摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-9页 |
第一章 绪论 | 第9-14页 |
·研究背景 | 第9-10页 |
·DNA测序数据压缩及其存在的问题 | 第10-11页 |
·本文主要研究内容 | 第11-12页 |
·论文结构 | 第12-14页 |
第二章 高通量DNA测序数据压缩技术 | 第14-28页 |
·引言 | 第14页 |
·高通量DNA数据存储格式 | 第14-16页 |
·FASTQ格式 | 第14-15页 |
·SAM/BAM格式 | 第15页 |
·FASTA格式 | 第15-16页 |
·基因组序列数据的压缩技术 | 第16-20页 |
·基于参考基因组的基因组序列压缩 | 第17-18页 |
·非参考基因组的基因组序列压缩 | 第18-19页 |
·基因组序列数据压缩实验结果 | 第19-20页 |
·NGS数据的压缩技术 | 第20-27页 |
·基于参考基因组的NGS数据的压缩技术 | 第20-22页 |
·非参考基因组的NGS数据的压缩技术 | 第22-23页 |
·压缩元数据与质量分数 | 第23-24页 |
·NGS数据压缩实验结果 | 第24-27页 |
·本章小结 | 第27-28页 |
第三章 基于参考基因组的FASTQ数据压缩算法FQZip | 第28-34页 |
·引言 | 第28页 |
·FQZip算法设计 | 第28-31页 |
·FQZip算法总体框架 | 第28-29页 |
·FQZip压缩元数据 | 第29页 |
·FQZip压缩碱基 | 第29-31页 |
·FQZip压缩质量分数 | 第31页 |
·FQZip实验结果 | 第31-33页 |
·本章小结 | 第33-34页 |
第四章 基于轻量匹配模型的FASTQ数据压缩算法LWFQZip | 第34-44页 |
·引言 | 第34页 |
·LWFQZip算法设计 | 第34-39页 |
·LWFQZip算法总体框架 | 第34-35页 |
·LWFQZip压缩元数据 | 第35-36页 |
·LWFQZip压缩碱基 | 第36-38页 |
·LWFQZip压缩质量分数 | 第38-39页 |
·LWFQZip实验结果 | 第39-43页 |
·LWFQZip压缩性能 | 第39-41页 |
·LWFQZip匹配模型性能 | 第41-42页 |
·LWFQZip与FQZip比较 | 第42-43页 |
·本章小结 | 第43-44页 |
第五章 总结与展望 | 第44-46页 |
·研究工作总结 | 第44页 |
·后续研究工作展望 | 第44-46页 |
参考文献 | 第46-52页 |
致谢 | 第52-53页 |
攻读硕士学位期间的研究成果 | 第53-54页 |