| 摘要 | 第7-11页 |
| ABSTRACT | 第11-15页 |
| 第1章 文献综述 | 第16-26页 |
| 1.1 牛多杀性巴氏杆菌病概述 | 第16-18页 |
| 1.1.1 病原 | 第16页 |
| 1.1.2 临床症状及病理变化 | 第16-17页 |
| 1.1.3 致病及免疫机理 | 第17页 |
| 1.1.4 防治 | 第17-18页 |
| 1.2 转录组测序概述 | 第18-19页 |
| 1.2.1 转录组测序技术方法 | 第18-19页 |
| 1.2.2 转录组测序技术在宿主-病原相互作用中的应用 | 第19页 |
| 1.3 Th1 | 第19-21页 |
| 1.3.1 IL12及IL12-STAT4信号转导 | 第19-20页 |
| 1.3.2 IFNγ及IFNγ-STAT1信号转导 | 第20-21页 |
| 1.4 Th2 | 第21页 |
| 1.5 Th17免疫 | 第21-23页 |
| 1.5.1 Th17细胞的分化 | 第21-22页 |
| 1.5.2 Th17信号转导的分子机制 | 第22-23页 |
| 1.6 氨基酸在炎症反应中的作用 | 第23-26页 |
| 第2章 引言 | 第26-30页 |
| 2.1 研究目的及意义 | 第26页 |
| 2.2 研究内容 | 第26-28页 |
| 2.2.1 多杀性巴氏杆菌小鼠肺炎模型的建立 | 第26页 |
| 2.2.2 小鼠肺组织转录组测序以及质量评估 | 第26-27页 |
| 2.2.3 从宿主免疫反应角度分析及验证 | 第27页 |
| 2.2.4 从宿主氨基酸角度分析及验证 | 第27-28页 |
| 2.3 技术路线 | 第28-30页 |
| 第3章 小鼠多杀性巴氏杆菌肺炎模型的建立 | 第30-38页 |
| 3.1 材料 | 第30-31页 |
| 3.1.1 菌种 | 第30页 |
| 3.1.2 试验动物 | 第30页 |
| 3.1.3 主要试剂 | 第30页 |
| 3.1.4 主要试剂的配制 | 第30-31页 |
| 3.1.5 主要仪器设备 | 第31页 |
| 3.2 方法 | 第31-33页 |
| 3.2.1 攻毒试验 | 第31页 |
| 3.2.2 细菌定殖 | 第31-32页 |
| 3.2.3 小鼠肺组织标本的采集和制作 | 第32页 |
| 3.2.4 荧光原位杂交(FISH) | 第32页 |
| 3.2.5 组织病理学观察 | 第32-33页 |
| 3.2.6 统计学分析 | 第33页 |
| 3.3 结果 | 第33-36页 |
| 3.3.1 存活率 | 第33-34页 |
| 3.3.2 细菌定殖 | 第34-35页 |
| 3.3.3 组织病理学变化 | 第35-36页 |
| 3.4 讨论 | 第36-38页 |
| 第4章 多杀性巴氏杆菌感染小鼠肺组织的免疫反应分析 | 第38-52页 |
| 4.1 材料 | 第38-39页 |
| 4.1.1 菌种 | 第38页 |
| 4.1.2 试验动物 | 第38页 |
| 4.1.3 主要试剂 | 第38-39页 |
| 4.1.4 主要试剂的配制 | 第39页 |
| 4.1.5 主要仪器设备 | 第39页 |
| 4.2 方法 | 第39-43页 |
| 4.2.1 攻毒试验 | 第39页 |
| 4.2.2 转录组测序 | 第39-40页 |
| 4.2.3 转录组生物信息分析 | 第40-41页 |
| 4.2.4 实时荧光定量PCR(qRT-PCR) | 第41-42页 |
| 4.2.5 酶联免疫吸附试验(ELISA) | 第42页 |
| 4.2.6 Western-blot | 第42-43页 |
| 4.2.7 统计学分析 | 第43页 |
| 4.3 结果 | 第43-48页 |
| 4.3.1 转录组测序质量评估 | 第43页 |
| 4.3.2 差异表达基因(DEGs)及其聚类 | 第43-45页 |
| 4.3.3 GO功能分析 | 第45-46页 |
| 4.3.4 KEGG功能分析 | 第46页 |
| 4.3.5 DEGs在免疫反应中的富集 | 第46-47页 |
| 4.3.6 DEGs的验证 | 第47-48页 |
| 4.4 讨论 | 第48-52页 |
| 第5章 多杀性巴氏杆菌感染小鼠肺组织的氨基酸代谢分析 | 第52-68页 |
| 5.1 材料 | 第52-53页 |
| 5.1.1 菌种 | 第52页 |
| 5.1.2 试验动物 | 第52页 |
| 5.1.3 主要试剂 | 第52页 |
| 5.1.4 主要试剂的配制 | 第52页 |
| 5.1.5 主要仪器设备 | 第52-53页 |
| 5.2 方法 | 第53-56页 |
| 5.2.1 氨基酸转录组分析及qRT-PCR验证 | 第53页 |
| 5.2.2 小鼠肺组织游离氨基酸浓度检测 | 第53页 |
| 5.2.3 生长曲线测定 | 第53页 |
| 5.2.4 细胞试验 | 第53-55页 |
| 5.2.5 动物试验 | 第55页 |
| 5.2.6 统计学分析 | 第55-56页 |
| 5.3 结果 | 第56-65页 |
| 5.3.1 转录组测序中氨基酸代谢富集及qRT-PCR验证 | 第56-59页 |
| 5.3.2 小鼠肺组织氨基酸浓度 | 第59-60页 |
| 5.3.3 Gly、Thr、Ser在体外对PmCQ2生长的影响 | 第60-61页 |
| 5.3.4 Gly、Thr、Ser在细胞水平对PmCQ2感染的影响 | 第61-63页 |
| 5.3.5 Ser在动物水平对PmCQ2感染的影响 | 第63-65页 |
| 5.4 讨论 | 第65-68页 |
| 第6章 结论 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-82页 |
| 附录 | 第82-88页 |
| 致谢 | 第88-90页 |
| 在学期间所发表的论文 | 第90页 |
