主要作物持家基因及小麦种子特异基因挖掘
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 1. 文献综述 | 第10-14页 |
| ·持家基因与组织特异性基因 | 第10-11页 |
| ·基因芯片 | 第11-12页 |
| ·表达序列标签 | 第12-13页 |
| ·研究目的 | 第13-14页 |
| 2. 材料与数据 | 第14-19页 |
| ·表达谱芯片 | 第14-16页 |
| ·小麦Affymetrix 61k Chips | 第14页 |
| ·大麦Affymetrix 22k Chips | 第14页 |
| ·水稻Affymetrix 57k Chips | 第14-15页 |
| ·玉米Affymetrix 18k Chips | 第15-16页 |
| ·UniGene、基因组、蛋白数据库 | 第16-19页 |
| ·UniGene | 第16-17页 |
| ·参考基因组 | 第17-18页 |
| ·蛋白数据库 | 第18页 |
| ·KEGG | 第18-19页 |
| 3. 使用软件及流程 | 第19-25页 |
| ·软件 | 第19-21页 |
| ·NCBI local-blast | 第19页 |
| ·Local Blast2go | 第19-21页 |
| ·分析流程 | 第21-25页 |
| ·稳定基因筛选 | 第22页 |
| ·从探针获取序列 | 第22-23页 |
| ·序列去冗余 | 第23页 |
| ·EST序列富集 | 第23页 |
| ·Unigene富集 | 第23-24页 |
| ·功能注释 | 第24-25页 |
| 4. 结果与讨论 | 第25-39页 |
| ·持家基因的初步筛选 | 第25-26页 |
| ·候选持家基因的EST富集 | 第26-29页 |
| ·持家基因染色体分布分析 | 第29-30页 |
| ·候选持家基因的功能富集分析 | 第30-34页 |
| ·候选持家基因的代谢通路分析 | 第34-35页 |
| ·小麦种子特异性基因的筛选 | 第35-37页 |
| ·结果讨论与展望 | 第37-39页 |
| ·持家基因数量 | 第37页 |
| ·没有EST富集的持家基因 | 第37-38页 |
| ·芯片组织特异性基因与UniGene库的验证 | 第38页 |
| ·二代测序对于芯片的影响 | 第38-39页 |
| 5. 参考文献 | 第39-42页 |
| 致谢 | 第42-43页 |
| 附录 | 第43-62页 |
| 攻读硕士期间发表的学术论文 | 第62页 |
