| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-28页 |
| ·棉花纤维的发育过程 | 第12-13页 |
| ·棉纤维发育相关基因和EST 研究 | 第13-17页 |
| ·棉纤维发育相关基因研究进展 | 第13-16页 |
| ·棉纤维发育相关ESTs 和表达谱研究进展 | 第16-17页 |
| ·基因芯片技术及其应用 | 第17-24页 |
| ·基因芯片的概念 | 第17页 |
| ·基因芯片技术的发展历程 | 第17-18页 |
| ·基因芯片的分类 | 第18-19页 |
| ·基因芯片在植物研究中的应用 | 第19-22页 |
| ·Affymetrix 基因芯片技术 | 第22-24页 |
| ·基因芯片技术在棉花研究中应用与进展 | 第24页 |
| ·实时荧光定量PCR 在植物基因表达分析中的应用 | 第24-26页 |
| ·本研究的目的意义和主要研究内容 | 第26-28页 |
| 第二章 陆海高代回交重组近交系田间表型性状、分子标记以及基因表达谱的比较分析 | 第28-41页 |
| ·材料与方法 | 第28-31页 |
| ·植物材料 | 第28页 |
| ·性状调查 | 第28页 |
| ·田间数据的处理和分析 | 第28-29页 |
| ·取材方法 | 第29页 |
| ·总RNA 的提取 | 第29-30页 |
| ·棉花基因组芯片的规格 | 第30-31页 |
| ·基因芯片杂交试验 | 第31页 |
| ·结果与分析 | 第31-40页 |
| ·海陆亲本及其回交后代田间表型性状遗传变异分析 | 第31-36页 |
| ·海陆亲本及其回交后代SSR 标记的遗传差异分析 | 第36-38页 |
| ·海陆亲本及其回交后代基因芯片的差异表达分析 | 第38-40页 |
| ·小结 | 第40-41页 |
| 第三章 纤维发育时期海岛棉与陆地棉差异基因表达的比较分析 | 第41-70页 |
| ·材料和方法 | 第41-48页 |
| ·植物材料 | 第41页 |
| ·田间数据的处理和分析 | 第41页 |
| ·取材方法 | 第41页 |
| ·棉花基因组芯片 | 第41页 |
| ·基因芯片的杂交数据分析 | 第41-42页 |
| ·差异表达基因的功能预测分类 | 第42页 |
| ·总RNA 的提取和cDNA 的合成 | 第42-43页 |
| ·RT-PCR 检验 | 第43-46页 |
| ·实时荧光定量PCR 的检测 | 第46-48页 |
| ·结果与分析 | 第48-66页 |
| ·田间数据分析结果 | 第48-49页 |
| ·SSR 分子标记结果 | 第49页 |
| ·基因芯片检测与数据分析结果 | 第49-51页 |
| ·差异表达基因的功能预测 | 第51-55页 |
| ·总RNA 和cDNA 的质量鉴定 | 第55-56页 |
| ·差异表达基因的RT-PCR 检测结果 | 第56-59页 |
| ·差异表达基因的实时荧光定量PCR 验证 | 第59-66页 |
| ·讨论 | 第66-69页 |
| ·陆地棉与海岛棉种间表型和DNA 与RNA 表达水平上的差异 | 第66页 |
| ·基因芯片结果的实时荧光定量PCR 验证 | 第66-67页 |
| ·海陆差异表达的纤维发育有关基因 | 第67-68页 |
| ·不同Tublin 基因的海陆表达差异 | 第68-69页 |
| ·纤维特异表达的基因 | 第69页 |
| ·小结 | 第69-70页 |
| 第四章 棉纤维长度，强度，细度相关基因表达谱的比较分析以及差异表达基因的筛选及验证 | 第70-96页 |
| ·材料与方法 | 第70-72页 |
| ·植物材料 | 第70页 |
| ·田间数据的处理和分析 | 第70页 |
| ·取材方法 | 第70页 |
| ·棉花基因组芯片实验 | 第70页 |
| ·基因芯片的数据分析 | 第70-71页 |
| ·总RNA 的提取和cDNA 的合成 | 第71页 |
| ·实时荧光定量PCR 的检测 | 第71-72页 |
| ·结果与分析 | 第72-94页 |
| ·田间数据分析结果 | 第72-73页 |
| ·棉纤维长度，强度，细度相关基因表达谱分析 | 第73-84页 |
| ·总RNA 和cDNA 的质量鉴定 | 第84-85页 |
| ·差异表达基因的实时荧光定量PCR 验证 | 第85-94页 |
| ·讨论 | 第94-95页 |
| ·小结 | 第95-96页 |
| 参考文献 | 第96-105页 |
| 致谢 | 第105-106页 |
| 作者简介 | 第106页 |
