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木薯块根发育与淀粉累积相关的microRNA及其靶基因

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
1. 文献综述第11-31页
   ·木薯生物学特性及木薯淀粉的研究进展第11-14页
     ·木薯的生物学特性第11页
     ·木薯的经济价值第11页
     ·块根发育及淀粉积累机制研究进展第11-14页
       ·块根的形成和膨大机理研究第12页
       ·木薯块根发育和淀粉累积第12页
       ·光合作用与淀粉合成关键基因第12-14页
   ·miRNA研究进展第14-30页
     ·miRNA的发现及现状第14-15页
     ·miRNA的特性第15-16页
     ·miRNA的生物合成第16-18页
     ·植物miRNA的作用机制第18-19页
     ·miRNA功能第19-22页
       ·植物miRNA对植物生长发育的影响第19-20页
       ·miRNA与植物抗逆胁迫第20-22页
       ·miRNA自我调节第22页
     ·miRNA的研究方法第22-29页
       ·生物信息学方法研究miRNA第23页
       ·生化实验方法研究miRNA第23-24页
       ·高通量测序技术推动小RNA的研究第24-26页
       ·miRNA的鉴定方法与定量检测技术第26-29页
     ·靶基因的实验验证第29-30页
   ·本研究的目的与意义第30页
   ·课题设计思路及技术路线第30-31页
2. 材料与方法第31-43页
   ·仪器与试剂第31页
   ·植物材料第31-32页
   ·实验方法第32-43页
     ·miRNA的获取第32页
     ·小RNA文库的构建、测序及数据分析第32-33页
       ·miRNA提取第32-33页
       ·小RNA文库的构建、测序及数据分析第33页
     ·靶基因的预测第33-34页
     ·Multiplexed RT法检测测序得到的miRNA第34-40页
       ·引物设计第34-39页
       ·第一链cDNA合成及检测第39页
       ·U6及miRNA标准曲线的制作第39-40页
       ·miRNA的相对定量分析第40页
     ·靶mRNA的RT-PCR检测第40-43页
       ·靶基因的引物设计第40页
       ·内参基因Actin引物设计第40-41页
       ·总RNA提取第41页
       ·cDNA第一链的合成及预实验第41-42页
       ·靶基因的表达分析第42-43页
3. 结果与分析第43-63页
   ·小RNA测序数据处理及片段长度分布第43-44页
   ·miRNA首位碱基组成第44页
   ·品种间miRNA序列差异分析第44-45页
   ·木薯块根及叶片中的miRNA第45-46页
   ·块根及叶片中的miRNA的丰度分析第46-47页
   ·miRNA靶基因预测结果第47-49页
   ·部分miRNA的实验验证第49-51页
   ·部分miRNA在根和叶片的Q-PCR表达分析第51-58页
     ·Q-PCR检测的标准体系第51-54页
     ·miRNA的相对定量分析第54-58页
   ·miRNA靶基因的qPCR分析第58-63页
     ·总RNA的提取第59页
     ·mRNA Q-PCR检测的标准体系第59-60页
     ·miRNA与靶基因AGPase和SPS2F对应表达分析第60-63页
4. 讨论第63-66页
   ·miRNA序列长度及碱基偏好性第63页
   ·Solexa测序技术第63-64页
   ·miR394与靶基因SPS2F,AGPase第64页
   ·关于miRNA表达验证方法第64-66页
5. 结论第66-67页
参考文献第67-74页
附录第74-83页
致谢第83页

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