| 图形目录 | 第1-5页 |
| 表格目录 | 第5-6页 |
| 中文摘要 | 第6-7页 |
| 英文摘要 | 第7-9页 |
| 研究论文：黄孢原毛平革菌(Phanerochaete chrysosporium) ABC转运蛋白家族基因同源ctg16序列的分析 | 第9-34页 |
| 1 引言 | 第9-11页 |
| 2 材料和方法 | 第11-12页 |
| 2．1 数据来源 | 第11-12页 |
| 2．2 主要分析软件及网络服务 | 第12页 |
| 3 结果及分析 | 第12-29页 |
| 3．1 基因预测 | 第12-19页 |
| 3．1．1 毗连群分析(Contig assembly) | 第12-15页 |
| 3．1．2 基因预测 | 第15-19页 |
| 3．2 Ctg16pr的分析及三维模型构建 | 第19-29页 |
| 3．2．1 翻译蛋白质序列一级结构分析 | 第19-21页 |
| 3．2．2 蛋白质三维模型构建 | 第21-22页 |
| 3．2．3 模型分析 | 第22-29页 |
| 4 小结 | 第29-30页 |
| 致谢 | 第30-31页 |
| 参考文献 | 第31-34页 |
| 文献综述：基因与蛋白质结构及功能的预测方法 | 第34-79页 |
| 摘要 | 第35-36页 |
| 1 基因预测方法及其特点 | 第36-57页 |
| 1．1 引言 | 第36-37页 |
| 1．2 寻找证据 | 第37-43页 |
| 1．2．1 组分探测程序 | 第37-40页 |
| 1．2．2 信号探测程序 | 第40-43页 |
| 1．3 结合证据预测基因结构 | 第43-52页 |
| 1．3．1 外源性方法 | 第43-47页 |
| 1．3．2 本质性方法 | 第47-51页 |
| 1．3．3 综合方法 | 第51-52页 |
| 1．4 预测效果及现存主要问题 | 第52-56页 |
| 1．4．1 预测准确性 | 第52-53页 |
| 1．4．2 缺陷及有待处理的问题 | 第53-55页 |
| 1．4．3 数据库和训练数据集存在的问题 | 第55-56页 |
| 1．5 结论 | 第56-57页 |
| 2 用生物信息学方法预测蛋白质结构及功能 | 第57-68页 |
| 2．1 引言 | 第57-58页 |
| 2．2 预测工具 | 第58-62页 |
| 2．2．1 基于网络的蛋白质结构预测系统 | 第58-59页 |
| 2．2．2 蛋白质结构预测的本地系统 | 第59-62页 |
| 2．3 预测方法 | 第62-68页 |
| 2．3．1 蛋白质序列初步分析 | 第62页 |
| 2．3．2 用标准搜索方法寻找结构同源区 | 第62-63页 |
| 2．3．3 用敏感搜索方法寻找结构类似区 | 第63页 |
| 2．3．4 用1D-2D-3D相容性匹配为序列寻找相应结构 | 第63-64页 |
| 2．3．5 构建原子尺度的蛋白质分子模型 | 第64-66页 |
| 2．3．6 蛋白质结构模型的校准 | 第66-67页 |
| 2．3．7 小结 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-79页 |
| 在读期间发表的论文 | 第79-80页 |
| 声明 | 第80页 |
