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洋葱伯克氏菌在重要禾本科作物根围的多样性及其致病性研究

摘要第1-13页
Abstract第13-17页
第一章 文献综述第17-45页
 1 人体条件致病菌作为生物农药的研究概况第17-20页
   ·人体条件致病菌的定义第17页
   ·与人体致病相关的生防菌第17-20页
     ·与人体致病相关的生防细菌第17-19页
     ·与人体致病相关的生防真菌第19-20页
 2 Bcc在农业上应用的潜在利益第20-25页
   ·植物病害生防菌第20-24页
     ·Bcc在植物病害生防中的作用和应用第20-21页
     ·Bcc生防作用的分子机制第21-24页
   ·植物生长调节剂第24页
   ·生物降解菌第24-25页
 3 Bcc在农业上应用的弊端第25-28页
   ·人体条件致病菌第25-27页
     ·临床调查和管理措施第25-26页
     ·在人体内的侵染第26-27页
   ·植物病原菌第27-28页
   ·诱发植物霜冻的冰核细菌第28页
 4 Bcc在农业上应用的风险解析第28-32页
   ·微生物农药风险分析的原则和方针第28-29页
   ·Bcc作为生防菌的风险分析第29-32页
     ·生物学特性第29-30页
     ·作为人体条件致病菌的危害性第30页
     ·作为生防菌的暴露量评估第30页
     ·毒力和致病性第30-31页
     ·流行学调查第31-32页
 5 当前Bcc的研究热点第32-44页
   ·分类地位的重新划分第32-39页
     ·Bcc的分类第32-33页
     ·Bcc的鉴定第33-39页
   ·生态学和多样性研究第39-42页
   ·环境菌与人体致病菌的区分研究第42页
   ·人体致病菌的毒力和致病性研究第42-44页
 6 本研究的意义第44-45页
第二章 洋葱伯克氏菌群在禾本科作物根围的分离和鉴定第45-56页
 1 材料和方法第46-49页
   ·参考菌株与主要试剂第46页
   ·Bcc在植物根围样本的分离第46-47页
     ·样本的采集第46-47页
     ·细菌的分离和纯化第47页
   ·表型的初步鉴定第47-48页
     ·革兰氏染色第47页
     ·好氧性和厌氧性观察第47-48页
     ·氧化酶反应第48页
     ·麦康凯平板上菌落观察第48页
     ·接触酶反应第48页
   ·Bcc菌群的PCR鉴定第48-49页
 2 结果与分析第49-53页
   ·细菌分离物在3种选择平板上的菌落特征第49-50页
   ·Bcc菌的表型初步鉴定第50-51页
   ·Bcc菌群的PCR鉴定第51页
   ·Bcc菌群在3种农作物根围环境中的分布第51-53页
 3 讨论第53-56页
   ·Bcc菌群的鉴定及与疑似菌株的区分第53-54页
   ·利用选择培养基调查Bcc菌群多样性的优缺点第54-55页
   ·洋葱伯克氏菌在植物根围的丰富度第55-56页
第三章 禾本科作物根围洋葱伯克氏菌的基因型分析第56-81页
 1 材料和方法第56-62页
   ·供试菌株和主要试剂第56-57页
   ·细菌DNA模板的制备和recA基因的扩增第57页
   ·限制性酶切长度多态性(RFLP)分析第57页
   ·基因型特异性PCR检测第57页
   ·Bcc菌株recA基因的克隆第57-62页
     ·Bcc菌株recA基因的PCR扩增第57-58页
     ·PCR扩增产物的回收和纯化第58-59页
     ·感受态细胞的制备第59-60页
     ·PCR产物的连接第60页
     ·连接产物的转化第60页
     ·重组质粒的筛选第60-61页
     ·重组质粒的鉴定第61-62页
   ·Bcc菌recA基因的序列分析第62页
   ·Bcc菌recA基因的聚类分析第62页
 2 结果与分析第62-69页
   ·Bcc菌recA基因的RFLP分析第62-63页
   ·基因型特异性PCR结果第63-65页
   ·Bcc菌recA基因的克隆第65页
   ·Bcc菌recA基因序列分析第65-69页
   ·水稻和玉米根围的Bcc基因型分布第69页
   ·根围环境中不同基因型菌株的表型分析第69页
 3 讨论第69-81页
   ·水稻和玉米根围的Bcc基因型多样性第69-71页
   ·Bcc基因型的鉴定第71-72页
   ·Bcc菌recA基因序列分析第72-81页
第四章 洋葱伯克氏菌在苜蓿模型上的毒力研究第81-91页
 1 材料和方法第82-84页
   ·供试菌株第82页
   ·Bcc菌在苜蓿植物模型上的毒力测定第82-83页
     ·供试细菌的准备第82-83页
     ·苜蓿种子的接种前处理第83页
     ·苜蓿幼苗接种第83页
   ·Bcc菌BCESM和cblA毒力基因的检测第83-84页
     ·BCESM基因的PCR特异性检测第83-84页
     ·cblA基因的PCR特异性检测第84页
 2 结果与分析第84-88页
   ·医院Bcc菌的基因型鉴定第84-85页
   ·Bcc基因型菌株在苜蓿幼苗上的毒力症状第85页
   ·Bcc基因型菌株在苜蓿上的毒力结果第85-88页
   ·毒力基因BCESM和cblA的PCR检测第88页
 3 讨论第88-91页
第五章 洋葱伯克氏菌在洋葱上的致病性研究第91-98页
 1 材料和方法第91-92页
   ·供试菌株第91-92页
   ·细菌的活化和培养第92页
   ·烟草接种第92页
   ·洋葱上致病性试验第92页
 2 结果与分析第92-96页
   ·Bcc菌株在烟草上的过敏性反应第92-93页
   ·不同基因型菌株在洋葱上的致病性第93-96页
     ·基因型Ⅰ菌株在洋葱上的致病性第93-95页
     ·基因型Ⅲ菌株在洋葱上的致病性第95页
     ·基因型Ⅴ和Ⅸ菌株在洋葱上的致病性第95-96页
 3 讨论第96-98页
第六章 洋葱伯克氏菌拮抗植物病原菌的生防筛选第98-107页
 1 材料和方法第99-100页
   ·供试菌株第99页
   ·Bcc菌株对病原真菌的拮抗活性测定第99页
   ·拮抗细菌培养滤液的活性测定第99-100页
     ·无菌培养滤液的制备第99-100页
     ·培养滤液对菌丝生长的抑制第100页
   ·拮抗菌株的生物安全性评价第100页
 2 结果与分析第100-105页
   ·平板拮抗病原真菌结果第100-104页
     ·Bcc拮抗菌在各基因型内的比例第100页
     ·拮抗细菌的拮抗谱第100-103页
     ·拮抗菌株的抑菌效果第103-104页
   ·拮抗细菌的培养滤液活性测定第104页
   ·拮抗细菌的生物安全性评价第104-105页
 3 讨论第105-107页
参考文献第107-119页
附录第119-129页
 附录-1 博士期间论文发表情况第119页
 附录-2 培养基和试剂配方第119-121页
 附录-3 Bcc菌株测序的recA基因序列第121-129页

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