基于加权的随机游走的蛋白质功能预测
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 绪论 | 第9-15页 |
| 1.1 课题研究背景 | 第9-12页 |
| 1.1.1 生物信息学的形成与发展 | 第9-10页 |
| 1.1.2 生物信息学数据库 | 第10-12页 |
| 1.2 课题研究意义 | 第12页 |
| 1.3 论文主要研究内容 | 第12-13页 |
| 1.4 论文的结构 | 第13-15页 |
| 2 基于网络的蛋白质功能预测相关研究 | 第15-23页 |
| 2.1 蛋白质相互作用网络 | 第15-16页 |
| 2.2 蛋白质功能预测算法概述 | 第16-18页 |
| 2.3 基于蛋白质相互作用网络的功能预测方法 | 第18-21页 |
| 2.3.1 基于网络拓扑的方法 | 第19-20页 |
| 2.3.2 基于功能模块的方法 | 第20-21页 |
| 2.4 蛋白质功能描述体系 | 第21-23页 |
| 3 基于加权的双随机游走的蛋白质功能预测 | 第23-38页 |
| 3.1 问题来源 | 第23页 |
| 3.2 随机游走模型 | 第23-24页 |
| 3.3 基于加权的双随机游走算法描述及相关定义 | 第24-29页 |
| 3.3.1 功能相似性网络 | 第24-25页 |
| 3.3.2 蛋白质相互作用加权网络 | 第25-26页 |
| 3.3.3 算法描述 | 第26-29页 |
| 3.4 实验结果 | 第29-36页 |
| 3.4.1 实验数据与评价指标 | 第29-31页 |
| 3.4.2 基于GO Term角度验证性能 | 第31-32页 |
| 3.4.3 基于Protein角度验证性能 | 第32-33页 |
| 3.4.4 UBiRW算法的参数分析 | 第33-34页 |
| 3.4.5 已知蛋白质-功能映射关系统计分析 | 第34-36页 |
| 3.5 本章小结 | 第36-38页 |
| 4 基于加权的三随机游走的蛋白质功能预测 | 第38-47页 |
| 4.1 问题来源 | 第38-39页 |
| 4.2 加权的三随机游走算法描述及相关定义 | 第39-43页 |
| 4.2.1 实验网络构建与分析 | 第39-40页 |
| 4.2.2 算法描述 | 第40-43页 |
| 4.3 实验结果 | 第43-45页 |
| 4.3.1 实验数据 | 第43页 |
| 4.3.2 基于GO Term角度验证性能 | 第43-44页 |
| 4.3.3 基于Protein角度验证性能 | 第44-45页 |
| 4.4 本章小结 | 第45-47页 |
| 5 总结与展望 | 第47-49页 |
| 5.1 论文研究贡献与创新点 | 第47-48页 |
| 5.2 研究展望 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-56页 |
| 攻读硕士学位期间主要的研究成果 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57页 |
