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藏獒的起源、系统发育与遗传多样性研究

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-15页
第一部分 文献综述第15-41页
 第一章 藏獒的种质特性第15-23页
  1. 藏獒的生长发育第15-16页
  2. 藏獒的繁殖性能第16页
  3. 藏獒的适应性第16-17页
  4. 藏獒群体的遗传多样性第17-19页
   ·毛色遗传多样性第17页
   ·血液蛋白遗传多样性第17-18页
   ·RAPD第18页
   ·微卫星座位遗传多样性第18-19页
  5. 藏獒的起源与进化研究第19-20页
  参考文献第20-23页
 第二章 家犬的起源与系统发育第23-41页
  1. 古生物学研究第23页
  2. 形态学研究第23-24页
  3. 细胞遗传学研究第24页
  4. 生化遗传学研究第24-25页
  5. 分子生物学研究第25-36页
   ·微卫星标记第25-26页
   ·线粒体DNA序列第26-32页
   ·Y染色体序列第32-34页
   ·核基因序列第34-35页
   ·全基因组SNP第35-36页
  参考文献第36-41页
第二部分 试验研究第41-143页
 第三章 藏獒线粒体基因组全序列的测定与分析第41-59页
  1. 材料与方法第42-47页
   ·试验材料第42页
   ·试验方法第42-47页
  2 结果与分析第47-51页
   ·藏獒线粒体基因组的基因组成第47-50页
   ·编码蛋白基因第50页
   ·非编码区第50页
   ·tRNA和rRNA第50-51页
  3. 讨论第51-55页
   ·藏獒线粒体基因组特征第51-53页
   ·编码蛋白基因第53页
   ·非编码区第53-54页
   ·tRNA和rRNA第54-55页
  参考文献第55-59页
 第四章 基于线粒体12个编码蛋白基因序列的藏獒起源与系统发育分析第59-79页
  1. 材料与方法第60-63页
   ·试验材料第60页
   ·试验方法第60-63页
  2. 结果与分析第63-73页
   ·藏獒和犬属动物线粒体基因组编码蛋白基因特征分析第63-65页
   ·犬属动物线粒体基因组编码蛋白基因序列变异分析第65-68页
   ·犬属动物线粒体基因组12个编码蛋白氨基酸序列变异分析第68页
   ·犬属动物线粒体基因组编码蛋白基因同义替换和非同义替换第68-69页
   ·系统发育分析第69页
   ·分化时间估计第69-73页
  3. 讨论第73-75页
   ·藏獒的起源与分类地位第73页
   ·藏獒与其它家犬品种的系统发育关系第73-74页
   ·藏獒的起源时间第74-75页
  参考文献第75-79页
 第五章 基于线粒体COI基因和DNA条形码序列的藏獒起源与分子系统发育分析第79-97页
  1. 材料与方法第80-83页
   ·试验样本第80页
   ·DNA提取第80页
   ·PCR扩增与测序第80-83页
   ·数据处理第83页
   ·分化时间估计第83页
  2. 结果与分析第83-89页
   ·藏獒和家犬品种线粒体COI基因序列分析第83-84页
   ·藏獒和家犬品种线粒体COI基因、DNA条形码序列的变异分析第84-85页
   ·系统发育分析第85-87页
   ·分化时间估计第87-89页
  3. 讨论第89-92页
   ·犬类线粒体COI基因和DNA条形码第89-90页
   ·藏獒的起源第90-92页
   ·藏獒与其它大型家犬品种的系统发育关系第92页
  参考文献第92-97页
 第六章 基于线粒体基因组控制区序列的藏獒起源与系统发育分析第97-121页
  1. 材料与方法第98-101页
   ·试验动物第98-100页
   ·DNA提取第100页
   ·PCR扩增与测序第100-101页
   ·数据处理和系统发育分析第101页
   ·分化时间估计第101页
  2. 结果与分析第101-112页
   ·藏獒线粒体基因组控制区全序列和结构分析第101-105页
   ·家犬品种间线粒体控制区序列变异分析第105页
   ·基于线粒体控制区全序列的系统发育分析第105-106页
   ·基于线粒体582bp高变区Ⅰ序列的系统发育分析第106-109页
   ·分化时间估计第109-112页
  3. 讨论第112-116页
   ·藏獒线粒体控制区序列的结构特征第112-114页
   ·藏獒与家犬品种间线粒体控制区序列变异第114-115页
   ·藏獒与其它家犬品种间的系统发育关系第115页
   ·藏獒的起源和分类地位第115-116页
  参考文献第116-121页
 第七章 基于线粒体控制区和高变区序列的藏獒群体遗传多样性分析第121-143页
  1. 材料与方法第122-124页
   ·试验动物第122页
   ·基因组DNA提取第122页
   ·PCR扩增和产物回收第122-123页
   ·克隆测序第123页
   ·序列整理第123页
   ·序列分析第123-124页
   ·系统发育分析第124页
  2. 结果与分析第124-136页
   ·藏獒线粒体基因组控制区全序列的遗传多样性分析第124-128页
   ·犬属8个群体线粒体控制区538bp高变区序列遗传多样性分析第128-129页
   ·犬属8个群体线粒体控制区538bp高变区Ⅰ序列单倍型分析第129-132页
   ·系统发育分析第132-136页
  3. 讨论第136-139页
   ·藏獒线粒体控制区序列变异第136-138页
   ·藏獒群体遗传多样性第138-139页
  参考文献第139-143页
第三部分 结论第143-145页
攻读博士学位期间发表的论文第145-147页
致谢第147页

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