| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-18页 |
| 1.1 研究背景 | 第10-16页 |
| 1.1.1 打分函数简介 | 第10-12页 |
| 1.1.2 量子力学方法的优势 | 第12-13页 |
| 1.1.3 Beta-2 肾上腺素受体晶体结构发现 | 第13-16页 |
| 1.2 研究意义 | 第16-17页 |
| 1.3 本论文结构 | 第17-18页 |
| 第二章 理论基础 | 第18-23页 |
| 2.1 受体与配体相互作用 | 第18-20页 |
| 2.1.1 受体概念的起源与分子对接 | 第18-19页 |
| 2.1.2 相互作用力 | 第19-20页 |
| 2.2 自由能计算 | 第20-21页 |
| 2.3 PM7理论中焓变的计算 | 第21-23页 |
| 第三章 量子化学方法研究受体与配体相互作用 | 第23-46页 |
| 3.1 材料与方法 | 第23-27页 |
| 3.1.1 蛋白质模型准备 | 第23-26页 |
| 3.1.2 研究方法流程 | 第26-27页 |
| 3.2 结果与分析 | 第27-45页 |
| 3.2.1 活性与非活性状态下晶体的比较 | 第27-28页 |
| 3.2.2 不同小分子引起的结合口袋分析 | 第28-32页 |
| 3.2.3 ADRB2与配体重要的相互作用位点 | 第32-35页 |
| 3.2.4 原始晶体结构与PM7结构比较 | 第35-37页 |
| 3.2.5 基于结构相互作用指纹的分析 | 第37-39页 |
| 3.2.6 对接结果分析 | 第39-45页 |
| 3.3 本章小结 | 第45-46页 |
| 第四章 量子化学与分子动力学模拟综合研究相互作用 | 第46-56页 |
| 4.1 理论模型 | 第46-48页 |
| 4.2 计算方法 | 第48-51页 |
| 4.2.1 体系构建 | 第48-49页 |
| 4.2.2 分子动力学模拟 | 第49-50页 |
| 4.2.3 结合能的计算 | 第50-51页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第51-54页 |
| 4.3.1 动力学模拟前后结构特点 | 第51-52页 |
| 4.3.2 内源性配体与其他配体结合能比较 | 第52-54页 |
| 4.3.3 不同构象采样帧结构的比较 | 第54页 |
| 4.4 本章小结 | 第54-56页 |
| 第五章 总结与展望 | 第56-58页 |
| 5.1 全文总结 | 第56-57页 |
| 5.2 工作展望 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-66页 |
| 攻读硕士期间取得的成果 | 第66-67页 |
| 附录 | 第67-71页 |