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厚垣孢普可尼亚菌线虫卵寄生相关胞外蛋白酶功能研究

摘要第4-6页
Abstracts第6-7页
第一章 文献综述第12-35页
    1.1 根结线虫概述第12-13页
        1.1.1 根结线虫的分类地位和形态第12页
        1.1.2 根结线虫的分布及危害症状第12页
        1.1.3 根结线虫的生活史第12-13页
    1.2 根结线虫的防治第13-22页
        1.2.1 化学防治第14-16页
        1.2.2 农业防治第16-17页
        1.2.3 抗线虫育种第17-20页
        1.2.4 生物防治第20-22页
    1.3 P.chlamydosporia概述第22-34页
        1.3.1 P.chlamydosporia的分类地位和变种第22页
        1.3.2 P.chlamydosporia的形态学第22-24页
        1.3.3 P.chlamydoporia的培养条件及影响因素第24-26页
        1.3.4 国内外应用P.chlamydoporia防治线虫研究进展第26-30页
        1.3.5 P. chlamydoporia生防机理研究进展第30-34页
    1.4 本研究的目的意义、背景及技术路线第34-35页
        1.4.1 研究目的意义和背景第34页
        1.4.2 技术路线第34-35页
第二章 P.chlamydosporia PC-170生防效果测定及根定殖观察第35-56页
    2.1 材料第35-36页
        2.1.1 供试材料和载体第35页
        2.1.2 供试试剂第35页
        2.1.3 引物第35-36页
        2.1.4 常用缓冲液及培养基的配制(见附录C)第36页
    2.2 方法第36-46页
        2.2.1 分子生物学操作常规技术第36-42页
        2.2.2 P.chlamydosporia PC-170变种验证第42页
        2.2.3 pKOV21-GFP载体构建策略第42页
        2.2.4 M.incognita相关操作技术第42-45页
        2.2.5 P.chlamydosporia PC-170防治M incognita大田实验第45-46页
    2.3 结果与分析第46-54页
        2.3.1 pKOV21-GFP载体构建第46-47页
        2.3.2 pKOV21-GFP测序结果第47页
        2.3.3 P.chlamydosporia PC-170变种的确认第47-48页
        2.3.4 PC-170gfp菌株的获得第48-50页
        2.3.5 P.chlamydosporia PC-170卵寄生率的测定第50页
        2.3.6 P.chlamydosporia PC-170防治M incognita盆栽实验第50-51页
        2.3.7 P.chlamydosporia PC-170黄瓜根部定殖实验第51页
        2.3.8 根结及M incognita卵块中P.chlamydosporia的分离第51-53页
        2.3.9 P.chlamydosporia PC-170防治M incognita大田实验第53-54页
    2.4 讨论第54-56页
第三章 P.chlamydosporia PC-170基因组及转录组分析第56-72页
    3.1 材料第56-57页
        3.1.1 供试菌株第56页
        3.1.2 供试试剂第56页
        3.1.3 引物第56-57页
        3.1.4 常用缓冲液及培养基的配制(见附录C)第57页
    3.2 方法第57-61页
        3.2.1 P.chlamydosporia PC-170基因组样品的制备第57页
        3.2.2 P.chlamydosporia PC-170转录组样品的制备第57-58页
        3.2.3 基因组的组装、基因集预测及功能注释第58-59页
        3.2.4 候选敲除基因的获得第59-60页
        3.2.5 转录组数据分析第60-61页
    3.3 结果与分析第61-70页
        3.3.1 P.chalmydosporia PC-170基因组样品的制备第61页
        3.3.2 P.chalmydosporia PC-170转录组样品的制备第61页
        3.3.3 P.chalmydosporia PC-170基因组数据分析第61-63页
        3.3.4 候选敲除基因的获得第63-65页
        3.3.5 转录组数据分析第65-70页
    3.4 讨论第70-72页
第四章 P.chlamydosporia基因敲除体系的建立第72-89页
    4.1 材料第72-74页
        4.1.1 供试菌株第72页
        4.1.2 供试试剂第72页
        4.1.3 引物第72-74页
        4.1.4 常用缓冲液及培养基的配制(见附录C)第74页
        4.1.5 抗生素配制方法及使用浓度(见附录D)第74页
    4.2 方法第74-80页
        4.2.1 分子生物学操作常规技术第74-77页
        4.2.2 融合PCR及同源基因敲除策略第77-78页
        4.2.3 PC-170对不同抑制剂的抗性浓度测定第78-79页
        4.2.4 同源敲除突变体的PCR鉴定第79页
        4.2.5 突变体单孢分离,遗传稳定性及Southern杂交分析第79-80页
        4.2.6 突变体与野生型生长速度测定第80页
        4.2.7 突变体与野生型卵寄生率测定第80页
    4.3 结果与分析第80-87页
        4.3.1 基于融合PCR的Split-marker的构建第80-81页
        4.3.2 最适筛选抗生素的筛选第81-82页
        4.3.3 PEG介导的原生质体转化第82-83页
        4.3.4 突变体的筛选第83-86页
        4.3.5 突变体与野生型生长速度测定第86页
        4.3.6 突变体与野生型卵寄生率测定第86-87页
    4.4 讨论第87-89页
第五章 丝氨酸蛋白酶基因家族的功能探究第89-103页
    5.1 材料第89-92页
        5.1.1 供试菌株第89页
        5.1.2 供试试剂第89页
        5.1.3 引物第89-92页
        5.1.4 常用缓冲液及培养基的配制(见附录C)第92页
    5.2 方法第92-94页
        5.2.1 分子生物学操作常规技术第92页
        5.2.2 融合PCR及同源基因敲除策略(见P66)第92页
        5.2.3 同源敲除突变体的PCR鉴定(见P68)第92页
        5.2.4 突变体单孢分离,遗传稳定性及Southern杂交分析(见P68)第92页
        5.2.5 突变体与野生型生长速度测定(见P69)第92页
        5.2.6 突变体与野生型卵寄生率测定(见P32)第92页
        5.2.7 丝氨酸蛋白酶基因家族的获得第92-93页
        5.2.8 P.chlamydosporia PC-170蛋白酶分析第93-94页
    5.3 结果与分析第94-100页
        5.3.1 丝氨酸蛋白酶基因家族的获得第94页
        5.3.2 突变体的筛选第94-95页
        5.3.3 突变体与野生型生长速度测定第95页
        5.3.4 突变体与野生型卵寄生率测定第95-96页
        5.3.5 P.chlamydospora PC-170蛋白酶分析第96-100页
    5.4 讨论第100-103页
第六章 结论和创新点第103-105页
    6.1 结论第103-104页
    6.2 创新点第104-105页
参考文献第105-119页
附录A 本论文所用重要缩写词及中文对照第119-122页
附录B 常用化学试剂、分子生物学试剂及仪器第122-124页
附录C 常用缓冲液及培养基的配制第124-128页
附录D 抗生素配制方法及使用浓度第128-129页
致谢第129-130页
个人简历第130-131页

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