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两种淡水龟微卫星标记的筛选及乌龟养殖群体遗传多样性分析

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-8页
目录第8-11页
第一章 文献综述第11-27页
 1 龟鳖类简介第11-16页
   ·龟鳖类概述第11-13页
     ·我国龟鳖类主要物种及地理分布第11-12页
     ·龟鳖类的经济价值及我国龟鳖类的养殖状况第12-13页
   ·我国淡水龟的野生资源第13-16页
     ·乌龟(Chinemys reevesii)的研究背景及研究概况第14-15页
     ·黄喉拟水龟(Mauremys mutica)的研究背景及研究概况第15-16页
 2 微卫星标记简介第16-25页
   ·微卫星的发现及概念第16-17页
   ·微卫星的类型、功能和产生机理第17-18页
   ·微卫星的优缺点第18-20页
   ·微卫星标记开发策略第20-23页
     ·经典法第20-21页
     ·省略筛库法第21页
     ·富集法第21-22页
     ·数据库查找法第22页
     ·跨种扩增法第22-23页
   ·微卫星标记在濒危动物保护和遗传育种中的作用第23-24页
     ·遗传多样性评估第23-24页
     ·群体遗传结构分析第24页
     ·遗传图谱构建第24页
     ·杂种优势预测第24页
   ·微卫星标记在龟鳖类以及其他濒危物种中的应用第24-25页
 3 本论文研究目的和意义第25-27页
第二章 磁珠富集法筛选乌龟微卫星引物第27-37页
 1 引言第27页
 2 材料和方法第27-33页
   ·材料第27-28页
     ·样本信息第27页
     ·主要试剂第27-28页
     ·主要仪器第28页
   ·实验方法第28-33页
     ·基因组DNA的提取第28-29页
     ·基因组DNA的酶切、接头连接及片段大小的选择第29-30页
     ·磁珠富集微卫星序列第30-32页
     ·将单链的目标SSR DNA序列恢复成双链第32页
     ·连接T载体,进行克隆转化第32页
     ·阳性克隆的PCR法筛选第32-33页
     ·序列整理和引物设计第33页
     ·多态性检测第33页
 3 数据分析第33-34页
 4 结果和讨论第34-37页
第三章 FIASCO法筛选黄喉拟水龟的微卫星引物第37-46页
 1 引言第37页
 2 材料和方法第37-42页
   ·材料第37-38页
     ·样本信息第37页
     ·主要试剂第37-38页
     ·主要仪器第38页
   ·实验方法第38-42页
     ·基因组DNA的提取第38页
     ·微卫星富集文库的构建第38-41页
     ·阳性克隆的PCR法筛选第41页
     ·序列整理和引物设计第41-42页
     ·多态性检测第42页
 3 数据分析第42页
 4 结果和讨论第42-46页
第四章 乌龟养殖群体的遗传多样性分析第46-62页
 1 引言第46-47页
 2 材料和方法第47-49页
   ·材料第47-48页
     ·样本信息第47-48页
     ·引物信息第48页
   ·方法第48-49页
     ·乌龟DNA的提取第48页
     ·基因分型第48-49页
 3 数据分析第49-50页
   ·哈迪-温伯格平衡的检测和群体遗传多样性分析第49页
   ·遗传分化和遗传结构第49-50页
   ·距离隔离(Isolation by Distance,IBD)模式第50页
 4 结果第50-57页
   ·群体间的遗传变异第50-52页
   ·遗传分化和群体结构第52-56页
   ·群体间的距离隔离模式第56-57页
 5 讨论第57-62页
   ·乌龟的遗传多样性第57-59页
   ·乌龟群体间的遗传分化第59-60页
   ·哈迪-温伯格平衡第60-62页
第五章 小结和展望第62-63页
参考文献第63-72页
致谢第72-73页
攻读学位期间发表的学术论文第73-74页

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