| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-24页 |
| 1.1 断奶仔猪的生理特征与健康状况 | 第12-15页 |
| 1.1.1 断奶仔猪的生理特征 | 第12-14页 |
| 1.1.1.1 断奶仔猪消化道的特点 | 第12-13页 |
| 1.1.1.2 断奶仔猪的免疫系统 | 第13-14页 |
| 1.1.2 断奶仔猪的健康状况 | 第14-15页 |
| 1.2 仔猪肠道菌群的研究进展 | 第15-19页 |
| 1.2.1 肠道菌群与宿主健康 | 第15-17页 |
| 1.2.2 仔猪肠道菌群的建立过程 | 第17页 |
| 1.2.3 仔猪肠道菌群的研究现状 | 第17-19页 |
| 1.3 抗生素替代品的研究 | 第19-21页 |
| 1.3.1 抗生素的贡献及风险 | 第19页 |
| 1.3.2 饲用抗生素的替代品 | 第19-20页 |
| 1.3.3 益生菌的研究进展 | 第20-21页 |
| 1.4 肠道菌群研究技术的发展与分析方法 | 第21-24页 |
| 1.4.1 高通量测序 | 第21-22页 |
| 1.4.2 肠道菌群的统计学分析 | 第22-24页 |
| 第二章 仔猪从哺乳期到断奶期肠道菌群的发展研究 | 第24-52页 |
| 引言 | 第24页 |
| 2.1 材料与方法 | 第24-29页 |
| 2.1.1 动物实验设计与饲养管理 | 第24-25页 |
| 2.1.2 粪便样品元基因组DNA提取 | 第25-26页 |
| 2.1.3 粪便菌群16S rRNA基因V3-V4区Illumina测序 | 第26-28页 |
| 2.1.4 Illumina测序质控与数据的生物信息学分析。 | 第28-29页 |
| 2.2 实验结果 | 第29-48页 |
| 2.2.1 仔猪整体的肠道菌群结构 | 第29-32页 |
| 2.2.2 仔猪肠道菌群结构随时间的变化 | 第32-43页 |
| 2.2.3 仔猪肠道中的核心菌属 | 第43-46页 |
| 2.2.4 细菌的相互作用网络图分析 | 第46-48页 |
| 2.3 讨论 | 第48-51页 |
| 2.4 小结 | 第51-52页 |
| 第三章 Bacillis subtilis YK-1R对仔猪生长性能、肠道菌群的影响 | 第52-75页 |
| 引言 | 第52页 |
| 3.1 材料与方法 | 第52-57页 |
| 3.1.1 Bacillus subtilis YK-1R生长曲线的测定 | 第52-53页 |
| 3.1.2 Bacillus subtilus YK-1R菌株电镜形态 | 第53页 |
| 3.1.3 Bacillus subtilis YK-1R菌悬液制备 | 第53页 |
| 3.1.4 动物实验设计与饲养管理 | 第53-56页 |
| 3.1.5 粪便样品元基因组DNA提取及Illumina测序 | 第56页 |
| 3.1.6 Illumina测序质控与数据的生物信息学分析 | 第56页 |
| 3.1.7 统计分析 | 第56-57页 |
| 3.2 实验结果 | 第57-72页 |
| 3.2.1 Bacillus subtilis YK-1R生长曲线 | 第57-58页 |
| 3.2.2 Bacillus subtilis YK-1R的菌株形态 | 第58页 |
| 3.2.3 动物实验仔猪生长性能 | 第58-62页 |
| 3.2.4 腹泻率 | 第62-63页 |
| 3.2.5 Illumina测序细菌群落结构分析 | 第63-72页 |
| 3.3 讨论 | 第72-74页 |
| 3.4 小结 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-85页 |
| 附表 | 第85-90页 |
| 附录一 缩写与全称 | 第90-92页 |
| 附录二 试剂及配方 | 第92-93页 |
| 附录三 仪器设备 | 第93-94页 |
| 硕士期间已(待)发表的论文 | 第94-95页 |
| 致谢 | 第95-97页 |
