| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 第1章 绪论 | 第13-21页 |
| 1.1 研究的背景 | 第13-15页 |
| 1.2 硝酸盐异化还原 | 第15-17页 |
| 1.2.1 反硝化作用 | 第15-16页 |
| 1.2.2 硝酸盐异化还原成铵过程（DNRA） | 第16-17页 |
| 1.3 国内外研究现状及水平 | 第17-19页 |
| 1.3.1 DNRA的存在及测定 | 第17-18页 |
| 1.3.2 环境因子对DNRA过程的影响 | 第18-19页 |
| 1.4 研究目的及内容 | 第19-21页 |
| 1.4.1 研究目的 | 第19-20页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第20-21页 |
| 第2章 实验方法与材料 | 第21-29页 |
| 2.1 实验材料和仪器 | 第21-22页 |
| 2.1.1 实验仪器 | 第21页 |
| 2.1.2 实验材料 | 第21-22页 |
| 2.2 理化分析 | 第22页 |
| 2.3 传统分子生物学方法 | 第22-25页 |
| 2.3.1 DNA提取 | 第22页 |
| 2.3.2 聚合酶链式反应 | 第22页 |
| 2.3.3 克隆 | 第22-23页 |
| 2.3.4 实时荧光定量PCR | 第23-25页 |
| 2.4 高通量测序及生态网络的构建 | 第25-29页 |
| 2.4.1 高通量测序 | 第25-26页 |
| 2.4.2 生态网络的构建 | 第26页 |
| 2.4.3 数据处理与多样性分析 | 第26-29页 |
| 第3章 污水厂硝酸盐异化还原 | 第29-55页 |
| 3.1 引言 | 第29-30页 |
| 3.2 样品采集与实验分析 | 第30-31页 |
| 3.2.1 样品采集 | 第30页 |
| 3.2.2 样品环境因子 | 第30-31页 |
| 3.3 对污水厂活性污泥中DNRA菌进行克隆检验 | 第31-32页 |
| 3.4 活性污泥中DNRA细菌高通量测序及分析 | 第32-45页 |
| 3.4.1 高通量数据质量分析 | 第32-34页 |
| 3.4.2 DNRA菌群 α-多样性分析 | 第34-35页 |
| 3.4.3 DNRA菌群 β-多样性 | 第35-36页 |
| 3.4.4 DNRA群落组成分析 | 第36-39页 |
| 3.4.5 污水厂分子生态网络分析 | 第39-41页 |
| 3.4.6 利用实时荧光定量PCR技术检测DNRA细菌丰度 | 第41-45页 |
| 3.5 活性污泥中 16S rRNA高通量测序及分析 | 第45-51页 |
| 3.5.1 16S rRNA高通量数据质量优化 | 第45-46页 |
| 3.5.2 OTU分析及物种聚类 | 第46-47页 |
| 3.5.3 16S rRNA多样性分析 | 第47-48页 |
| 3.5.4 全细菌群落结构分析 | 第48-51页 |
| 3.6 讨论 | 第51-52页 |
| 3.7 本章小结 | 第52-55页 |
| 第4章 旱地土壤中硝酸盐异化还原细菌的群落组成 | 第55-73页 |
| 4.1 引言 | 第55-56页 |
| 4.2 样品采集与实验分析 | 第56-58页 |
| 4.2.1 样品采集 | 第56页 |
| 4.2.2 环境因子测定 | 第56-58页 |
| 4.3 研究结果 | 第58-68页 |
| 4.3.1 nrfA基因高通量测序结果 | 第58-59页 |
| 4.3.2 DNRA菌群多样性分析 | 第59-61页 |
| 4.3.3 DNRA菌群落结构分析 | 第61-63页 |
| 4.3.4 利用nrfA系统发育树进行分析 | 第63-64页 |
| 4.3.5 DNRA细菌与土壤理化因子相关性分析 | 第64-67页 |
| 4.3.6 旱地生态系统中DNRA细菌网络分析 | 第67-68页 |
| 4.4 讨论 | 第68-70页 |
| 4.5 本章小结 | 第70-73页 |
| 第5章 结论与展望 | 第73-75页 |
| 5.1 结论 | 第73-74页 |
| 5.2 展望 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-83页 |
| 攻读硕士学位期间论文发表及科研情况 | 第83-84页 |
| 致谢 | 第84页 |