一 序言 | 第1-13页 |
(一) 基因组计划及基因组数据库 | 第8-9页 |
(二) 生物学背景 | 第9-10页 |
(三) 研究方法 | 第10-11页 |
1 语言学方法 | 第10-11页 |
2 信息论方法 | 第11页 |
(四) 研究背景 | 第11-13页 |
二 基因组“k-字”频数普适关系的研究 | 第13-25页 |
(一) 引言 | 第13页 |
(二) 材料的选取 | 第13-14页 |
(三) 研究方法 | 第14-17页 |
1 在“字”域内的Shannon信息熵 | 第14页 |
2 在“字”域内的标准偏差与平均值之比的对数(LogDTM) | 第14-15页 |
3 在“字”域内的修改后的标准偏差与平均值之比的对数(ModLogDTM) | 第15页 |
4 在“频数”域内的Shannon信息熵 | 第15-16页 |
5 在“频数”域内的Fisher信息熵 | 第16-17页 |
(四) 结果 | 第17-22页 |
(五) 讨论 | 第22-25页 |
三 枯草杆菌基因组中的回文结构 | 第25-35页 |
(一) 引言 | 第25-26页 |
(二) 材料的选取 | 第26页 |
(三) 研究方法 | 第26-27页 |
1 回文结构的统计 | 第26-27页 |
2 Z分数定义 | 第27页 |
(四) 结果 | 第27-33页 |
1 回文结构的频数 | 第27-30页 |
2 回文结构的标准频数 | 第30-32页 |
3 回文结构中AT含量 | 第32-33页 |
(五) 讨论 | 第33-35页 |
四 附录 | 第35-39页 |
(一) 附录1 | 第35-37页 |
(二) 附录2 | 第37-38页 |
(三) 附录3 | 第38-39页 |
参考文献 | 第39-43页 |
致谢 | 第43-44页 |
攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第44页 |