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Shewanella oneidensis脂肪酸生物合成及其调控的研究

致谢第6-10页
摘要第10-12页
Abstract第12-14页
1 绪论第15-34页
    1.1 Ⅱ型脂肪酸合成途径(FAS Ⅱ)第15-23页
        1.1.1 Ⅱ型脂肪酸合成途径(FAS Ⅱ)概述第16-19页
        1.1.2 Ⅱ型脂肪酸合成途径(FAS Ⅱ)的功能酶第19-21页
        1.1.3 Ⅱ型脂肪酸合成途径(FAS Ⅱ)的产物及其功能第21-23页
    1.2 支链脂肪酸的合成途径第23-24页
    1.3 不饱和脂肪酸的合成途径第24-27页
        1.3.1 不饱和脂肪酸的无氧合成途径第24-25页
        1.3.2 不饱和脂肪酸的有氧合成途径第25-27页
        1.3.3 多不饱和脂肪酸的合成途径第27页
    1.4 细菌脂肪酸合成的调控第27-32页
        1.4.1 细菌脂肪酸合成的调控蛋白第28页
        1.4.2 E.coli中FadR调控脂肪酸的合成和降解第28-30页
        1.4.3 E.coli中FabR调控不饱和脂肪酸的合成第30-31页
        1.4.4 P.aeruginosa中Δ9酰基去饱和酶的调控第31页
        1.4.5 革兰氏阳性菌中脂肪酸合成的调控第31-32页
    1.5 脂肪酸合成途径在S.oneidensis中的研究背景和立项依据第32-34页
2 S.oneidensis中IPTG诱导蛋白表达和GFP报告系统的构建第34-47页
    2.1 材料与方法第35-39页
        2.1.1 供试菌株、质粒及细胞培养条件第35-37页
        2.1.2 构建IPTG诱导表达体系第37-38页
        2.1.3 构建和表达GFP融合蛋白第38页
        2.1.4 点突变第38页
        2.1.5 荧光共聚焦显微镜分析第38页
        2.1.6 蛋白表达分析第38-39页
        2.1.7 生物信息学和数据分析第39页
    2.2 结果与分析第39-46页
        2.2.1 适用于S.oneidensis研究的IPTG诱导表达体系的构建第39-40页
        2.2.2 适用于S.oneidensis研究的IPTG诱导表达体系的验证第40-42页
        2.2.3 IPTG诱导表达GFP融合蛋白体系的构建和验证第42-46页
    2.3 讨论第46-47页
3 S.oneidensis FabR和FadR调控不饱和脂肪酸的有氧和无氧合成途径第47-68页
    3.1 材料与方法第48-55页
        3.1.1 供试菌株、质粒及细胞培养条件第48-49页
        3.1.2 突变株和回补质粒的构建第49-51页
        3.1.3 基因表达分析第51-52页
        3.1.4 脂肪酸含量和成分的测定第52-53页
        3.1.5 细菌单杂交试验第53-54页
        3.1.6 S.oneidensis FadR的表达和纯化第54页
        3.1.7 凝胶阻滞分析(Electrophoretic Mobility Shift Assay)第54-55页
        3.1.8 生物信息学分析第55页
    3.2 结果与分析第55-65页
        3.2.1 S.oneidensis含有不饱和脂肪酸合成的无氧和有氧两条途径第55-58页
        3.2.2 S.oneidensis FabR和FadR调控不饱和脂肪酸合成的无氧和有氧途径第58-59页
        3.2.3 S.oneidensis中FabA或FadR的缺失显著影响细胞内脂肪酸的含量和成分第59-60页
        3.2.4 S.oneidensis中不饱和脂肪酸无氧合成途径的缺失诱导desA基因表达增加第60-62页
        3.2.6 S.oneidensis中FadR直接调控FabA但不直接调控DesA第62-64页
        3.2.7 S.oneidensis的FabR直接抑制fabA和desA基因转录第64-65页
    3.3 讨论第65-68页
4 S.oneidensis FabB功能和表达调控特征的研究第68-80页
    4.1 材料与方法第69-71页
        4.1.1 供试菌株、质粒及细胞培养条件第69-70页
        4.1.2 突变株和回补质粒的构建第70页
        4.1.3 基因表达分析第70页
        4.1.4 脂肪酸含量和成分的测定第70页
        4.1.5 细胞色素c蛋白染色实验第70-71页
        4.1.6 生物信息学分析第71页
    4.2 结果与分析第71-78页
        4.2.1 S.oneidens fabB(S03072)缺失突变株表型分析第71-74页
        4.2.2 S.oneidensis FabB过表达导致细胞死亡第74-75页
        4.2.3 FadR调控fabB的转录但FabR不调控fabB的转录第75-77页
        4.2.4 FadR对FabB表达的调控并不是通过直接调控FabA的表达而实现的第77-78页
    4.3 讨论第78-80页
5 S.oneidensis ΔfadR表型的相关研究第80-92页
    5.1 材料和方法第81-83页
        5.1.1 供试菌株、质粒及细胞培养条件第81页
        5.1.2 突变株和质粒的构建第81-82页
        5.1.3 基因表达分析第82页
        5.1.4 脂肪酸含量和成分的测定第82-83页
        5.1.5 转座子随机插入突变及随机引物鉴定第83页
        5.1.6 生物信息学分析第83页
    5.2 结果和分析第83-90页
        5.2.1 基本培养基M1中添加油酸不能回复S.oneidensis ΔfadR的生长缺陷第83-85页
        5.2.2 M1中添加异亮氨酸能回复S.oneidensis ΔfadR的生长缺陷第85-87页
        5.2.3 利用转座子技术筛选在M1中ΔfadR生长部分回复的突变株第87-90页
    5.3 讨论第90-92页
6 论文总结第92-95页
    6.1 主要研究结论第92-93页
    6.2 创新之处第93-94页
    6.3 不足之处及未来研究方向展望第94-95页
参考文献第95-113页
附件:攻读博士学位期间的主要成果第113页

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