| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-19页 |
| ·引言 | 第9-10页 |
| ·生物学背景知识 | 第10-13页 |
| ·基因序列比对 | 第13-14页 |
| ·国内外研究现状 | 第14-16页 |
| ·本文的研究内容、目的与意义 | 第16-17页 |
| ·本文的组织与开发环境 | 第17-19页 |
| 第2章 生物基因序列比对理论基础 | 第19-31页 |
| ·序列比对问题 | 第19-25页 |
| ·序列比对问题的生物学背景 | 第19-20页 |
| ·序列比对问题描述 | 第20-21页 |
| ·动态规划算法 | 第21-23页 |
| ·全局比对和局部比对 | 第23-25页 |
| ·基因序列的图形表示 | 第25-27页 |
| ·G-曲线和H-曲线 | 第26页 |
| ·CGR图 | 第26页 |
| ·二维坐标轴的图形表示 | 第26-27页 |
| ·Z曲线 | 第27页 |
| ·实验数据来源 | 第27-31页 |
| 第3章 基因序列可视化系统设计与实现 | 第31-47页 |
| ·系统设计 | 第31-38页 |
| ·系统框架结构 | 第31页 |
| ·显示部分设计 | 第31-35页 |
| ·分析部分设计 | 第35-38页 |
| ·系统实现 | 第38-47页 |
| 第4章 几何学分析基因序列 | 第47-55页 |
| ·引言 | 第47-48页 |
| ·Z曲线的理论基础 | 第48-49页 |
| ·Z曲线的定义 | 第49页 |
| ·非均匀B样条拟合Z曲线 | 第49-53页 |
| ·非均匀B样条算法 | 第49-52页 |
| ·数据采样 | 第52-53页 |
| ·基因序列Z曲线实例 | 第53-55页 |
| 第5章 基于文本统计特征和Z曲线几何中心距离矩阵的相似性比对 | 第55-71页 |
| ·引言 | 第55-56页 |
| ·单个基因序列整体与局部Z曲线比对分析 | 第56-60页 |
| ·点坐标转换公式推导 | 第56-58页 |
| ·实例分析 | 第58-60页 |
| ·基因序列间相似性比对分析 | 第60-65页 |
| ·基于文本统计的比对 | 第60-62页 |
| ·基于几何中心距离的序列比对 | 第62-65页 |
| ·进化树的构建 | 第65-71页 |
| 第6章 总结与展望 | 第71-73页 |
| ·工作总结 | 第71-72页 |
| ·展望 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-79页 |
| 致谢 | 第79-81页 |
| 攻读硕士学位期间参与科研工作及发表的论文 | 第81-83页 |