| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 引言 | 第10-20页 |
| 1. 植物杂交与多倍化研究进展 | 第10-12页 |
| 2. 非整倍体的研究进展 | 第12-14页 |
| 3. 水稻的重要性状及稻属的进化驯化历程 | 第14-16页 |
| 4. 二代测序技术简述 | 第16-17页 |
| 5. 全基因组关联分析研究进展 | 第17-20页 |
| 材料与方法 | 第20-32页 |
| 1. 实验材料 | 第20-21页 |
| 2. 实验方法 | 第21-32页 |
| 2.1 实验材料的种植 | 第21页 |
| 2.2 表型测量 | 第21-23页 |
| 2.3 样品的收集及基因组DNA的提取 | 第23-24页 |
| 2.4 重测序数据的获得及分析流程 | 第24-27页 |
| 2.5 非整倍体课题部分的统计与分析 | 第27-29页 |
| 2.6 GWAS分析流程 | 第29-32页 |
| 结果与分析 | 第32-65页 |
| 1. 实验中各群体——亲本群体、杂交种群体及新合成粳籼间四倍体水稻群体的表型特点 | 第32-36页 |
| 2. 根据重测序数据的分析结果从314个籼粳间部分同源四倍体水稻个体中筛选出186个整倍体植株及126个非整倍体植株 | 第36-40页 |
| 3. 非整倍体的产生对新合成粳籼间四倍体水稻的表型影响 | 第40-50页 |
| 3.1 大量非整倍体的获得涵盖了广泛的非整倍体类型 | 第40-41页 |
| 3.2 非整倍体发生的染色体偏好性分析 | 第41-43页 |
| 3.3 非整倍体对四倍体植株表型具有非染色体依赖的整体影响 | 第43-46页 |
| 3.4 特定非整倍体类型对特定表型的影响 | 第46-50页 |
| 3.5 一些非整倍体单株表现出的独特表型特点暗示着补偿效应的存在 | 第50页 |
| 4. 整倍体群体的全基因组关联分析 | 第50-65页 |
| 4.1 186个新合成粳籼间四倍体水稻整倍体中基因组重组特点的研究 | 第50-52页 |
| 4.2 应用于GWAS研究的186个新合成粳籼间四倍体水稻整倍体的群体特点 | 第52-55页 |
| 4.3 GWAS分析结果——一些控制水稻重要农艺性状的位点/基因的挖掘 | 第55-65页 |
| 讨论 | 第65-69页 |
| 结论 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-78页 |
| 附录 | 第78-86页 |
| 致谢 | 第86-87页 |
| 在学期间公开发表论文及著作情况 | 第87页 |