| 中文摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-44页 |
| ·引言 | 第14-15页 |
| ·DNA中胞嘧啶的几种表观修饰形式 | 第15-17页 |
| ·5-甲基胞嘧啶（5-mC）的检测 | 第17-22页 |
| ·甲基化特异的限制酶切法 | 第18-19页 |
| ·亲和吸附法测定甲基化修饰 | 第19-20页 |
| ·亚硫酸氢钠转化法检测甲基化修饰 | 第20-22页 |
| ·羟甲基胞嘧啶检测 | 第22-25页 |
| ·葡萄糖修饰法检测羟甲基胞嘧啶 | 第23-24页 |
| ·亲和吸附法检测5羟甲基胞嘧啶 | 第24-25页 |
| ·其他检测 5-羟甲基胞嘧啶的方法 | 第25页 |
| ·表观修饰检测的重要意义 | 第25-27页 |
| ·电化学方法检测DNA甲基化及羟甲基化 | 第27-28页 |
| ·本课题的设计 | 第28-29页 |
| 参考文献 | 第29-44页 |
| 第二章 基于DNA纳米结构电化学平台的基因甲基化检测 | 第44-60页 |
| ·引言 | 第44-46页 |
| ·实验部分 | 第46-49页 |
| ·实验试剂与仪器 | 第46-47页 |
| ·甲基化酶催化质粒pBR322甲基化及限制酶切表征 | 第47-48页 |
| ·亚硫酸氢钠处理pBR322质粒及MSP扩增 | 第48页 |
| ·构建E-MSP平台并检测MSP产物 | 第48-49页 |
| ·结果与讨论 | 第49-53页 |
| ·四面体形成的结果 | 第49页 |
| ·质粒甲基情况形成结果 | 第49-50页 |
| ·甲基化特异PCR扩增及区分能力鉴定 | 第50-51页 |
| ·3D平台与 2D平台对比及模拟血清与PBS缓冲液对比 | 第51-52页 |
| ·E-MSP方法与其他类似方法对比 | 第52-53页 |
| ·结论 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-60页 |
| 第三章 基于E-MSP电化学方法的前列腺癌甲基化检测 | 第60-82页 |
| ·引言 | 第60-62页 |
| ·实验部分 | 第62-65页 |
| ·实验材料与仪器 | 第62-63页 |
| ·病人和样本收集 | 第63页 |
| ·血清中提取DNA | 第63-64页 |
| ·亚硫酸氢钠处理提取的DNA并用E-MSP分析 | 第64页 |
| ·甲基化特异PCR(MSP)和电化学偶联甲基化特异PCR (E-MSP) | 第64-65页 |
| ·数据分析 | 第65页 |
| ·结果与讨论 | 第65-73页 |
| ·E-MSP性能分析 | 第65-68页 |
| ·前列腺癌相关的基因甲基化分析 | 第68-69页 |
| ·双基因联合分析前列腺癌 | 第69-73页 |
| ·结论 | 第73-76页 |
| 参考文献 | 第76-82页 |
| 第四章 基于多通道电化学传感器的全基因组水平羟甲基化检测 | 第82-96页 |
| ·引言 | 第82-83页 |
| ·实验部分 | 第83-87页 |
| ·材料和试剂 | 第83-84页 |
| ·从组织及细胞中分离DNA | 第84页 |
| ·制备生物素修饰的羟甲基DNA产物 | 第84-85页 |
| ·构建多通道电化学传感器并进行检测 | 第85-86页 |
| ·数据分析 | 第86-87页 |
| ·实验结果与讨论 | 第87-91页 |
| ·传感器的构成 | 第87-88页 |
| ·检测条件优化 | 第88-89页 |
| ·多通道传感器的灵敏度和特异性分析 | 第89-90页 |
| ·5-hmC在小鼠的不同组织及一些癌细胞中的分布 | 第90-91页 |
| ·结果对比 | 第91页 |
| ·结论 | 第91-93页 |
| 参考文献 | 第93-96页 |
| 第五章 基于多通道电化学传感器的基因特定位点羟甲基化检测 | 第96-116页 |
| ·引言 | 第96-99页 |
| ·实验部分 | 第99-106页 |
| ·实验试剂与仪器 | 第99-101页 |
| ·多种SNP常用酶对比 | 第101页 |
| ·含有 5-hmC的DNA模型构建 | 第101-102页 |
| ·氧化及亚硫酸盐处理 | 第102-103页 |
| ·氧化及亚硫酸盐处理效果评估 | 第103-104页 |
| ·琼脂糖胶定性验证以及电化学平台上定量检测 | 第104-106页 |
| ·结果与讨论 | 第106-110页 |
| ·四种酶酶切结果比对 | 第106页 |
| ·T7内切酶Ⅰ酶切条件优化 | 第106-107页 |
| ·不同酶切时间对酶切效果分析 | 第107页 |
| ·T7内切酶Ⅰ识别各种错配的能力 | 第107-108页 |
| ·构建含有 5-hmC DNA片段并检测 | 第108-109页 |
| ·检测 5-hmC DNA能力 | 第109-110页 |
| ·结论 | 第110-111页 |
| 参考文献 | 第111-116页 |
| 第六章 总结和展望 | 第116-118页 |
| 攻读博士学位期间发表论文目录 | 第118-120页 |
| 致谢 | 第120-121页 |
