关系第35-36页
        2.2.6 网络构建第36页
        2.2.7 网络信号通路分析及核心基因鉴别第36页
        2.2.8 文献检索分析第36页
    2.3 结果第36-43页
        2.3.1 胃癌各组学数据样本第36-37页
        2.3.2 胃癌多组学变化特点第37-38页
        2.3.3 差异性表达miRNA靶标预测第38-39页
        2.3.4 三组候选基因第39页
        2.3.5 候选基因与调控因素的相关性分析第39-40页
        2.3.6 调控因素影响的基因相互作用网络第40页
        2.3.7 重要的信号通路第40-41页
        2.3.8 网络拓扑分析与关键基因筛选第41-42页
        2.3.9 文献检索及胃癌相关基因网络构建第42-43页
    2.4 本章小结第43-46页
第3章 关键基因在胃癌中的表达及临床意义第46-58页
    3.1 引言第46页
    3.2 材料与方法第46-53页
        3.2.1 实验材料第46-48页
        3.2.2 实验方法第48-52页
        3.2.3 统计方法第52-53页
    3.3 结果第53-56页
        3.3.1 NR3C1及PARK2在胃癌细胞株及正常胃粘膜细胞株中的mRNA表达情况第53-54页
        3.3.2 PARK2蛋白在胃癌细胞株中的表达第54页
        3.3.3 PARK2与胃癌患者临床病理之间的关系第54-56页
    3.4 本章小结第56-58页
第4章 PARK2在胃癌中的功能研究第58-70页
    4.1 研究背景第58页
    4.2 材料与方法第58-62页
        4.2.1 实验材料第58-59页
        4.2.2 实验方法第59-62页
        4.2.3 统计方法第62页
    4.3 结果第62-67页
        4.3.1 PARK2过表达细胞株的构建第62-63页
        4.3.2 PARK2过表达细胞株的鉴定第63-64页
        4.3.3 上调PARK2表达对细胞活力的影响第64-65页
        4.3.4 上调PARK2表达对细胞周期的影响第65-66页
        4.3.5 上调PARK2表达对细胞凋亡的影响第66-67页
    4.4 本章小结第67-70页
第5章 PARK2影响胃癌细胞分子机制的探究第70-78页
    5.1 引言第70页
    5.2 材料与方法第70-71页
        5.2.1 实验材料第70页
        5.2.2 实验方法第70-71页
    5.3 统计方法第71页
    5.4 结果第71-77页
        5.4.1 PARK2相互作用靶标第71-72页
        5.4.2 基因功能富集分析第72-73页
        5.4.3 基因共表达分析第73-75页
        5.4.4 CCNE1与PCNA在过表达PARK2细胞株中m RNA表达量变化第75-76页
        5.4.5 过表达PARK2胃癌细胞株中CCNE1与PCNA蛋白表达量变化第76-77页
    5.5 本章小结第77-78页
第6章 讨论第78-86页
第7章 结论与展望第86-88页
参考文献第88-104页
附件第104-114页
作者简介及博士学习期间所取得的科研成果第114-116页
致谢第116页

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