| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第一章 基于人工转录组件的逻辑网络设计 | 第9-21页 |
| ·人工组合逻辑网络 | 第9-16页 |
| ·天然基因表达调控网络中的逻辑运算 | 第9-10页 |
| ·人工组合逻辑网络 | 第10-16页 |
| ·可重用性和可组合性要求 | 第16-18页 |
| ·基于人工转录组件的逻辑网络设计策略 | 第18-21页 |
| 第二章 人工阻遏蛋白的筛选与鉴定 | 第21-31页 |
| ·定向进化筛选方法 | 第22-28页 |
| ·阻遏蛋白表达质粒和启动子活性报告质粒 | 第22-24页 |
| ·lacI基因的定点饱和突变文库 | 第24-26页 |
| ·含Olac操纵基因变体报告质粒 | 第26-27页 |
| ·筛选特异性 | 第27-28页 |
| ·荧光测定阻遏特异性 | 第28页 |
| ·筛选结果 | 第28-31页 |
| 第三章 基于人工转录组件的逻辑启动子 | 第31-51页 |
| ·定量模型分析 | 第31-33页 |
| ·LacI-Olac体系启动子活性方程 | 第31-32页 |
| ·定量模型的参数化 | 第32-33页 |
| ·逻辑启动子模型和初始设计 | 第33-38页 |
| ·数值模拟和方案选择 | 第35-38页 |
| ·逻辑启动子性能测试 | 第38-47页 |
| ·逻辑启动子的合成方法 | 第38-39页 |
| ·逻辑启动子的测试体系 | 第39-40页 |
| ·寡聚核苷酸退火插入法构建pDR-NUL | 第40-43页 |
| ·BioBricks拼装方法 | 第43-45页 |
| ·荧光测定启动子活性 | 第45-47页 |
| ·原型系统 | 第47-51页 |
| ·NAND门 | 第47-48页 |
| ·NOR门和NOT门 | 第48页 |
| ·另一NAND门设计 | 第48-51页 |
| 第四章 可重用性与可组合性 | 第51-59页 |
| ·可重用性 | 第51页 |
| ·可组合性 | 第51-54页 |
| ·抗干扰性 | 第54-55页 |
| ·对生长的影响 | 第55-56页 |
| ·结论和展望 | 第56-59页 |
| 参考文献 | 第59-75页 |
| 附录A LacI-Olac体系启动子活性计算源代码 | 第75-83页 |
| 致谢 | 第83-85页 |
| 攻读博士学位期间论文目录 | 第85页 |