摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-11页 |
1. 文献综述 | 第11-31页 |
·木薯生物学特性及木薯淀粉的研究进展 | 第11-14页 |
·木薯的生物学特性 | 第11页 |
·木薯的经济价值 | 第11页 |
·块根发育及淀粉积累机制研究进展 | 第11-14页 |
·块根的形成和膨大机理研究 | 第12页 |
·木薯块根发育和淀粉累积 | 第12页 |
·光合作用与淀粉合成关键基因 | 第12-14页 |
·miRNA研究进展 | 第14-30页 |
·miRNA的发现及现状 | 第14-15页 |
·miRNA的特性 | 第15-16页 |
·miRNA的生物合成 | 第16-18页 |
·植物miRNA的作用机制 | 第18-19页 |
·miRNA功能 | 第19-22页 |
·植物miRNA对植物生长发育的影响 | 第19-20页 |
·miRNA与植物抗逆胁迫 | 第20-22页 |
·miRNA自我调节 | 第22页 |
·miRNA的研究方法 | 第22-29页 |
·生物信息学方法研究miRNA | 第23页 |
·生化实验方法研究miRNA | 第23-24页 |
·高通量测序技术推动小RNA的研究 | 第24-26页 |
·miRNA的鉴定方法与定量检测技术 | 第26-29页 |
·靶基因的实验验证 | 第29-30页 |
·本研究的目的与意义 | 第30页 |
·课题设计思路及技术路线 | 第30-31页 |
2. 材料与方法 | 第31-43页 |
·仪器与试剂 | 第31页 |
·植物材料 | 第31-32页 |
·实验方法 | 第32-43页 |
·miRNA的获取 | 第32页 |
·小RNA文库的构建、测序及数据分析 | 第32-33页 |
·miRNA提取 | 第32-33页 |
·小RNA文库的构建、测序及数据分析 | 第33页 |
·靶基因的预测 | 第33-34页 |
·Multiplexed RT法检测测序得到的miRNA | 第34-40页 |
·引物设计 | 第34-39页 |
·第一链cDNA合成及检测 | 第39页 |
·U6及miRNA标准曲线的制作 | 第39-40页 |
·miRNA的相对定量分析 | 第40页 |
·靶mRNA的RT-PCR检测 | 第40-43页 |
·靶基因的引物设计 | 第40页 |
·内参基因Actin引物设计 | 第40-41页 |
·总RNA提取 | 第41页 |
·cDNA第一链的合成及预实验 | 第41-42页 |
·靶基因的表达分析 | 第42-43页 |
3. 结果与分析 | 第43-63页 |
·小RNA测序数据处理及片段长度分布 | 第43-44页 |
·miRNA首位碱基组成 | 第44页 |
·品种间miRNA序列差异分析 | 第44-45页 |
·木薯块根及叶片中的miRNA | 第45-46页 |
·块根及叶片中的miRNA的丰度分析 | 第46-47页 |
·miRNA靶基因预测结果 | 第47-49页 |
·部分miRNA的实验验证 | 第49-51页 |
·部分miRNA在根和叶片的Q-PCR表达分析 | 第51-58页 |
·Q-PCR检测的标准体系 | 第51-54页 |
·miRNA的相对定量分析 | 第54-58页 |
·miRNA靶基因的qPCR分析 | 第58-63页 |
·总RNA的提取 | 第59页 |
·mRNA Q-PCR检测的标准体系 | 第59-60页 |
·miRNA与靶基因AGPase和SPS2F对应表达分析 | 第60-63页 |
4. 讨论 | 第63-66页 |
·miRNA序列长度及碱基偏好性 | 第63页 |
·Solexa测序技术 | 第63-64页 |
·miR394与靶基因SPS2F,AGPase | 第64页 |
·关于miRNA表达验证方法 | 第64-66页 |
5. 结论 | 第66-67页 |
参考文献 | 第67-74页 |
附录 | 第74-83页 |
致谢 | 第83页 |