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人肠道细菌Feacalibacterium prausnitzii数量和组成的研究方法的建立和应用

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-12页
第一章 文献综述第12-32页
   ·人体肠道微生物研究进展第12-26页
     ·人体肠道微生物概述第12-13页
     ·肠道内有重要生理学意义的微生物组成第13-17页
       ·梭菌第14页
       ·拟杆菌第14-15页
       ·双歧杆菌第15页
       ·肠杆菌第15页
       ·乳酸菌第15-16页
       ·其他重要细菌类群和古菌第16-17页
     ·肠道细菌F. prausnitzii 综述第17-20页
       ·F. prausnitzii 形态第17页
       ·F. prausnitzii 系统分类地位第17-18页
       ·F. prausnitzii 重要功能第18-19页
       ·F. prausnitzii 的研究方法第19-20页
     ·肠道微生物的主要功能第20-21页
       ·营养与消化第20页
       ·促进上皮细胞的生长与分化第20-21页
       ·免疫功能第21页
       ·保护作用第21页
     ·肠道微生物与性别的关系第21-22页
     ·肠道微生物与疾病的关系第22-26页
       ·肠道菌群与肥胖的关系第22-24页
       ·肠道菌群与胰岛素抵抗的关系第24-25页
       ·肠道菌群与其它疾病的关系第25-26页
   ·研究微生物组成多样性的分子生物学技术第26-32页
     ·实时定量PCR 技术第26-28页
     ·变性/温度梯度凝胶电泳技术第28-32页
第二章 建立肠道细菌Feacalibacterium prausnitzii 数量和组成的分析方法第32-54页
 引言第32-33页
   ·材料与方法第33-40页
     ·材料第33-35页
       ·克隆与引物第33-34页
       ·试剂和仪器第34页
       ·计算机程序和数据库第34-35页
     ·方法第35-40页
       ·序列的比对和系统发育分析第35页
       ·RDP 的Probe Match 分析第35页
       ·SPCR 分析第35页
       ·真实PCR 验证第35-36页
       ·F. prausnitzii 特异性的实时定量PCR第36-38页
       ·F. prausnitzii 特异性的PCR-DGGE第38-40页
   ·结果第40-51页
     ·引物比较第40-45页
       ·序列比对和系统发育分析第40-43页
       ·RDP 的Probe Match 分析第43页
       ·SPCR 分析第43-45页
     ·真实PCR 验证结果第45-47页
     ·F. prausnitzii 特异性的实时定量PCR第47-48页
     ·F. prausnitzii 特异性的PCR-DGGE第48-51页
   ·讨论第51-54页
第三章 应用实时定量PCR技术对中国成年人群肠道中Feacalibacterium prausnitzii进行数量分析第54-68页
 引言第54-55页
   ·材料与方法第55-59页
     ·样本来源第55页
     ·粪便基因组DNA 提取第55-57页
     ·F. prausnitzii 特异性实时定量PCR第57-59页
       ·DNA 浓度的测定第57页
       ·粪便样品F. prausnitzii 特异性实时定量PCR 和总菌实时定量PCR第57-59页
   ·结果第59-64页
     ·实验样品的选择第59-60页
     ·F. prausnitzii 特异性实时定量PCR 结果第60-64页
   ·讨论第64-68页
第四章 应用PCR-DGGE 技术对中国成年人群肠道中Feacalibacterium prausnitzii 进行组成分析第68-78页
 引言第68-69页
   ·材料与方法第69-70页
     ·材料第69-70页
       ·粪便样品来源第69页
       ·试剂第69-70页
     ·方法第70页
       ·粪便基因组DNA 的提取第70页
       ·F. prausnitzii 特异性的PCR-DGGE第70页
   ·结果第70-75页
   ·讨论第75-78页
参考文献第78-87页
附录1 溶液试剂及培养基配方第87-88页
附录2 仪器设备第88-89页
附录3 缩写和全称第89-91页
附录4 F. prausnitzii 特异性实时定量PCR 样品基本信息第91-94页
附录5 F. prausnitzii 特异性实时定量PCR 数据汇总第94-99页
致谢第99-101页
研究生阶段已发表或录用的论文第101-103页

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