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高通量DNA测序数据无损压缩研究

摘要第1-5页
Abstract第5-9页
第一章 绪论第9-14页
   ·研究背景第9-10页
   ·DNA测序数据压缩及其存在的问题第10-11页
   ·本文主要研究内容第11-12页
   ·论文结构第12-14页
第二章 高通量DNA测序数据压缩技术第14-28页
   ·引言第14页
   ·高通量DNA数据存储格式第14-16页
     ·FASTQ格式第14-15页
     ·SAM/BAM格式第15页
     ·FASTA格式第15-16页
   ·基因组序列数据的压缩技术第16-20页
     ·基于参考基因组的基因组序列压缩第17-18页
     ·非参考基因组的基因组序列压缩第18-19页
     ·基因组序列数据压缩实验结果第19-20页
   ·NGS数据的压缩技术第20-27页
     ·基于参考基因组的NGS数据的压缩技术第20-22页
     ·非参考基因组的NGS数据的压缩技术第22-23页
     ·压缩元数据与质量分数第23-24页
     ·NGS数据压缩实验结果第24-27页
   ·本章小结第27-28页
第三章 基于参考基因组的FASTQ数据压缩算法FQZip第28-34页
   ·引言第28页
   ·FQZip算法设计第28-31页
     ·FQZip算法总体框架第28-29页
     ·FQZip压缩元数据第29页
     ·FQZip压缩碱基第29-31页
     ·FQZip压缩质量分数第31页
   ·FQZip实验结果第31-33页
   ·本章小结第33-34页
第四章 基于轻量匹配模型的FASTQ数据压缩算法LWFQZip第34-44页
   ·引言第34页
   ·LWFQZip算法设计第34-39页
     ·LWFQZip算法总体框架第34-35页
     ·LWFQZip压缩元数据第35-36页
     ·LWFQZip压缩碱基第36-38页
     ·LWFQZip压缩质量分数第38-39页
   ·LWFQZip实验结果第39-43页
     ·LWFQZip压缩性能第39-41页
     ·LWFQZip匹配模型性能第41-42页
     ·LWFQZip与FQZip比较第42-43页
   ·本章小结第43-44页
第五章 总结与展望第44-46页
   ·研究工作总结第44页
   ·后续研究工作展望第44-46页
参考文献第46-52页
致谢第52-53页
攻读硕士学位期间的研究成果第53-54页

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