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基于桑树ITS和叶绿体DNA序列的系统发生分析

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
第一章 文献综述第12-22页
    1.1 分子系统学第12页
    1.2 DNA序列在植物分子系统研究中的应用第12-18页
        1.2.1 核基因组DNA第12-14页
        1.2.2 叶绿体基因组DNA第14-18页
        1.2.3 线粒体基因组DNA第18页
    1.3 桑树的分类研究第18-19页
        1.3.1 桑树的经典分类第18-19页
        1.3.2 桑树分子系统学研究第19页
    1.4 桑属叶绿体基因组的研究现状第19-22页
第二章 引言第22-24页
    2.1 研究背景及意义第22页
    2.2 研究主要内容第22页
    2.3 技术路线第22-24页
第三章 桑树核ITS的序列分析第24-40页
    3.1 实验材料和试剂第24-27页
        3.1.1 实验材料第24-25页
        3.1.2 实验实用软件第25页
        3.1.3 实验试剂及溶液配制方法第25-26页
        3.1.4 溶液配制方法第26-27页
        3.1.5 实验仪器第27页
    3.2 实验方法第27-31页
        3.2.1 桑树基因组的提取第27-28页
        3.2.2 ITS序列的扩增和测序第28-30页
        3.2.3 序列的矫正、拼接以及序列的分析第30页
        3.2.4 系统发生树的重建第30-31页
    3.3 结果和分析第31-38页
        3.3.1 ITS序列特征分析第31-35页
        3.3.2 系统进化分析第35-37页
        3.3.3 基于ITS序列的白桑进化假设第37页
        3.3.4 关于ITS序列是否适合作为桑树分类标准的判断第37-38页
    3.4 小结与讨论第38-40页
第四章 基于cpDNA序列的桑树系统发育分析第40-62页
    4.1 实验材料和试剂第40-42页
        4.1.1 实验材料第40页
        4.1.2 实验实用软件第40页
        4.1.3 实验试剂第40页
        4.1.4 溶液配方第40-41页
        4.1.5 实验仪器第41-42页
    4.2 实验方法第42-46页
        4.2.1 桑树叶绿体基因组的提取方法第42-43页
        4.2.2 桑树叶绿体基因组的共线性分析和DNA序列的引物设计第43页
        4.2.3 桑树cpDNA的扩增与测序第43-44页
        4.2.4 序列的矫正、拼接以及序列的分析第44页
        4.2.5 系统发生树的重建第44-46页
    4.3 结果和分析第46-60页
        4.3.1 桑树叶绿体基因组的共线性比对结果以及引物的设计第46-47页
        4.3.2 叶绿体DNA序列的特征分析第47-58页
        4.3.3 叶绿体DNA序列联合建树第58-60页
    4.4 小结与讨论第60-62页
第五章 综合与讨论第62-64页
参考文献第64-70页
在读期间发表论文及参加课题第70-72页
致谢第72页

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