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稻谷耐储性能的转录组学分析

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
缩略词第8-14页
第1章 绪论第14-28页
    1.1 我国粮食储藏现状第14-15页
    1.2 粮食储藏国内外研究现状第15-23页
        1.2.1 稻谷储藏与环境第15-16页
        1.2.2 稻谷储藏与淀粉第16页
        1.2.3 稻谷储藏与蛋白质第16-17页
        1.2.4 稻谷储藏与脂类第17-18页
        1.2.5 种子储藏与基因第18-23页
            1.2.5.1 与DNA修复有关的基因第18-19页
            1.2.5.2 与蛋白质修复有关的基因第19-20页
            1.2.5.3 与抗氧化有关的基因第20-22页
            1.2.5.4 与玻璃体形成有关的基因第22-23页
    1.3 异天冬氨酸甲基转移酶(Protein L-isoaspartyl Methyltransferase,PIMT)第23-25页
        1.3.1 PIMT修复机制第23-24页
        1.3.2 PIMT研究进展第24-25页
            1.3.2.1 PIMT与低等生物第24页
            1.3.2.2 PIMT与动物第24页
            1.3.2.3 PIMT与植物第24-25页
    1.4 转录组学第25-26页
    1.5 研究的目的与意义第26-27页
    1.6 技术路线第27-28页
第2章 水稻品种的筛选第28-36页
    2.1 引言第28页
    2.2 材料与设备第28-29页
        2.2.1 实验材料第28页
        2.2.2 主要设备第28-29页
    2.3 实验方法第29页
        2.3.1 稻谷初始含水量测定第29页
        2.3.2 人工老化实验第29页
        2.3.3 发芽率测定第29页
        2.3.4 电导率测定第29页
    2.4 结果与分析第29-34页
        2.4.1 稻谷发芽率及P_(50)第29-32页
        2.4.2 稻谷各老化时间下电导率值第32-33页
        2.4.3 稻谷P_(50)与电导率相关性分析第33-34页
    2.5 本章总结第34-36页
第3章 转录组学分析第36-40页
    3.1 引言第36页
    3.2 实验材料第36-37页
    3.3 实验方法第37页
        3.3.1 样品处理第37页
        3.3.2 分析方法第37页
    3.4 结果与分析第37-39页
        3.4.1 老化前后稻谷转录本表达差异第37-38页
        3.4.2 不同品种老化前后基因表达差异第38页
        3.4.3 储藏相关基因筛选第38-39页
        3.4.4 陈化相关基因筛选第39页
    3.5 本章总结第39-40页
第4章 稻谷PIMT1基因生物信息学分析及其功能初探第40-53页
    4.1 引言第40-41页
    4.2 材料与设备第41页
        4.2.1 实验材料第41页
        4.2.2 主要设备与试剂第41页
    4.3 实验方法第41-44页
        4.3.1 植物中PIMT基因序列的获得第41页
        4.3.2 植物PIMT蛋白家族的同源性与进化树分析第41页
        4.3.3 稻谷总RNA提取第41-42页
        4.3.4 总RNA定量及质量测定第42页
        4.3.5 引物设计第42页
        4.3.6 cDNA合成第42-43页
        4.3.7 qPCR定量方法第43页
        4.3.8 数据分析第43-44页
    4.4 结果与分析第44-52页
        4.4.1 稻谷PIMT1基因结构分析第44-45页
        4.4.2 植物中PIMT蛋白同源性分析第45-49页
        4.4.3 PIMT基因家族进化关系第49页
        4.4.4 稻谷总RNA的提取第49-50页
        4.4.5 Cq值与pTriEX-4/PIMT1浓度标准曲线第50页
        4.4.6 稻谷PIMT1转录水平表达量第50-52页
    4.5 本章总结第52-53页
第5章 水稻PIMT1基因的克隆及载体构建第53-66页
    5.1 引言第53页
    5.2 材料与设备第53-56页
        5.2.1 实验材料第53-54页
        5.2.2 主要设备与试剂第54-56页
    5.3 实验方法第56-60页
        5.3.1 稻谷总RNA提取第56页
        5.3.2 总RNA浓度及纯度的测定第56页
        5.3.3 RNA非变性琼脂糖凝胶电泳第56页
        5.3.4 cDNA合成第56-57页
        5.3.5 设计合成引物第57页
        5.3.6 PCR反应体系第57页
        5.3.7 DNA琼脂糖凝胶电泳检测第57-58页
        5.3.8 DNA纯化第58页
        5.3.9 琼脂糖胶回收纯化第58页
        5.3.10 DNA酶切第58页
        5.3.11 PIMT1与pTriEX-4连接反应第58-59页
        5.3.12 感受态细胞转化第59页
        5.3.13 细菌扩大培养及菌落PCR鉴定第59页
        5.3.14 质粒提取第59-60页
        5.3.15 测序鉴定第60页
        5.3.16 菌种保存第60页
    5.4 结果与分析第60-64页
        5.4.1 稻谷总RNA提取第60-61页
        5.4.2 稻谷PIMT基因克隆第61-62页
        5.4.3 稻谷PIMT1表达载体构建及鉴定第62-63页
        5.4.4 测序结果鉴定第63-64页
    5.5 本章总结第64-66页
第6章 稻谷PIMT1蛋白表达及对大肠杆菌抗热胁迫能力的影响第66-76页
    6.1 引言第66页
    6.2 材料与设备第66-69页
        6.2.1 实验材料第66页
        6.2.2 实验设备与试剂第66-69页
    6.3 实验方法第69-72页
        6.3.1 pTriEX-4/OsPIMT1重组质粒的提取第69页
        6.3.2 BL21 (DE3)感受态细胞转化第69页
        6.3.3 pTriEX-4/Os PIMT1融合蛋白的诱导表达第69-70页
        6.3.4 可溶性蛋白和不可溶性蛋白分离第70页
        6.3.5 SDS-PAGE分析PIMT蛋白表达第70页
        6.3.6 Western-Blotting检测第70-71页
        6.3.7 菌落生长率实验第71-72页
    6.4 结果与分析第72-74页
        6.4.1 pTriEX-4/OsPIMT1融合蛋白的诱导表达第72页
        6.4.2 表达蛋白可溶性鉴定第72-73页
        6.4.3 稻谷PIMT1对大肠杆菌抗热胁迫能力的影响第73-74页
    6.5 本章总结第74-76页
第7章 全文结论、创新点及展望第76-80页
    7.1 全文结论第76-77页
    7.2 创新点第77页
    7.3 展望第77-80页
参考文献第80-92页
致谢第92页

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