致谢 | 第6-10页 |
摘要 | 第10-12页 |
Abstract | 第12-14页 |
1 绪论 | 第15-34页 |
1.1 Ⅱ型脂肪酸合成途径(FAS Ⅱ) | 第15-23页 |
1.1.1 Ⅱ型脂肪酸合成途径(FAS Ⅱ)概述 | 第16-19页 |
1.1.2 Ⅱ型脂肪酸合成途径(FAS Ⅱ)的功能酶 | 第19-21页 |
1.1.3 Ⅱ型脂肪酸合成途径(FAS Ⅱ)的产物及其功能 | 第21-23页 |
1.2 支链脂肪酸的合成途径 | 第23-24页 |
1.3 不饱和脂肪酸的合成途径 | 第24-27页 |
1.3.1 不饱和脂肪酸的无氧合成途径 | 第24-25页 |
1.3.2 不饱和脂肪酸的有氧合成途径 | 第25-27页 |
1.3.3 多不饱和脂肪酸的合成途径 | 第27页 |
1.4 细菌脂肪酸合成的调控 | 第27-32页 |
1.4.1 细菌脂肪酸合成的调控蛋白 | 第28页 |
1.4.2 E.coli中FadR调控脂肪酸的合成和降解 | 第28-30页 |
1.4.3 E.coli中FabR调控不饱和脂肪酸的合成 | 第30-31页 |
1.4.4 P.aeruginosa中Δ9酰基去饱和酶的调控 | 第31页 |
1.4.5 革兰氏阳性菌中脂肪酸合成的调控 | 第31-32页 |
1.5 脂肪酸合成途径在S.oneidensis中的研究背景和立项依据 | 第32-34页 |
2 S.oneidensis中IPTG诱导蛋白表达和GFP报告系统的构建 | 第34-47页 |
2.1 材料与方法 | 第35-39页 |
2.1.1 供试菌株、质粒及细胞培养条件 | 第35-37页 |
2.1.2 构建IPTG诱导表达体系 | 第37-38页 |
2.1.3 构建和表达GFP融合蛋白 | 第38页 |
2.1.4 点突变 | 第38页 |
2.1.5 荧光共聚焦显微镜分析 | 第38页 |
2.1.6 蛋白表达分析 | 第38-39页 |
2.1.7 生物信息学和数据分析 | 第39页 |
2.2 结果与分析 | 第39-46页 |
2.2.1 适用于S.oneidensis研究的IPTG诱导表达体系的构建 | 第39-40页 |
2.2.2 适用于S.oneidensis研究的IPTG诱导表达体系的验证 | 第40-42页 |
2.2.3 IPTG诱导表达GFP融合蛋白体系的构建和验证 | 第42-46页 |
2.3 讨论 | 第46-47页 |
3 S.oneidensis FabR和FadR调控不饱和脂肪酸的有氧和无氧合成途径 | 第47-68页 |
3.1 材料与方法 | 第48-55页 |
3.1.1 供试菌株、质粒及细胞培养条件 | 第48-49页 |
3.1.2 突变株和回补质粒的构建 | 第49-51页 |
3.1.3 基因表达分析 | 第51-52页 |
3.1.4 脂肪酸含量和成分的测定 | 第52-53页 |
3.1.5 细菌单杂交试验 | 第53-54页 |
3.1.6 S.oneidensis FadR的表达和纯化 | 第54页 |
3.1.7 凝胶阻滞分析(Electrophoretic Mobility Shift Assay) | 第54-55页 |
3.1.8 生物信息学分析 | 第55页 |
3.2 结果与分析 | 第55-65页 |
3.2.1 S.oneidensis含有不饱和脂肪酸合成的无氧和有氧两条途径 | 第55-58页 |
3.2.2 S.oneidensis FabR和FadR调控不饱和脂肪酸合成的无氧和有氧途径 | 第58-59页 |
3.2.3 S.oneidensis中FabA或FadR的缺失显著影响细胞内脂肪酸的含量和成分 | 第59-60页 |
3.2.4 S.oneidensis中不饱和脂肪酸无氧合成途径的缺失诱导desA基因表达增加 | 第60-62页 |
3.2.6 S.oneidensis中FadR直接调控FabA但不直接调控DesA | 第62-64页 |
3.2.7 S.oneidensis的FabR直接抑制fabA和desA基因转录 | 第64-65页 |
3.3 讨论 | 第65-68页 |
4 S.oneidensis FabB功能和表达调控特征的研究 | 第68-80页 |
4.1 材料与方法 | 第69-71页 |
4.1.1 供试菌株、质粒及细胞培养条件 | 第69-70页 |
4.1.2 突变株和回补质粒的构建 | 第70页 |
4.1.3 基因表达分析 | 第70页 |
4.1.4 脂肪酸含量和成分的测定 | 第70页 |
4.1.5 细胞色素c蛋白染色实验 | 第70-71页 |
4.1.6 生物信息学分析 | 第71页 |
4.2 结果与分析 | 第71-78页 |
4.2.1 S.oneidens fabB(S03072)缺失突变株表型分析 | 第71-74页 |
4.2.2 S.oneidensis FabB过表达导致细胞死亡 | 第74-75页 |
4.2.3 FadR调控fabB的转录但FabR不调控fabB的转录 | 第75-77页 |
4.2.4 FadR对FabB表达的调控并不是通过直接调控FabA的表达而实现的 | 第77-78页 |
4.3 讨论 | 第78-80页 |
5 S.oneidensis ΔfadR表型的相关研究 | 第80-92页 |
5.1 材料和方法 | 第81-83页 |
5.1.1 供试菌株、质粒及细胞培养条件 | 第81页 |
5.1.2 突变株和质粒的构建 | 第81-82页 |
5.1.3 基因表达分析 | 第82页 |
5.1.4 脂肪酸含量和成分的测定 | 第82-83页 |
5.1.5 转座子随机插入突变及随机引物鉴定 | 第83页 |
5.1.6 生物信息学分析 | 第83页 |
5.2 结果和分析 | 第83-90页 |
5.2.1 基本培养基M1中添加油酸不能回复S.oneidensis ΔfadR的生长缺陷 | 第83-85页 |
5.2.2 M1中添加异亮氨酸能回复S.oneidensis ΔfadR的生长缺陷 | 第85-87页 |
5.2.3 利用转座子技术筛选在M1中ΔfadR生长部分回复的突变株 | 第87-90页 |
5.3 讨论 | 第90-92页 |
6 论文总结 | 第92-95页 |
6.1 主要研究结论 | 第92-93页 |
6.2 创新之处 | 第93-94页 |
6.3 不足之处及未来研究方向展望 | 第94-95页 |
参考文献 | 第95-113页 |
附件:攻读博士学位期间的主要成果 | 第113页 |