| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-22页 |
| 1 泥东风螺 | 第12-13页 |
| 2 转录组 | 第13-16页 |
| 2.1 转录组学 | 第13-14页 |
| 2.2 新一代高通量测序技术 | 第14-15页 |
| 2.3 软体动物转录组分析研究进展 | 第15-16页 |
| 3 表达序列标签微卫星 | 第16-19页 |
| 3.1 微卫星 | 第16-17页 |
| 3.2 表达序列标签微卫星 | 第17-18页 |
| 3.3 微卫星标记的应用 | 第18-19页 |
| 4 水生动物线粒体研究进展 | 第19-21页 |
| 4.1 水生动物线粒体基因特点 | 第19页 |
| 4.2 线粒体基因在水生动物中的研究与应用 | 第19-21页 |
| 5 研究目的与意义 | 第21-22页 |
| 第二章 泥东风螺转录组测序与分析 | 第22-44页 |
| 1 试验材料与方法 | 第22-31页 |
| 1.1 试验材料 | 第22-23页 |
| 1.2 主要试剂与仪器 | 第23页 |
| 1.3 cDNA文库构建 | 第23-29页 |
| 1.4 数据处理 | 第29-31页 |
| 2 结果与分析 | 第31-42页 |
| 2.1 RNA提取和转录组文库的构建 | 第31页 |
| 2.2 序列拼接和分析 | 第31-33页 |
| 2.3 泥东风螺转录组中EST-SSR标记分析 | 第33-35页 |
| 2.4 基因开放阅读框及基因拷贝数分析 | 第35-37页 |
| 2.5 功能注释、基因分类和代谢途径分析 | 第37-42页 |
| 3 讨论 | 第42-44页 |
| 3.1 泥东风螺与其它贝类转录组的比较 | 第42-43页 |
| 3.2 泥东风螺转录组中EST-SSR标记 | 第43页 |
| 3.3 泥东风螺转录组数据的生物信息分析 | 第43-44页 |
| 第三章 含EST-SSR序列的生长相关基因发掘与克隆 | 第44-54页 |
| 1 试验材料与方法 | 第45-47页 |
| 1.1 试验材料 | 第45页 |
| 1.2 含EST-SSR序列的生长相关基因发掘 | 第45页 |
| 1.3 RNA提取 | 第45页 |
| 1.4 基因扩增和克隆 | 第45-47页 |
| 2 结果与分析 | 第47-49页 |
| 2.1 含EST-SSR序列的生长相关基因发掘 | 第47页 |
| 2.2 基因克隆 | 第47-48页 |
| 2.3 基因信息分析 | 第48-49页 |
| 3 讨论 | 第49-54页 |
| 3.1 含EST-SSR序列的生长相关基因发掘 | 第49-50页 |
| 3.2 TBC-1基因 | 第50-51页 |
| 3.3 FGFR1基因 | 第51-54页 |
| 第四章 泥东风螺EST-SSR标记开发与利用 | 第54-74页 |
| 1 试验材料和方法 | 第54-58页 |
| 1.1 试验材料 | 第54-55页 |
| 1.2 试验方法 | 第55-58页 |
| 2 结果与分析 | 第58-70页 |
| 2.1 F_1群体形态性状相关性分析 | 第58-61页 |
| 2.2 基因组DNA提取质量 | 第61页 |
| 2.3 PCR扩增条件优化 | 第61页 |
| 2.4 微卫星位点的主要遗传学参数的计算 | 第61-69页 |
| 2.5 泥东风螺野生群体遗传结构 | 第69页 |
| 2.6 EST-SSR标记与生长性状相关性分析 | 第69-70页 |
| 2.7 BL-106位点基因分析 | 第70页 |
| 3 讨论 | 第70-74页 |
| 3.1 人工养殖F_1代泥东风螺生长性状相关性分析 | 第70页 |
| 3.2 泥东风螺EST-SSR标记开发 | 第70-71页 |
| 3.3 EST-SSR标记分析泥东风螺野生群体遗传多样性 | 第71-72页 |
| 3.4 EST-SSR标记与生长性状的相关性分析 | 第72页 |
| 3.5 BL-106位点基因分析 | 第72-74页 |
| 第五章 泥东风螺线粒体基因组序列与群体遗传多样性分析 | 第74-85页 |
| 1 试验材料与方法 | 第74-77页 |
| 1.1 试验材料 | 第74页 |
| 1.2 试验方法 | 第74-77页 |
| 2 结果与分析 | 第77-83页 |
| 2.1 线粒体基因扩增结果 | 第77-79页 |
| 2.2 线粒体基因同源性分析 | 第79页 |
| 2.3 线粒体基因系统进化分析 | 第79-83页 |
| 2.4 泥东风螺三个群体的线粒体基因多态性分析 | 第83页 |
| 3 讨论 | 第83-85页 |
| 3.1 贝类动物线粒体基因的同源性和进化 | 第83页 |
| 3.2 泥东风螺线粒体基因群体遗传多样性分析 | 第83-85页 |
| 小结 | 第85-87页 |
| 参考文献 | 第87-96页 |
| 致谢 | 第96-97页 |
| 作者简历 | 第97页 |
