| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 引言 | 第12-22页 |
| 1.1 冬眠概述 | 第12-16页 |
| 1.1.1 冬眠定义 | 第12页 |
| 1.1.2 冬眠物种的分布 | 第12-13页 |
| 1.1.3 冬眠类型 | 第13页 |
| 1.1.4 冬眠在哺乳动物中的起源 | 第13页 |
| 1.1.5 冬眠期间生理适应 | 第13-15页 |
| 1.1.6 冬眠的功能及其应用 | 第15-16页 |
| 1.2 冬眠分子机制研究现状 | 第16-19页 |
| 1.2.1 冬眠相关基因表达研究 | 第16-18页 |
| 1.2.2 冬眠相关基因适应性进化研究 | 第18-19页 |
| 1.3 马铁菊头蝠及其冬眠相关研究概述 | 第19-21页 |
| 1.3.1 马铁菊头蝠分类地位及其进化谱系概述 | 第19-20页 |
| 1.3.2 马铁菊头蝠冬眠基因研究现状 | 第20-21页 |
| 1.4 本论文研究目的与意义 | 第21-22页 |
| 第二章 马铁菊头蝠冬眠前后肝转录组表达差异研究 | 第22-50页 |
| 2.1 研究背景 | 第22-23页 |
| 2.2 材料与方法 | 第23-33页 |
| 2.2.1 样本采集 | 第23页 |
| 2.2.2 总RNA提取及质量检测 | 第23-24页 |
| 2.2.3 cDNA文库制备及Illumina HiSeq 2000测序 | 第24-25页 |
| 2.2.4 转录组数据拼接及评估 | 第25-26页 |
| 2.2.5 转录组基因表达及定量分析 | 第26-29页 |
| 2.2.6 基因表达差异分析 | 第29-30页 |
| 2.2.7 下游功能注释及富集分析 | 第30页 |
| 2.2.8 实时荧光定量PCR验证 | 第30-33页 |
| 2.3 结果 | 第33-45页 |
| 2.3.1 马铁菊头蝠肝转录组测序结果 | 第33-34页 |
| 2.3.2 马铁菊头蝠肝转录组活跃状态与冬眠状态下基因差异表达结果 | 第34-37页 |
| 2.3.3 qRT-PCR实验验证结果 | 第37页 |
| 2.3.4 GO富集分析结果 | 第37-43页 |
| 2.3.5 KEGG代谢通路富集分析结果 | 第43-45页 |
| 2.4 讨论 | 第45-50页 |
| 2.4.1 马铁菊头蝠冬眠期间代谢变化 | 第45-47页 |
| 2.4.2 马铁菊头蝠冬眠期间免疫变化 | 第47-48页 |
| 2.4.3 马铁菊头蝠冬眠期间分子抗胁迫响应 | 第48-50页 |
| 第三章 马铁菊头蝠ZBED1基因冬眠期间表达差异研究 | 第50-64页 |
| 3.1 研究背景 | 第50-51页 |
| 3.2 材料与方法 | 第51-58页 |
| 3.2.1 样本采集 | 第51-52页 |
| 3.2.2 总RNA提取及质量检测 | 第52-54页 |
| 3.2.3 cDNA合成 | 第54页 |
| 3.2.4 引物设计及合成 | 第54-55页 |
| 3.2.5 qRT-PCR实验 | 第55-58页 |
| 3.3 结果 | 第58-62页 |
| 3.3.1 ZBED1基因冬眠不同时期表达变化 | 第58-59页 |
| 3.3.2 ZBED1基因不同组织中表达变化 | 第59-62页 |
| 3.4 讨论 | 第62-64页 |
| 第四章 马铁菊头蝠ZBED1基因适应性进化研究 | 第64-88页 |
| 4.1 研究背景 | 第64页 |
| 4.2 材料与方法 | 第64-72页 |
| 4.2.1 样本采集 | 第64-66页 |
| 4.2.2 基因组DNA提取及电泳检测 | 第66-67页 |
| 4.2.3 引物设计 | 第67-68页 |
| 4.2.4 PCR扩增及胶回收 | 第68页 |
| 4.2.5 分子克隆及测序 | 第68-69页 |
| 4.2.6 数据分析 | 第69-72页 |
| 4.3 结果 | 第72-86页 |
| 4.3.1 单倍型及单核苷酸多态性分析结果 | 第72-75页 |
| 4.3.2 系统发生分析结果 | 第75-78页 |
| 4.3.3 正选择分析结果 | 第78-86页 |
| 4.4 讨论 | 第86-88页 |
| 第五章 结论与展望 | 第88-90页 |
| 参考文献 | 第90-101页 |
| 附录 | 第101-113页 |
| 附录2-1 差异表达基因显著富集的GO条目 | 第101-108页 |
| 附录2-2 差异表达基因显著富集的KEGG代谢通路 | 第108-113页 |
| 后记 | 第113-115页 |
| 在学期间公开发表论文及著作情况 | 第115页 |
