| 摘要 | 第6-8页 |
| abstract | 第8-9页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-18页 |
| 1.1 马铃薯块茎和试管薯概述 | 第11页 |
| 1.2 试管薯形成发育的调控机制研究进展 | 第11-16页 |
| 1.2.1 光周期对试管薯形成发育的研究进展 | 第11-13页 |
| 1.2.2 试管薯形成的蔗糖调控机制 | 第13-15页 |
| 1.2.3 光照和温度对试管薯形成的影响研究进展 | 第15-16页 |
| 1.3 转录组测序技术概述及基因注释和分类 | 第16-17页 |
| 1.4 课题的目的和意义 | 第17-18页 |
| 第二章 马铃薯试管薯形成相关的光糖同时响应基因筛选 | 第18-40页 |
| 2.1 材料与方法 | 第18-25页 |
| 2.1.1 材料 | 第18页 |
| 2.1.2 光周期处理和蔗糖处理差异表达基因 | 第18页 |
| 2.1.3 数据整理与分析方法 | 第18-22页 |
| 2.1.3.1 光周期处理测序标签比对及差异表达基因筛选 | 第18-20页 |
| 2.1.3.2 蔗糖处理数据组装及差异表达基因筛选 | 第20页 |
| 2.1.3.3 GO和KEGG富集分析方法 | 第20-22页 |
| 2.1.4 候选基因表达的定量分析方法 | 第22-25页 |
| 2.1.4.1 总RNA提取 | 第22-23页 |
| 2.1.4.2 反转录 | 第23页 |
| 2.1.4.3 Real-time quantitativeRT-PCR(qPCR)定量检测 | 第23-25页 |
| 2.2 .结果与分析 | 第25-40页 |
| 2.2.1 光周期处理的差异表达基因筛选 | 第25-28页 |
| 2.2.2 蔗糖响应差异表达基因筛选 | 第28-29页 |
| 2.2.3 光周期与蔗糖共同调控块茎形成的差异表达基因筛选 | 第29-31页 |
| 2.2.4 光周期与蔗糖同时响应基因的GO功能分析 | 第31-34页 |
| 2.2.5 光周期与蔗糖同时响应基因的KEGG功能分析 | 第34-37页 |
| 2.2.6 候选基因表达的定量分析 | 第37-40页 |
| 第三章 试管薯形成的耐热基因型筛选 | 第40-46页 |
| 3.1 材料与方法 | 第40-42页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第40-41页 |
| 3.1.2 光温协同调控试管薯形成相关基因的筛选思路和技术路线 | 第41-42页 |
| 3.1.2.1 基础苗的培养及繁殖 | 第41页 |
| 3.1.2.2 试管薯的诱导培养 | 第41页 |
| 3.1.2.3 数据记录和统计分析 | 第41-42页 |
| 3.2 结果与分析 | 第42-46页 |
| 3.2.1 耐热性筛选鉴定的温度确定 | 第42-43页 |
| 3.2.2 耐高温性差异基因型筛选鉴定 | 第43-46页 |
| 第四章 讨论 | 第46-50页 |
| 4.1 第一代RNA-seq测序技术资料再分析 | 第46页 |
| 4.2 光周期和蔗糖同时响应基因深入探究 | 第46-49页 |
| 4.3 光周期和温度对块茎形成的影响探究和展望 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-55页 |
| 附录 | 第55-62页 |
| 附录A1 | 第55-56页 |
| 附录A2 | 第56-57页 |
| 附录B | 第57-61页 |
| 附录C | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
