| 内容提要 | 第1-7页 |
| 第1章 绪论 | 第7-14页 |
| ·论文的选题背景和意义 | 第7-11页 |
| ·选题背景 | 第7-10页 |
| ·选题意义 | 第10-11页 |
| ·序列比对研究现状 | 第11-13页 |
| ·论文的组织 | 第13-14页 |
| 第2章 序列比对的基础知识 | 第14-26页 |
| ·序列比对的基本概念 | 第14-21页 |
| ·PATTERN HUTER算法介绍 | 第21-26页 |
| ·相关概念 | 第21-24页 |
| ·Pattern Hunter算法 | 第24-26页 |
| 第3章 计算种子敏感度的方法研究 | 第26-44页 |
| ·基于SRT的方法研究与实现 | 第26-41页 |
| ·SRT算法的基本思想 | 第26-29页 |
| ·SRT算法用到的数据结构 | 第29-32页 |
| ·SRT算法的关键函数的设计 | 第32-34页 |
| ·SRT的算法分析 | 第34-36页 |
| ·算法的实验结果 | 第36-41页 |
| ·基于BLOCK-MATRIX算法的方法研究 | 第41-44页 |
| ·Block-matrix的基本思想 | 第41页 |
| ·算法的流程 | 第41-44页 |
| 第4章 基于MONTE CARLO方法的种子寻找方法 | 第44-51页 |
| ·MONTE CARLO算法的基本流程和分析 | 第44-46页 |
| ·MONTE CARLO算法的实现 | 第46-47页 |
| ·MONTE CARLO算法的实验结果与分析 | 第47-51页 |
| 第5章 总结与展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-56页 |
| 摘要 | 第56-58页 |
| ABSTRACT | 第58-61页 |
| 致谢 | 第61页 |