摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-8页 |
目录 | 第8-11页 |
第一章 文献综述 | 第11-27页 |
1 龟鳖类简介 | 第11-16页 |
·龟鳖类概述 | 第11-13页 |
·我国龟鳖类主要物种及地理分布 | 第11-12页 |
·龟鳖类的经济价值及我国龟鳖类的养殖状况 | 第12-13页 |
·我国淡水龟的野生资源 | 第13-16页 |
·乌龟(Chinemys reevesii)的研究背景及研究概况 | 第14-15页 |
·黄喉拟水龟(Mauremys mutica)的研究背景及研究概况 | 第15-16页 |
2 微卫星标记简介 | 第16-25页 |
·微卫星的发现及概念 | 第16-17页 |
·微卫星的类型、功能和产生机理 | 第17-18页 |
·微卫星的优缺点 | 第18-20页 |
·微卫星标记开发策略 | 第20-23页 |
·经典法 | 第20-21页 |
·省略筛库法 | 第21页 |
·富集法 | 第21-22页 |
·数据库查找法 | 第22页 |
·跨种扩增法 | 第22-23页 |
·微卫星标记在濒危动物保护和遗传育种中的作用 | 第23-24页 |
·遗传多样性评估 | 第23-24页 |
·群体遗传结构分析 | 第24页 |
·遗传图谱构建 | 第24页 |
·杂种优势预测 | 第24页 |
·微卫星标记在龟鳖类以及其他濒危物种中的应用 | 第24-25页 |
3 本论文研究目的和意义 | 第25-27页 |
第二章 磁珠富集法筛选乌龟微卫星引物 | 第27-37页 |
1 引言 | 第27页 |
2 材料和方法 | 第27-33页 |
·材料 | 第27-28页 |
·样本信息 | 第27页 |
·主要试剂 | 第27-28页 |
·主要仪器 | 第28页 |
·实验方法 | 第28-33页 |
·基因组DNA的提取 | 第28-29页 |
·基因组DNA的酶切、接头连接及片段大小的选择 | 第29-30页 |
·磁珠富集微卫星序列 | 第30-32页 |
·将单链的目标SSR DNA序列恢复成双链 | 第32页 |
·连接T载体,进行克隆转化 | 第32页 |
·阳性克隆的PCR法筛选 | 第32-33页 |
·序列整理和引物设计 | 第33页 |
·多态性检测 | 第33页 |
3 数据分析 | 第33-34页 |
4 结果和讨论 | 第34-37页 |
第三章 FIASCO法筛选黄喉拟水龟的微卫星引物 | 第37-46页 |
1 引言 | 第37页 |
2 材料和方法 | 第37-42页 |
·材料 | 第37-38页 |
·样本信息 | 第37页 |
·主要试剂 | 第37-38页 |
·主要仪器 | 第38页 |
·实验方法 | 第38-42页 |
·基因组DNA的提取 | 第38页 |
·微卫星富集文库的构建 | 第38-41页 |
·阳性克隆的PCR法筛选 | 第41页 |
·序列整理和引物设计 | 第41-42页 |
·多态性检测 | 第42页 |
3 数据分析 | 第42页 |
4 结果和讨论 | 第42-46页 |
第四章 乌龟养殖群体的遗传多样性分析 | 第46-62页 |
1 引言 | 第46-47页 |
2 材料和方法 | 第47-49页 |
·材料 | 第47-48页 |
·样本信息 | 第47-48页 |
·引物信息 | 第48页 |
·方法 | 第48-49页 |
·乌龟DNA的提取 | 第48页 |
·基因分型 | 第48-49页 |
3 数据分析 | 第49-50页 |
·哈迪-温伯格平衡的检测和群体遗传多样性分析 | 第49页 |
·遗传分化和遗传结构 | 第49-50页 |
·距离隔离(Isolation by Distance,IBD)模式 | 第50页 |
4 结果 | 第50-57页 |
·群体间的遗传变异 | 第50-52页 |
·遗传分化和群体结构 | 第52-56页 |
·群体间的距离隔离模式 | 第56-57页 |
5 讨论 | 第57-62页 |
·乌龟的遗传多样性 | 第57-59页 |
·乌龟群体间的遗传分化 | 第59-60页 |
·哈迪-温伯格平衡 | 第60-62页 |
第五章 小结和展望 | 第62-63页 |
参考文献 | 第63-72页 |
致谢 | 第72-73页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第73-74页 |