| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-43页 |
| 第一节 微生物与微生物多样性 | 第10-14页 |
| ·微生物与微生物的重要性 | 第10-11页 |
| ·微生物多样性与微生物生态学 | 第11-14页 |
| 第二节 海洋微生物与其在海洋生态系统中所扮演的角色 | 第14-18页 |
| 第三节 海洋微生物多样性的研究方法 | 第18-31页 |
| ·传统方法 | 第18-19页 |
| ·分子生物学研究方法 | 第19-29页 |
| ·环境基因组学方法 | 第29-31页 |
| 第四节 胶州湾水文和生态特征 | 第31-33页 |
| 第五节 东太平洋海隆北纬13 度附近的水文和地质特征 | 第33-34页 |
| 参考文献 | 第34-43页 |
| 第二章 胶州湾表层沉积物中微生物多样性及时空分布规律的研究 | 第43-89页 |
| 1 材料与方法 | 第44-50页 |
| ·实验材料 | 第44页 |
| ·实验方法 | 第44-50页 |
| 2. 实验结果 | 第50-78页 |
| ·样品的采集 | 第50页 |
| ·DNA 的提取、纯化和PCR 扩增 | 第50-51页 |
| ·克隆文库的构建及测序 | 第51页 |
| ·沉积物中细菌多样性及系统发育分析 | 第51-72页 |
| ·数据库中与本研究中所获得的序列具有最近亲缘关系的序列所在生存环境所提供信息的主成分（PCA）分析 | 第72-75页 |
| ·胶州湾沉积物克隆文库组成与环境因子的典范对应分析（CCA）分析 | 第75-76页 |
| ·细菌类群的分布与环境因子的典范对应分析（CCA） | 第76-78页 |
| 3. 讨论 | 第78-81页 |
| ·胶州湾沉积物中细菌多样性 | 第78-79页 |
| ·细菌群落结构的时空差异 | 第79页 |
| ·细菌群落结构分析与胶州湾沉积物环境 | 第79-81页 |
| ·细菌群落变化与环境中物理化学因子的关系 | 第81页 |
| 4. 结论 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-89页 |
| 第三章 东太平洋海隆北纬13°附近深海柱状沉积物中微生物群落垂直分布的研究 | 第89-126页 |
| 1. 材料与方法 | 第90-98页 |
| ·实验材料 | 第90-92页 |
| ·实验方法 | 第92-98页 |
| 2 实验结果 | 第98-109页 |
| ·沉积物样品的地质化学特征 | 第98页 |
| ·四个断层中细菌165 V3 可变区的DGGE 分离 | 第98-99页 |
| ·细菌群落结构分析 | 第99-103页 |
| ·古细菌的群落结构和统计分析 | 第103-109页 |
| 3. 讨论 | 第109-112页 |
| ·东太平洋海隆北纬13 度附近沉积物中的微生物多样性 | 第110-111页 |
| ·东太平洋海隆北纬13° 附近沉积物中的微生物群落沿断层的分布 | 第111页 |
| ·热液活动对该沉积物采样区域的影响和本研究地质学提示 | 第111-112页 |
| 4. 结论 | 第112-114页 |
| 参考文献 | 第114-126页 |
| 本文主要结论 | 第126-128页 |
| 致谢 | 第128-129页 |
| 已经发表和完成的文章 | 第129页 |
