| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-23页 |
| 1.1 嗜盐微生物简介 | 第11-12页 |
| 1.1.1 嗜盐微生物 | 第11页 |
| 1.1.2 嗜盐微生物生存的环境 | 第11-12页 |
| 1.2 嗜盐微生物的分类 | 第12-14页 |
| 1.2.1 嗜盐古菌 | 第12-13页 |
| 1.2.2 嗜盐细菌 | 第13-14页 |
| 1.3 嗜盐菌的研究概况 | 第14-15页 |
| 1.3.1 基因水平转移 | 第14页 |
| 1.3.2 生物技术领域的应用 | 第14-15页 |
| 1.4 极端嗜盐菌 | 第15-17页 |
| 1.4.1 概述 | 第15-16页 |
| 1.4.2 特性 | 第16-17页 |
| 1.4.3 极端性产物 | 第17页 |
| 1.5 次级代谢产物概述 | 第17-20页 |
| 1.5.1 聚酮类化合物 | 第18-19页 |
| 1.5.2 非核糖体肽 | 第19-20页 |
| 1.6 四氢嘧啶 | 第20-22页 |
| 1.6.1 四氢嘧啶概述 | 第20页 |
| 1.6.2 四氢嘧啶合成途径 | 第20-21页 |
| 1.6.3 生物学功能及应用 | 第21-22页 |
| 1.7 研究目的及意义 | 第22-23页 |
| 第二章 边界极端嗜盐菌JG5、JG9的分类鉴定 | 第23-31页 |
| 2.1 材料 | 第23页 |
| 2.1.1 菌株 | 第23页 |
| 2.1.2 试剂 | 第23页 |
| 2.2 方法 | 第23-26页 |
| 2.2.1 吉兰泰盐湖嗜盐菌耐盐梯度实验 | 第23-24页 |
| 2.2.2 JG5、JG9形态特征与生理生化特性 | 第24-25页 |
| 2.2.2.1 形态特征观察 | 第24页 |
| 2.2.2.2 生理生化特征 | 第24-25页 |
| 2.2.3 JG5、JG9的16SrDNA序列分析与系统发育树构建 | 第25-26页 |
| 2.3 结果与分析 | 第26-30页 |
| 2.3.1 吉兰泰盐湖土壤嗜盐菌耐盐特性统计 | 第26-27页 |
| 2.3.2 边界极端嗜盐菌(JG5、JG9)生物学特性统计结果 | 第27-29页 |
| 2.3.2.1 形态特征观察 | 第27-29页 |
| 2.3.2.2 生理生化特征 | 第29页 |
| 2.3.3 基于16SrRNA基因序列的系统发育分析 | 第29-30页 |
| 2.3.3.1 菌株JG5、JG9的16SrDNA序列扩增 | 第29-30页 |
| 2.3.3.2 菌株JG5、JG9的N-J进化树构建 | 第30页 |
| 2.4 讨论 | 第30-31页 |
| 第三章 菌株JG5、JG9的生产四氢嘧啶研究 | 第31-36页 |
| 3.1 材料 | 第31页 |
| 3.2 方法 | 第31-32页 |
| 3.2.1 含有ectoine基因簇菌株的筛选 | 第31页 |
| 3.2.2 菌株生产四氢嘧啶的提取及薄层层析定性分析 | 第31-32页 |
| 3.2.2.1 四氢嘧啶的生产与提取 | 第31-32页 |
| 3.2.2.2 Ectoine的薄层层析(TLC)定性分析 | 第32页 |
| 3.2.3 菌株JG5、JG9生产四氢嘧啶的HPLC定量检测 | 第32页 |
| 3.3 结果与分析 | 第32-35页 |
| 3.3.1 含有ectoine基因簇菌株的筛选 | 第32-33页 |
| 3.3.2 Ectoine的TLC定性分析 | 第33-34页 |
| 3.3.3 不同盐浓度下JG5、JG9胞内ectoine的HPLC定量检测分析 | 第34-35页 |
| 3.4 讨论 | 第35-36页 |
| 第四章 菌株JG5、JG9的基因组生物信息学分析 | 第36-62页 |
| 4.1 材料 | 第36页 |
| 4.2 方法 | 第36-39页 |
| 4.2.1 菌株JG5、JG9的大量培养 | 第36页 |
| 4.2.2 JG5、JG9基因组DNA的提取 | 第36页 |
| 4.2.3 JG5、JG9基因组序列的测定 | 第36-37页 |
| 4.2.3.1 测序方法 | 第36页 |
| 4.2.3.2 序列组装 | 第36-37页 |
| 4.2.4 JG5、JG9的完整基因组注释与分析 | 第37-39页 |
| 4.2.4.1 编码基因的预测 | 第37页 |
| 4.2.4.2 非编码RNA的预测 | 第37页 |
| 4.2.4.3 重复序列的预测 | 第37页 |
| 4.2.4.4 基因功能注释 | 第37-38页 |
| 4.2.4.5 分泌蛋白预测 | 第38页 |
| 4.2.4.6 次级代谢基因簇分析 | 第38-39页 |
| 4.2.4.7 毒力或致病性分析 | 第39页 |
| 4.3 结果与分析 | 第39-61页 |
| 4.3.1 菌株JG5、JG9基因组DNA的提取 | 第39页 |
| 4.3.2 测序样品原始数据与有效数据 | 第39页 |
| 4.3.3 基因组测序组装结果 | 第39-40页 |
| 4.3.4 JG5与JG9基因组注释分析结果 | 第40-61页 |
| 4.3.4.1 编码基因 | 第40-41页 |
| 4.3.4.2 非编码RNA预测结果 | 第41页 |
| 4.3.4.3 重复序列分析 | 第41-42页 |
| 4.3.4.4 基因功能注释统计 | 第42-51页 |
| 4.3.4.5 分泌蛋白预测结果 | 第51页 |
| 4.3.4.6 次级代谢产物基因簇分析结果 | 第51-60页 |
| 4.3.4.7 PHI数据库注释 | 第60-61页 |
| 4.4 讨论 | 第61-62页 |
| 第五章 结论 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 作者简介 | 第71页 |
