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莱茵衣藻标志蛋白质鉴定及油脂合成相关蛋白质表达研究

摘要第4-6页
abstract第6-7页
一、引言第12-34页
    1.1 微藻及其应用前景第12-14页
        1.1.1 微藻生物能源第12页
        1.1.2 微藻固碳第12-13页
        1.1.3 微藻作为外源蛋白质的表达系统第13-14页
    1.2 微藻细胞油脂合成机理第14-20页
        1.2.1 微藻油脂的合成代谢途径第14-16页
        1.2.2 藻种筛选及诱导培养第16-19页
        1.2.3 微藻的大规模培养第19-20页
    1.3 莱茵衣藻第20-29页
        1.3.1 莱茵衣藻基因组测序第20-21页
        1.3.2 莱茵衣藻突变体库及应用第21页
        1.3.3 莱茵衣藻TAG合成途径中的重要蛋白质第21-24页
        1.3.4 莱茵衣藻非生物胁迫应答第24-29页
    1.4 莱茵衣藻的内参蛋白质第29-31页
        1.4.1 内参蛋白质及其用途第29-30页
        1.4.2 常见的微藻内参蛋白质第30-31页
        1.4.3 内参蛋白质应用中的问题第31页
    1.5 逆境胁迫应答的蛋白质标志物第31-32页
        1.5.1 蛋白质标志物及其用途第31页
        1.5.2 莱茵衣藻的标志物蛋白质第31-32页
        1.5.3 蛋白质标志物应用中的问题第32页
    1.6 “组”学技术在莱茵衣藻研究中的应用第32-33页
    1.7 本研究的目的与意义第33-34页
二、材料与方法第34-42页
    2.1 试验材料第34-35页
        2.1.1 莱茵衣藻藻种第34页
        2.1.2 培养基第34页
        2.1.3 基因克隆表达试验所用工程菌及质粒载体第34页
        2.1.4 主要试剂第34页
        2.1.5 主要仪器设备第34-35页
    2.2 试验方法第35-42页
        2.2.1 试验方法藻种的复壮、杂菌去除及单克隆藻种的获得第35页
        2.2.2 莱茵衣藻预培养第35页
        2.2.3 莱茵衣藻非生物胁迫第35-36页
        2.2.4 莱茵衣藻表型观察与取材第36页
        2.2.5 总蛋白质的提取与定量第36页
        2.2.6 重组抗原的制备第36-37页
        2.2.7 多肽抗原的分析及抗体制备第37页
        2.2.8 Dot-blot试验第37页
        2.2.9 免疫印迹检测(Western blot,WB)第37-38页
        2.2.10 数据的采集与统计分析第38页
        2.2.11 细胞内油体的显微观察第38页
        2.2.12 中性脂含量测定第38-39页
        2.2.13 总酯含量测定第39页
        2.2.14 MRM蛋白质提取第39-40页
        2.2.15 MRM蛋白质的酶解第40页
        2.2.16 肽段的纯化第40页
        2.2.17 混合样本质谱检测第40页
        2.2.18 MRM方法建立第40-42页
三、结果与分析第42-86页
    3.1 藻种的纯化第42页
    3.2 莱茵衣藻液体生长曲线第42-43页
    3.3 非生物胁迫对莱茵衣藻生长的影响第43-47页
        3.3.1 细胞密度的变化第43-45页
        3.3.2 莱茵衣藻培养物的表型变化第45页
        3.3.3 总蛋白质含量的变化第45-47页
    3.4 标志蛋白质的选择第47页
    3.5 抗原蛋白质的表达、合成及抗体制备第47-48页
    3.6 抗体特异性验证第48-49页
    3.7 候选蛋白质的表达特征第49-54页
        3.7.1 结构与信号受体类蛋白质第49-50页
        3.7.2 光合作用类蛋白质第50-52页
        3.7.3 代谢相关类蛋白质第52页
        3.7.4 其它蛋白质第52-54页
    3.8 内参蛋白质的筛选第54-55页
    3.9 标志物蛋白质的筛选第55-56页
    3.10 油脂合成目标蛋白质的选择第56-58页
    3.11 多肽抗原设计及抗体制备第58-59页
    3.12 正常/缺氮培养莱茵衣藻表型观察第59-61页
        3.12.1 培养物颜色变化第59-60页
        3.12.2 细胞密度变化第60-61页
    3.13 缺氮胁迫对细胞形态与中性脂合成的影响第61-62页
    3.14 中性脂和总脂含量测定第62-64页
    3.15 总蛋白质含量变化第64-65页
    3.16 油脂合成途径重要蛋白质的表达特征第65-76页
        3.16.1 脂肪酸合成蛋白质第65-66页
        3.16.2 脂肪酸去饱和酶FAD7蛋白质第66-67页
        3.16.3 半乳糖脂合成蛋白质第67-68页
        3.16.4 磷脂合成蛋白质PIS1第68-69页
        3.16.5 硫脂合成蛋白质第69-70页
        3.16.6 二酰甘油三甲基高丝氨酸合成蛋白质第70-71页
        3.16.7 TAG合成相关蛋白质第71-72页
        3.16.8 油体结构蛋白质第72-73页
        3.16.9 脂类运输相关蛋白质第73-74页
        3.16.10 脂肪酶蛋白质第74-75页
        3.16.11 β-氧化途径相关蛋白质第75页
        3.16.12 调控蛋白质第75-76页
    3.17 MRM蛋白质提取与定量第76-77页
    3.18 MRM鉴定结果第77-78页
    3.19 靶标蛋白质的丰度变化第78-79页
    3.20 油脂合成相关蛋白质的选择第79-80页
    3.21 多肽抗原设计及抗体制备第80-81页
    3.22 候选蛋白质的表达特征第81-86页
        3.22.1 基于RNA-Seq数据确定的候选蛋白质第81-82页
        3.22.2 基于质谱技术确定的候选蛋白质第82-83页
        3.22.3 基于RT-PCR数据确定的候选蛋白质第83-84页
        3.22.4 基于遗传学试验确定的候选蛋白质第84页
        3.22.5 基于同源性分析确定的候选蛋白质第84-86页
四、小结与讨论第86-89页
    4.1 莱茵衣藻非生物胁迫应答第86页
    4.2 莱茵衣藻内参及标志物蛋白质的筛选鉴定第86-87页
    4.3 莱茵衣藻油脂合成途径重要蛋白质的表达特征研究-基于抗体的策略第87页
    4.4 莱茵衣藻油脂合成途径重要蛋白质的表达特征研究-基于质谱MRM的策略第87-88页
    4.5 莱茵衣藻油脂合成相关蛋白质的表达特征分析第88-89页
五、总结及展望第89-91页
    5.1 总结第89-90页
    5.2 展望第90-91页
参考文献第91-102页
附录第102-103页
在读期间发表的论文第103-104页
作者简历第104-105页
致谢第105页

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